More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0616 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0616  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 348 aa  692    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0693  Holliday junction DNA helicase RuvB  86.73 
 
 		 344 aa  585  1e-166  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1767  Holliday junction DNA helicase RuvB  85.3 
 
 		 352 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.406751  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0569  Holliday junction DNA helicase RuvB  85.04 
 
 		 346 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1619  Holliday junction DNA helicase RuvB  82.3 
 
 		 344 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.933878 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0522  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.52 
 
 		 343 aa  517  1.0000000000000001e-145  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0587  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.02 
 
 		 338 aa  481  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736056 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0299  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.23 
 
 		 342 aa  420  1e-116  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.225929 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2652  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.66 
 
 		 340 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3690  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.9 
 
 		 341 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.212033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1251  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.18 
 
 		 355 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000492423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5229  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.24 
 
 		 342 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1642  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.31 
 
 		 340 aa  401  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000112926  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1893  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.55 
 
 		 340 aa  400  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01270  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.77 
 
 		 340 aa  395  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0373  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.51 
 
 		 342 aa  395  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1708  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.84 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.780962  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0488  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.87 
 
 		 343 aa  387  1e-106  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.16 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.16 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.98 
 
 		 356 aa  374  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.29 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.63 
 
 		 338 aa  372  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.39 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.01 
 
 		 338 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4541  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.35 
 
 		 352 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.79 
 
 		 345 aa  372  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51780  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.04 
 
 		 352 aa  371  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261912 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0629  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.32 
 
 		 339 aa  374  1e-102  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.151039 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.47 
 
 		 338 aa  372  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.05 
 
 		 354 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1128  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.45 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2353  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.45 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.1 
 
 		 338 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.05 
 
 		 363 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3407  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.45 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1247  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.01 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.46 
 
 		 344 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.05 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1848  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.14 
 
 		 350 aa  369  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9139  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0266  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.45 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3366  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.45 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.54 
 
 		 335 aa  368  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3401  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.45 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1902  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.79 
 
 		 334 aa  368  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000022467  hitchhiker  0.0000432146 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.29 
 
 		 351 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2532  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.45 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.79 
 
 		 334 aa  368  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.83 
 
 		 334 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0607  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.01 
 
 		 354 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.01 
 
 		 345 aa  367  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.14 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1584  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.63 
 
 		 356 aa  366  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0383381  normal  0.43268 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0278  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.21 
 
 		 345 aa  365  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.043434  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.11 
 
 		 336 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.48 
 
 		 336 aa  365  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.07 
 
 		 352 aa  368  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.31 
 
 		 341 aa  366  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.8 
 
 		 341 aa  368  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3774  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.01 
 
 		 356 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0418  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.1 
 
 		 351 aa  368  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.56 
 
 		 337 aa  366  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.71 
 
 		 338 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4070  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.31 
 
 		 354 aa  366  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.25 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.57 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1756  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.1 
 
 		 351 aa  368  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36690  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.28 
 
 		 352 aa  368  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.69 
 
 		 335 aa  366  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.79 
 
 		 334 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0581  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.01 
 
 		 355 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.63 
 
 		 356 aa  366  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2696  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.33 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.12 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1436  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.89 
 
 		 334 aa  366  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000380468  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1272  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.8 
 
 		 350 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197391  normal  0.338771 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.82 
 
 		 358 aa  364  1e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.25 
 
 		 334 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1095  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.69 
 
 		 334 aa  364  1e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.508014  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1025  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.69 
 
 		 334 aa  364  1e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.669152  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0205  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.69 
 
 		 356 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0655  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.69 
 
 		 356 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.24 
 
 		 354 aa  364  1e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0688  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.69 
 
 		 356 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.25 
 
 		 334 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.25 
 
 		 334 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.14 
 
 		 337 aa  363  2e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01601  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.56 
 
 		 334 aa  363  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.63 
 
 		 358 aa  363  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.84 
 
 		 334 aa  363  3e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1410  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.82 
 
 		 353 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.585511  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.28 
 
 		 345 aa  362  4e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.38 
 
 		 338 aa  362  4e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.28 
 
 		 333 aa  362  4e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003922  holliday junction DNA helicase RuvB  53.56 
 
 		 355 aa  362  4e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000262975  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0312  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.63 
 
 		 335 aa  363  4e-99  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.223853  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0140  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.99 
 
 		 348 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2777  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.61 
 
 		 351 aa  362  5.0000000000000005e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.928098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0719  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.27 
 
 		 334 aa  362  5.0000000000000005e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.20782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4407  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.96 
 
 		 353 aa  362  6e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>