More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0576 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0701  DNA repair protein RecN  61.95 
 
 		 567 aa  698    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0576  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 568 aa  1137    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0623  DNA repair protein RecN  57.39 
 
 		 568 aa  623  1e-177  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.72171  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  55.54 
 
 		 574 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  53.71 
 
 		 569 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0537  DNA repair protein RecN  52.82 
 
 		 568 aa  528  1e-148  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.674533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1612  DNA repair protein RecN  48.62 
 
 		 573 aa  503  1e-141  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.458504 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  42.33 
 
 		 578 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  39.75 
 
 		 577 aa  374  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  37.95 
 
 		 572 aa  340  4e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  35.48 
 
 		 554 aa  330  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  36.36 
 
 		 566 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  35.59 
 
 		 558 aa  323  5e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  38.55 
 
 		 574 aa  323  5e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  32.99 
 
 		 574 aa  322  9.999999999999999e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  36.28 
 
 		 564 aa  318  1e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  33.86 
 
 		 579 aa  317  3e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  33.86 
 
 		 579 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  33.68 
 
 		 579 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  37.32 
 
 		 553 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  37.32 
 
 		 553 aa  315  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  37.32 
 
 		 553 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  34.73 
 
 		 555 aa  314  1.9999999999999998e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  33.68 
 
 		 579 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  33.68 
 
 		 579 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  33.68 
 
 		 583 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  33.68 
 
 		 579 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  34.33 
 
 		 554 aa  313  6.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  33.51 
 
 		 583 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  33.8 
 
 		 579 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  33.51 
 
 		 579 aa  312  9e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  35.04 
 
 		 553 aa  312  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  34.03 
 
 		 573 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.76 
 
 		 557 aa  311  2e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  34.28 
 
 		 553 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  33.98 
 
 		 573 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  34.39 
 
 		 579 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  34.97 
 
 		 553 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  34.56 
 
 		 567 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  35.33 
 
 		 567 aa  303  5.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 		 572 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  33.91 
 
 		 570 aa  303  6.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  33.68 
 
 		 560 aa  303  7.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  34.55 
 
 		 556 aa  303  7.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  33.69 
 
 		 559 aa  302  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  33.69 
 
 		 559 aa  302  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  34.51 
 
 		 553 aa  301  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  34.87 
 
 		 553 aa  300  3e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  32.87 
 
 		 560 aa  300  4e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3686  recombination and repair protein  34.28 
 
 		 553 aa  300  5e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00128842  normal  0.127979 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  34.78 
 
 		 565 aa  298  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  32.61 
 
 		 589 aa  296  5e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  32.92 
 
 		 556 aa  296  8e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  34.72 
 
 		 552 aa  295  1e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  33.57 
 
 		 556 aa  295  1e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  33.21 
 
 		 555 aa  293  6e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  33.91 
 
 		 561 aa  292  1e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  35.09 
 
 		 558 aa  292  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  32.81 
 
 		 588 aa  291  2e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3602  DNA repair protein RecN  32.28 
 
 		 557 aa  291  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  33.62 
 
 		 557 aa  290  4e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1139  DNA repair protein RecN  34.56 
 
 		 555 aa  289  8e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  33.86 
 
 		 557 aa  289  1e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  32.69 
 
 		 559 aa  289  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  33.51 
 
 		 558 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  33.16 
 
 		 580 aa  288  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  34.94 
 
 		 565 aa  288  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1303  DNA repair protein RecN  33.86 
 
 		 557 aa  288  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.523963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  34.5 
 
 		 557 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  33.16 
 
 		 554 aa  286  5e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3359  recombination and repair protein  34.74 
 
 		 553 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0341558 
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  33.1 
 
 		 588 aa  286  7e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  31.75 
 
 		 568 aa  286  9e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  34.53 
 
 		 562 aa  286  9e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  34.21 
 
 		 552 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  34.79 
 
 		 553 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  33.62 
 
 		 553 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  33.04 
 
 		 552 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  34.43 
 
 		 552 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  34.62 
 
 		 553 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  34.15 
 
 		 557 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  34.62 
 
 		 553 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  32.76 
 
 		 588 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  34.62 
 
 		 553 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  33.8 
 
 		 553 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  32.03 
 
 		 554 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  35.61 
 
 		 553 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  33.28 
 
 		 558 aa  284  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0907  DNA repair protein RecN  32.21 
 
 		 549 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933799  normal  0.849345 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  31.09 
 
 		 565 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  33.75 
 
 		 558 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  31.58 
 
 		 568 aa  283  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  34.62 
 
 		 553 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3825  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 		 561 aa  283  7.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321139  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0728  recombination and repair protein  35.04 
 
 		 553 aa  283  7.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118324  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  33.45 
 
 		 553 aa  283  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  33.45 
 
 		 553 aa  283  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  34.62 
 
 		 553 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  33.45 
 
 		 553 aa  283  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  32.86 
 
 		 552 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>