More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1260 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  100 
 
 		 256 aa  520  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  55.95 
 
 		 254 aa  286  2e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2495  ABC transporter related protein  57.89 
 
 		 271 aa  274  8e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.503368  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  54.18 
 
 		 265 aa  274  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  53.78 
 
 		 264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  54.22 
 
 		 271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  51.82 
 
 		 256 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  52.61 
 
 		 271 aa  269  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  52.36 
 
 		 270 aa  266  2.9999999999999995e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  52.19 
 
 		 259 aa  264  1e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  52.59 
 
 		 257 aa  264  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  52.19 
 
 		 257 aa  263  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  51 
 
 		 255 aa  262  4e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.39 
 
 		 256 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  49.6 
 
 		 255 aa  262  4.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  53.44 
 
 		 268 aa  261  6e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  50.61 
 
 		 258 aa  261  6.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  51.82 
 
 		 276 aa  261  8.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  49.4 
 
 		 255 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.79 
 
 		 254 aa  260  1e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  51.61 
 
 		 256 aa  260  1e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  51.6 
 
 		 265 aa  261  1e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  51 
 
 		 270 aa  260  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  51 
 
 		 270 aa  260  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  51.79 
 
 		 255 aa  260  1e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  51.78 
 
 		 255 aa  259  2e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  49.01 
 
 		 262 aa  258  4e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  49.8 
 
 		 255 aa  258  6e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  50.61 
 
 		 252 aa  258  6e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  51 
 
 		 270 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  50.2 
 
 		 275 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  52.21 
 
 		 259 aa  255  4e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  50.2 
 
 		 275 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  50.2 
 
 		 275 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0402  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.61 
 
 		 254 aa  255  5e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.869027  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  49.8 
 
 		 283 aa  255  6e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  44.64 
 
 		 307 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1894  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  53.69 
 
 		 286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0274473  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.2 
 
 		 256 aa  253  3e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  48.83 
 
 		 261 aa  253  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  50 
 
 		 259 aa  252  3e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  51.6 
 
 		 258 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  49.39 
 
 		 333 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  49.39 
 
 		 293 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  48.18 
 
 		 334 aa  252  5.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2438  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.01 
 
 		 257 aa  251  6e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.01 
 
 		 258 aa  251  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  51.01 
 
 		 258 aa  251  6e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  51.01 
 
 		 258 aa  251  6e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  44.98 
 
 		 302 aa  251  6e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  48.8 
 
 		 255 aa  251  6e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  49.41 
 
 		 261 aa  251  7e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  51.39 
 
 		 259 aa  251  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  51.82 
 
 		 261 aa  250  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  49.2 
 
 		 263 aa  250  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  53.23 
 
 		 260 aa  250  1e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  50.61 
 
 		 258 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  50.61 
 
 		 258 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  50.61 
 
 		 258 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0463  ABC transporter related protein  49.8 
 
 		 252 aa  249  4e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  49.2 
 
 		 258 aa  248  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6114  ABC transporter related  51.42 
 
 		 257 aa  248  7e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4413  ABC transporter related  49.19 
 
 		 271 aa  248  8e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  49.8 
 
 		 258 aa  247  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1145  leucine/isoleucine/valine transport system ATP-binding protein  51.42 
 
 		 257 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00253052  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0787  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.42 
 
 		 257 aa  246  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0985  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.42 
 
 		 257 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000122559  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0883  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.42 
 
 		 257 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130344  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  49.39 
 
 		 255 aa  246  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0942  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.42 
 
 		 257 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00114272  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0991  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.42 
 
 		 257 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0265  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.42 
 
 		 257 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000223083  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  48.58 
 
 		 260 aa  246  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  47.76 
 
 		 284 aa  246  3e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0613  ABC transporter related  49.2 
 
 		 259 aa  246  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2413  ABC transporter related  51.01 
 
 		 258 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0344655 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2542  ABC transporter related  51.01 
 
 		 258 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812662  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3932  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.6 
 
 		 255 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  46.61 
 
 		 255 aa  245  4e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2499  ABC transporter related  52.59 
 
 		 264 aa  245  4e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.513432  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  49.8 
 
 		 258 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  50.2 
 
 		 280 aa  245  4.9999999999999997e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3752  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.6 
 
 		 255 aa  245  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3830  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.6 
 
 		 255 aa  245  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3763  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.6 
 
 		 255 aa  245  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3873  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.6 
 
 		 255 aa  245  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0456254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  50 
 
 		 258 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3256  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  47.98 
 
 		 255 aa  244  8e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal  0.0874326 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  48.39 
 
 		 257 aa  244  9e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4334  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  47.98 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231493  normal  0.133886 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2609  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  47.98 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223215  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  48.21 
 
 		 252 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  48.62 
 
 		 270 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  50 
 
 		 288 aa  243  1.9999999999999999e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  47.94 
 
 		 284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  46.56 
 
 		 256 aa  243  3e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  49 
 
 		 261 aa  243  3e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2316  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.19 
 
 		 261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0483  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  48.02 
 
 		 261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1068  ABC transporter related  48.8 
 
 		 273 aa  242  5e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>