35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1851 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1851  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  400  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2007  protein of unknown function DUF1113  42.46 
 
 		 239 aa  142  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000472326  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0197  protein of unknown function DUF1113  45.14 
 
 		 271 aa  138  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1398  hypothetical protein  38.41 
 
 		 258 aa  131  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000163378  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1800  hypothetical protein  39.88 
 
 		 260 aa  128  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1210  hypothetical protein  45.6 
 
 		 258 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000120953  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1577  protein of unknown function DUF1113  41.36 
 
 		 258 aa  123  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000270408  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0483  hypothetical protein  41.61 
 
 		 266 aa  120  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00123635  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1643  hypothetical protein  36.31 
 
 		 235 aa  118  4.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1797  protein of unknown function DUF1113  34.48 
 
 		 274 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00189762  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2308  protein of unknown function DUF1113  39.1 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1527  permease  41.91 
 
 		 262 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0030296  normal  0.070351 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1813  hypothetical protein  30.18 
 
 		 259 aa  108  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.406185  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1052  hypothetical protein  39.33 
 
 		 333 aa  104  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000029525  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2883  metal dependent phosphohydrolase  33.13 
 
 		 342 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0803  hypothetical protein  36.21 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3089  hypothetical protein  37.42 
 
 		 165 aa  103  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614465  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0636  protein of unknown function DUF1113  38.04 
 
 		 275 aa  102  4e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.405104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1548  hypothetical protein  30.69 
 
 		 240 aa  100  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000391907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22430  predicted membrane protein  34.71 
 
 		 297 aa  99  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0966  metal dependent phosphohydrolase  36.03 
 
 		 342 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.058777  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1696  protein of unknown function DUF1113  38.46 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.176656  normal  0.89414 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0411  hypothetical protein  26.01 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10080  predicted membrane protein  25.91 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00521353  hitchhiker  0.00000136128 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02570  predicted membrane protein  28.22 
 
 		 406 aa  68.6  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.287221 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1245  hypothetical protein  28.75 
 
 		 428 aa  68.9  0.00000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0415  hypothetical protein  24.86 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1156  protein of unknown function DUF1113  25.41 
 
 		 403 aa  65.5  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.703838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1560  protein of unknown function DUF1113  27.22 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.150594  normal  0.0147317 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0914  protein of unknown function DUF1113  28.08 
 
 		 312 aa  55.5  0.0000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.592776 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3201  hypothetical protein  34.48 
 
 		 143 aa  54.3  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1506  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 340 aa  50.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1444  hypothetical protein  24.03 
 
 		 367 aa  47.4  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.06251  normal  0.227287 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3715  hypothetical protein  36.21 
 
 		 146 aa  47.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192198  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05240  hypothetical protein  26.87 
 
 		 136 aa  41.6  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>