33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2308 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2308  protein of unknown function DUF1113  100 
 
 
206 aa  407  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2007  protein of unknown function DUF1113  36.36 
 
 
239 aa  109  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000472326  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0197  protein of unknown function DUF1113  36.03 
 
 
271 aa  106  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3089  hypothetical protein  37.11 
 
 
165 aa  106  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614465  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1851  hypothetical protein  38.46 
 
 
197 aa  101  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0483  hypothetical protein  40.15 
 
 
266 aa  99  5e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00123635  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1577  protein of unknown function DUF1113  38.89 
 
 
258 aa  95.9  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000270408  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1398  hypothetical protein  40.83 
 
 
258 aa  95.9  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000163378  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0636  protein of unknown function DUF1113  35.51 
 
 
275 aa  95.5  4e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.405104  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1800  hypothetical protein  40.16 
 
 
260 aa  95.1  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1527  permease  32.95 
 
 
262 aa  95.1  7e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0030296  normal  0.070351 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1643  hypothetical protein  37.98 
 
 
235 aa  94.4  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1797  protein of unknown function DUF1113  37.31 
 
 
274 aa  93.6  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00189762  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1210  hypothetical protein  38.33 
 
 
258 aa  92.4  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000120953  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1052  hypothetical protein  35.71 
 
 
333 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000029525  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22430  predicted membrane protein  32.12 
 
 
297 aa  84.3  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0803  hypothetical protein  28.29 
 
 
255 aa  81.3  0.000000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1813  hypothetical protein  25.67 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.406185  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1548  hypothetical protein  26.88 
 
 
240 aa  75.1  0.0000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000391907  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2883  metal dependent phosphohydrolase  32.06 
 
 
342 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0966  metal dependent phosphohydrolase  31.33 
 
 
342 aa  68.9  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.058777  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1245  hypothetical protein  26.83 
 
 
428 aa  66.6  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10080  predicted membrane protein  24.54 
 
 
387 aa  61.6  0.000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00521353  hitchhiker  0.00000136128 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0411  hypothetical protein  27.65 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1444  hypothetical protein  24.18 
 
 
367 aa  53.9  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.06251  normal  0.227287 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02570  predicted membrane protein  25.15 
 
 
406 aa  53.1  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.287221 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1696  protein of unknown function DUF1113  24.16 
 
 
386 aa  52  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.176656  normal  0.89414 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1560  protein of unknown function DUF1113  26.56 
 
 
271 aa  52  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.150594  normal  0.0147317 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0415  hypothetical protein  24.1 
 
 
212 aa  51.6  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1156  protein of unknown function DUF1113  25 
 
 
403 aa  51.6  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.703838  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3715  hypothetical protein  39.22 
 
 
146 aa  46.6  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192198  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0914  protein of unknown function DUF1113  23.31 
 
 
312 aa  45.4  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.592776 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3201  hypothetical protein  31.13 
 
 
143 aa  44.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>