33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2007 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2007  protein of unknown function DUF1113  100 
 
 
239 aa  481  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000472326  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1800  hypothetical protein  33.19 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1851  hypothetical protein  42.46 
 
 
197 aa  131  9e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0197  protein of unknown function DUF1113  36.05 
 
 
271 aa  124  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1577  protein of unknown function DUF1113  32.07 
 
 
258 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000270408  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1398  hypothetical protein  36.42 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000163378  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1527  permease  40.67 
 
 
262 aa  111  9e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0030296  normal  0.070351 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1210  hypothetical protein  39.26 
 
 
258 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000120953  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1052  hypothetical protein  34.62 
 
 
333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000029525  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1797  protein of unknown function DUF1113  32.57 
 
 
274 aa  109  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00189762  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2308  protein of unknown function DUF1113  36.36 
 
 
206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2883  metal dependent phosphohydrolase  36.21 
 
 
342 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0483  hypothetical protein  37.14 
 
 
266 aa  106  3e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00123635  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3089  hypothetical protein  38.51 
 
 
165 aa  102  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614465  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22430  predicted membrane protein  36.42 
 
 
297 aa  100  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1643  hypothetical protein  31.38 
 
 
235 aa  100  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0803  hypothetical protein  32.95 
 
 
255 aa  98.6  8e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0636  protein of unknown function DUF1113  34.48 
 
 
275 aa  96.7  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.405104  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1548  hypothetical protein  27.39 
 
 
240 aa  94.7  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000391907  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1813  hypothetical protein  33.13 
 
 
259 aa  92.4  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.406185  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0966  metal dependent phosphohydrolase  34.62 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.058777  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10080  predicted membrane protein  31.07 
 
 
387 aa  75.9  0.0000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00521353  hitchhiker  0.00000136128 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1245  hypothetical protein  29.17 
 
 
428 aa  70.9  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1560  protein of unknown function DUF1113  28.47 
 
 
271 aa  65.1  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.150594  normal  0.0147317 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1696  protein of unknown function DUF1113  27.12 
 
 
386 aa  62.8  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.176656  normal  0.89414 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1156  protein of unknown function DUF1113  30.23 
 
 
403 aa  62  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.703838  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0415  hypothetical protein  27.01 
 
 
212 aa  57.8  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0411  hypothetical protein  27.01 
 
 
212 aa  56.6  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02570  predicted membrane protein  26.44 
 
 
406 aa  55.8  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.287221 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1444  hypothetical protein  22.04 
 
 
367 aa  50.1  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.06251  normal  0.227287 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0914  protein of unknown function DUF1113  25.84 
 
 
312 aa  47.8  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.592776 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3715  hypothetical protein  38.78 
 
 
146 aa  42  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192198  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3201  hypothetical protein  35.42 
 
 
143 aa  42  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>