166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0367 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0367  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  345  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000973153  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0298  hypothetical protein  54.86 
 
 
176 aa  184  4e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000302311  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1781  hypothetical protein  49.13 
 
 
191 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000171519  normal  0.0471019 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0396  hypothetical protein  49.71 
 
 
173 aa  171  5e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0150175  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1464  hypothetical protein  40.68 
 
 
179 aa  129  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.222123  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0365  protein of unknown function DUF150  40.94 
 
 
179 aa  120  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00296353  normal  0.904382 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0400  protein of unknown function DUF150  37.33 
 
 
180 aa  98.2  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00158996  normal  0.629594 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0034  protein of unknown function DUF150  37.86 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.186641  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1418  hypothetical protein  34.17 
 
 
162 aa  67  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710908  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1367  hypothetical protein  39.36 
 
 
220 aa  65.1  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.54901  normal  0.305959 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1324  hypothetical protein  35.78 
 
 
219 aa  64.3  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3420  hypothetical protein  29.93 
 
 
167 aa  62  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1226  hypothetical protein  28.91 
 
 
168 aa  60.5  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00744714  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  35.45 
 
 
162 aa  59.3  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  33.03 
 
 
161 aa  57.4  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1213  protein of unknown function DUF150  32.63 
 
 
170 aa  57.4  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  35.16 
 
 
159 aa  57  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  57.4  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1583  hypothetical protein  34.52 
 
 
159 aa  55.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324016  normal  0.240666 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01345  hypothetical protein  25.75 
 
 
153 aa  55.8  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0498  protein of unknown function DUF150  32.38 
 
 
157 aa  55.5  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  31.52 
 
 
165 aa  55.1  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  28.32 
 
 
151 aa  54.7  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4219  hypothetical protein  30.17 
 
 
169 aa  54.7  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000438537  normal  0.129114 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  30 
 
 
151 aa  54.7  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0651  protein of unknown function DUF150  31.96 
 
 
169 aa  54.7  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00506938  normal  0.180527 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3968  protein of unknown function DUF150  29.32 
 
 
196 aa  54.3  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  28.21 
 
 
151 aa  54.7  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  28.21 
 
 
151 aa  54.7  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  29.09 
 
 
151 aa  54.7  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1518  hypothetical protein  29.35 
 
 
170 aa  54.7  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190218  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1628  hypothetical protein  35.87 
 
 
166 aa  54.7  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14540  hypothetical protein  26.72 
 
 
179 aa  54.3  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110302  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  29.09 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  28.06 
 
 
152 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  29.09 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  28.06 
 
 
152 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  29.09 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  29.09 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1263  hypothetical protein  35.63 
 
 
155 aa  53.9  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  29.9 
 
 
152 aa  53.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1307  protein of unknown function DUF150  31.07 
 
 
160 aa  53.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.481915  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  29.91 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  34.07 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  30.85 
 
 
151 aa  52.4  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  28.57 
 
 
151 aa  52.8  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  26.67 
 
 
153 aa  52.8  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2079  hypothetical protein  29.22 
 
 
192 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.727896  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2125  hypothetical protein  29.22 
 
 
192 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0426445  normal  0.0108816 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  31.37 
 
 
151 aa  52  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2062  hypothetical protein  29.22 
 
 
192 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  29.03 
 
 
152 aa  52  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  32.22 
 
 
159 aa  52  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0139  protein of unknown function DUF150  40 
 
 
154 aa  51.6  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  30.69 
 
 
151 aa  51.6  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  25 
 
 
151 aa  51.6  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  25 
 
 
156 aa  51.6  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  31.46 
 
 
150 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  31.46 
 
 
140 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  31.46 
 
 
150 aa  51.6  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  31.46 
 
 
150 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  31.46 
 
 
150 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  31.46 
 
 
150 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  31.46 
 
 
150 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  32.86 
 
 
154 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  28.89 
 
 
153 aa  51.2  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  32.86 
 
 
154 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  29.49 
 
 
150 aa  50.8  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  29.49 
 
 
150 aa  50.8  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  29.49 
 
 
150 aa  50.8  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  28.57 
 
 
173 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  28.68 
 
 
153 aa  50.8  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2114  hypothetical protein  29.57 
 
 
166 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888786  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4492  hypothetical protein  28.57 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126815  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0723  protein of unknown function DUF150  26.37 
 
 
151 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.244111  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  32.14 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  32.05 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2430  hypothetical protein  32.71 
 
 
172 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2411  protein of unknown function DUF150  31.4 
 
 
162 aa  49.7  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  28.21 
 
 
169 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3333  protein of unknown function DUF150  29.29 
 
 
205 aa  49.3  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.295567  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3595  protein of unknown function DUF150  27.05 
 
 
160 aa  49.3  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  28.21 
 
 
169 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  28.12 
 
 
153 aa  49.3  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3062  hypothetical protein  25 
 
 
151 aa  48.9  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525096  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  30.12 
 
 
152 aa  48.5  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  30.12 
 
 
152 aa  48.9  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  27.55 
 
 
158 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  34.29 
 
 
150 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  34.29 
 
 
150 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  34.29 
 
 
150 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  32.05 
 
 
154 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  32.05 
 
 
154 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  26.85 
 
 
151 aa  48.1  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3391  hypothetical protein  29.09 
 
 
172 aa  48.5  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000810372  hitchhiker  0.000625033 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3160  hypothetical protein  30.65 
 
 
173 aa  48.1  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000242539  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2311  hypothetical protein  32.29 
 
 
176 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0442926  normal  0.0676785 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  26.85 
 
 
151 aa  48.1  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  30 
 
 
150 aa  48.1  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3193  hypothetical protein  30.34 
 
 
175 aa  47.8  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0250324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>