150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2237 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2237  galactokinase  100 
 
 		 415 aa  857    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0388  Galactokinase  38.31 
 
 		 427 aa  276  6e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3653  galactokinase  34.19 
 
 		 434 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1201  Galactokinase  32.45 
 
 		 410 aa  215  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0819  Galactokinase  33.51 
 
 		 403 aa  206  7e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.847114  normal  0.0773074 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06460  galactokinase  33.51 
 
 		 439 aa  198  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  28.45 
 
 		 387 aa  130  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  28.8 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  29.28 
 
 		 386 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  28.69 
 
 		 387 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  28.72 
 
 		 392 aa  125  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  28.9 
 
 		 386 aa  124  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  25.34 
 
 		 387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  28.76 
 
 		 385 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  26.42 
 
 		 392 aa  116  8.999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  26.35 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  28.73 
 
 		 409 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  27.86 
 
 		 390 aa  113  6e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  29.38 
 
 		 387 aa  112  8.000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  27.05 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  24.69 
 
 		 397 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  26.87 
 
 		 385 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  27.22 
 
 		 386 aa  110  5e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  25.63 
 
 		 387 aa  110  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  25.38 
 
 		 393 aa  110  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  28.31 
 
 		 388 aa  110  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  27.12 
 
 		 388 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  27 
 
 		 405 aa  109  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2244  galactokinase  29.67 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1322  galactokinase  28.65 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  27.45 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  26.9 
 
 		 412 aa  108  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  29.22 
 
 		 399 aa  107  5e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  27.2 
 
 		 386 aa  106  7e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  26.06 
 
 		 389 aa  106  8e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  26.55 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  25.21 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  27.5 
 
 		 349 aa  103  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  24.94 
 
 		 383 aa  103  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  26.63 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  27.65 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0657  galactokinase  27.15 
 
 		 387 aa  102  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  27.91 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  23.75 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1069  galactokinase  27.37 
 
 		 396 aa  100  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  25.34 
 
 		 384 aa  101  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  26.39 
 
 		 382 aa  99.8  8e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  25.76 
 
 		 359 aa  99.8  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  26.16 
 
 		 398 aa  99.8  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  25.63 
 
 		 382 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  25.91 
 
 		 382 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  27.08 
 
 		 387 aa  98.6  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  26.46 
 
 		 382 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  25.63 
 
 		 382 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  25.56 
 
 		 382 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  25.63 
 
 		 382 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  26.46 
 
 		 382 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  26.46 
 
 		 382 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  26.46 
 
 		 382 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  26.46 
 
 		 382 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  26.02 
 
 		 379 aa  97.4  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  25.98 
 
 		 382 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0883  galactokinase  26.45 
 
 		 394 aa  97.1  6e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  27.84 
 
 		 386 aa  95.5  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  25.34 
 
 		 382 aa  95.9  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  24.44 
 
 		 372 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  26.37 
 
 		 383 aa  94.7  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  25.82 
 
 		 380 aa  94.4  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  26.16 
 
 		 394 aa  94  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  25.99 
 
 		 383 aa  93.6  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  25.99 
 
 		 383 aa  93.6  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  25.99 
 
 		 383 aa  93.6  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  28.53 
 
 		 394 aa  93.2  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  26.65 
 
 		 389 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  25.41 
 
 		 391 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  25.48 
 
 		 404 aa  91.3  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4056  galactokinase  23.31 
 
 		 403 aa  91.3  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37616  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  25.55 
 
 		 385 aa  91.3  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0502  galactokinase  26.63 
 
 		 384 aa  90.9  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.592539  normal  0.852074 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  26.4 
 
 		 383 aa  90.5  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1371  galactokinase  26.54 
 
 		 388 aa  90.1  6e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0414  galactokinase  24.5 
 
 		 381 aa  89.4  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  24.72 
 
 		 358 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  24.91 
 
 		 373 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7279  galactokinase  26.07 
 
 		 418 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  23.06 
 
 		 396 aa  87.8  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  24.54 
 
 		 349 aa  87  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0536  galactokinase  24.28 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0132306 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  24.07 
 
 		 403 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  24.86 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3973  galactokinase  23.48 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.340727 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  23.03 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3408  galactokinase  24.23 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0758  galactokinase  24.3 
 
 		 429 aa  83.2  0.000000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.558541  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  24.6 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  23.85 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0544  galactokinase  23.78 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.225468 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3578  galactokinase  28.57 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  23.82 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  25.98 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>