29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_10080 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_10080  predicted membrane protein  100 
 
 		 387 aa  787    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00521353  hitchhiker  0.00000136128 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1156  protein of unknown function DUF1113  43.3 
 
 		 403 aa  285  7e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.703838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02570  predicted membrane protein  44.61 
 
 		 406 aa  278  2e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.287221 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1696  protein of unknown function DUF1113  46.83 
 
 		 386 aa  259  4e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.176656  normal  0.89414 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1245  hypothetical protein  39.7 
 
 		 428 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1560  protein of unknown function DUF1113  45.02 
 
 		 271 aa  196  7e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.150594  normal  0.0147317 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0914  protein of unknown function DUF1113  30.09 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.592776 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0411  hypothetical protein  31.37 
 
 		 212 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0415  hypothetical protein  30.54 
 
 		 212 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1797  protein of unknown function DUF1113  28.64 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00189762  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1548  hypothetical protein  27.83 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000391907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3089  hypothetical protein  32.72 
 
 		 165 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614465  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2007  protein of unknown function DUF1113  31.07 
 
 		 239 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000472326  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22430  predicted membrane protein  31.13 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1398  hypothetical protein  29.14 
 
 		 258 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000163378  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0483  hypothetical protein  31.45 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00123635  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1210  hypothetical protein  30 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000120953  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0636  protein of unknown function DUF1113  29.79 
 
 		 275 aa  67  0.0000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.405104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1052  hypothetical protein  32 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000029525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0197  protein of unknown function DUF1113  30.25 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1851  hypothetical protein  25.91 
 
 		 197 aa  65.1  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1813  hypothetical protein  29.48 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.406185  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2308  protein of unknown function DUF1113  24.54 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0803  hypothetical protein  31.61 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1577  protein of unknown function DUF1113  25 
 
 		 258 aa  57  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000270408  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1643  hypothetical protein  29.93 
 
 		 235 aa  56.2  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1527  permease  28.19 
 
 		 262 aa  55.5  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0030296  normal  0.070351 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1800  hypothetical protein  24.24 
 
 		 260 aa  55.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2883  metal dependent phosphohydrolase  22.75 
 
 		 342 aa  44.3  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>