241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2313 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1436  magnesium chelatase, H subunit  34.93 
 
 
1273 aa  691    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.958872  normal  0.470699 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13265  protoporphyrin IX magnesium chelatase, subunit H  38.87 
 
 
1343 aa  899    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4814  magnesium chelatase subunit H  39.88 
 
 
1238 aa  864    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0476197 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0380  magnesium chelatase subunit H  37.94 
 
 
1337 aa  872    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.582588  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2767  magnesium chelatase, H subunit  34.09 
 
 
1251 aa  654    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45384  predicted protein  40.17 
 
 
1336 aa  897    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00403917  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2154  magnesium chelatase, H subunit  34.3 
 
 
1267 aa  684    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1542  magnesium chelatase subunit H  51.42 
 
 
1283 aa  1338    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0156195 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3311  magnesium chelatase subunit H  39.17 
 
 
1328 aa  915    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0712656  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1048  magnesium chelatase, H subunit  34.91 
 
 
1273 aa  692    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.115422 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4320  magnesium chelatase subunit H  37.42 
 
 
1330 aa  870    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0253  magnesium chelatase subunit H  68.67 
 
 
1296 aa  1810    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0255  magnesium-chelatase, subunit H  33.88 
 
 
1267 aa  674    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.409293  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0787  magnesium-chelatase, subunit H  34.89 
 
 
1275 aa  679    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0827  magnesium chelatase subunit H  37.56 
 
 
1336 aa  843    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.458229  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0227  magnesium-chelatase, subunit H  34.46 
 
 
1266 aa  674    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0983  magnesium-chelatase, subunit H  35.03 
 
 
1274 aa  692    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.13012  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1794  magnesium chelatase, H subunit  33.86 
 
 
1280 aa  667    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1828  magnesium chelatase subunit H  38.25 
 
 
1341 aa  872    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0969  magnesium chelatase subunit H  38.14 
 
 
1336 aa  875    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.72358  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2137  magnesium chelatase subunit H  37.72 
 
 
1328 aa  880    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.67414  normal  0.220036 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1846  magnesium chelatase subunit H  39.63 
 
 
1234 aa  902    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.329456  normal  0.0615578 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3979  magnesium chelatase subunit H  41.14 
 
 
1248 aa  917    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426085  normal  0.16908 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1436  magnesium chelatase subunit H  38.03 
 
 
1333 aa  895    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2207  magnesium chelatase subunit H  63.79 
 
 
1277 aa  1728    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1315  magnesium chelatase subunit H  40.17 
 
 
1247 aa  919    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.285643 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5359  magnesium chelatase subunit H  38.71 
 
 
1241 aa  832    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.877456  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1286  magnesium chelatase subunit H  50.16 
 
 
1245 aa  1264    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0239  magnesium chelatase, H subunit  36.65 
 
 
1269 aa  722    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.940988  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1969  magnesium chelatase, H subunit  34.15 
 
 
1268 aa  682    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.291202  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10391  magnesium chelatase subunit H  37.92 
 
 
1336 aa  879    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1904  magnesium chelatase subunit H  51.58 
 
 
1300 aa  1349    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.886587  hitchhiker  0.00767662 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3224  magnesium chelatase subunit H  38.85 
 
 
1329 aa  905    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.335688  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1974  magnesium chelatase subunit H  66.04 
 
 
1277 aa  1794    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.44138  normal  0.650395 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2581  magnesium chelatase, H subunit  33.8 
 
 
1267 aa  671    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0542  magnesium chelatase subunit H  38.14 
 
 
1329 aa  883    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4981  magnesium chelatase subunit H  38.93 
 
 
1330 aa  919    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2205  magnesium chelatase, H subunit  33.54 
 
 
1269 aa  662    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1629  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  34.31 
 
 
1217 aa  665    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.12065  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2311  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.08 
 
 
1267 aa  663    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0576549  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2313  magnesium chelatase subunit H  100 
 
 
1280 aa  2655    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.227172  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09361  magnesium chelatase subunit H  38.6 
 
 
1339 aa  890    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360332 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2525  magnesium chelatase, H subunit  34.79 
 
 
1250 aa  663    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0401032  normal  0.169261 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1635  magnesium chelatase subunit H  39.8 
 
 
1249 aa  913    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.28996  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0575  magnesium chelatase subunit H  50.89 
 
 
1261 aa  1313    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.486598  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10391  magnesium chelatase subunit H  37.84 
 
 
1336 aa  877    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09061  magnesium chelatase subunit H  38.09 
 
 
1335 aa  884    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2156  magnesium chelatase subunit H  73.18 
 
 
1277 aa  1985    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.992629  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10621  magnesium chelatase subunit H  38.04 
 
 
1337 aa  871    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13931  magnesium chelatase subunit H  37.43 
 
 
1347 aa  836    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0983258 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4382  magnesium chelatase subunit H  37.42 
 
 
1330 aa  870    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0354269  unclonable  0.0000000162582 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2583  magnesium chelatase subunit H  74.33 
 
 
1276 aa  1985    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_56602  predicted protein  30.16 
 
 
1479 aa  573  1.0000000000000001e-162  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678567  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0228  cobaltochelatase  31.47 
 
 
1187 aa  569  1e-161  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0376  cobaltochelatase  31.14 
 
 
1187 aa  566  1e-160  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0314903  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0866  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  30.3 
 
 
1248 aa  553  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.587093  normal  0.384774 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4121  magnesium chelatase, H subunit  31.41 
 
 
1246 aa  544  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4082  magnesium chelatase, H subunit  31.11 
 
 
1246 aa  542  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4108  magnesium chelatase, H subunit  30.6 
 
 
1236 aa  538  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6415  magnesium chelatase subunit H  40.96 
 
 
1197 aa  533  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0835  cobaltochelatase  32.03 
 
 
1242 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0483092  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3099  cobaltochelatase  28.98 
 
 
1243 aa  516  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.723092 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3734  magnesium chelatase subunit H  38.89 
 
 
1248 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0107251 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  31.35 
 
 
1244 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2040  magnesium chelatase subunit H  38.35 
 
 
1249 aa  504  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328237 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  32.14 
 
 
1237 aa  501  1e-140  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1732  magnesium chelatase subunit H  35.98 
 
 
1248 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3536  magnesium chelatase subunit H  37.66 
 
 
1194 aa  498  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0159  magnesium chelatase subunit H  38.45 
 
 
1173 aa  497  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.971256  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1008  magnesium chelatase subunit H  38.1 
 
 
1193 aa  499  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.256622 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1219  cobaltochelatase  31.21 
 
 
1285 aa  496  9.999999999999999e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0742888  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1859  Cobaltochelatase  30.21 
 
 
1302 aa  495  9.999999999999999e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.243773 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1167  cobaltochelatase subunit CobN  31.47 
 
 
1288 aa  491  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1646  Cobaltochelatase  31.18 
 
 
1293 aa  491  1e-137  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.45922  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1059  cobaltochelatase, CobN subunit  31.77 
 
 
1435 aa  488  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0287  magnesium chelatase subunit H  36.55 
 
 
1193 aa  488  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3720  magnesium chelatase subunit H  38.93 
 
 
1244 aa  489  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.683801  hitchhiker  0.00437109 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  30.84 
 
 
1263 aa  487  1e-136  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1930  magnesium chelatase subunit H  36.55 
 
 
1193 aa  488  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.358411 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1771  cobaltochelatase subunit CobN  29.31 
 
 
1343 aa  483  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163457  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1598  cobaltochelatase subunit CobN  30.18 
 
 
1266 aa  483  1e-135  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.977865  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1259  cobaltochelatase  30.01 
 
 
1256 aa  484  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5367  cobaltochelatase, CobN subunit  30.04 
 
 
1426 aa  486  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5281  magnesium chelatase subunit H  38.43 
 
 
1238 aa  485  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.234603  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  29.56 
 
 
1220 aa  483  1e-135  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3301  cobaltochelatase, CobN subunit  29.43 
 
 
1247 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2082  cobaltochelatase  30.57 
 
 
1297 aa  480  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0621  magnesium chelatase subunit H  36.88 
 
 
1242 aa  477  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0562  cobaltochelatase subunit CobN  30.46 
 
 
1290 aa  479  1e-133  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2352  cobaltochelatase, CobN subunit  31.52 
 
 
1444 aa  478  1e-133  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.113617  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1005  Cobaltochelatase  30.32 
 
 
1298 aa  479  1e-133  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  31.4 
 
 
1259 aa  474  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2815  cobaltochelatase, CobN subunit  29.18 
 
 
1247 aa  476  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.265823 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0126  cobaltochelatase  28.85 
 
 
1291 aa  474  1e-132  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.48483  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17590  cobaltochelatase subunit CobN  30.76 
 
 
1199 aa  473  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0558  cobaltochelatase, CobN subunit  30.21 
 
 
1453 aa  472  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  31.21 
 
 
1406 aa  467  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3112  cobaltochelatase subunit CobN  31.08 
 
 
1213 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1210  cobaltochelatase  32.74 
 
 
1210 aa  468  9.999999999999999e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  31.18 
 
 
1205 aa  469  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>