More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1418 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1418  conserved hypothetical protein, probable rRNA methyltransferase, TrmH family  100 
 
 		 226 aa  449  1e-125  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0168  RNA methyltransferase  67.7 
 
 		 227 aa  315  4e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0189  RNA methyltransferase  66.81 
 
 		 227 aa  311  5.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0149  RNA methyltransferase  66.37 
 
 		 227 aa  310  1e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.913365  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0830  RNA methyltransferase  60.89 
 
 		 226 aa  286  2e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0190975  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1148  RNA methyltransferase  60.09 
 
 		 226 aa  275  3e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0221  RNA methyltransferase  60.62 
 
 		 226 aa  270  1e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0289  RNA methyltransferase  58.41 
 
 		 226 aa  264  8.999999999999999e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0165  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  49.34 
 
 		 227 aa  231  6e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.130362  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1908  RNA methyltransferase TrmH, group 3  43.11 
 
 		 226 aa  204  1e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0111  RNA methyltransferase  34.19 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.72575  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1016  RNA methyltransferase  33.63 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1084  RNA methyltransferase  32.61 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1036  RNA methyltransferase  32.61 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0209  RNA methyltransferase  32.38 
 
 		 251 aa  106  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0265  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  27.9 
 
 		 292 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0264  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  27.9 
 
 		 292 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2230  RNA methyltransferase  29.31 
 
 		 245 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0204347 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0116  RNA methyltransferase TrmH family, group 3  27.83 
 
 		 238 aa  104  9e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328344  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl088  rRNA methylase  30.38 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2368  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.88 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900248  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1443  RNA methyltransferase  33.77 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2172  RNA methyltransferase TrmH, group 3  25.78 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146478  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2280  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.31 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1517  RNA methyltransferase  32.61 
 
 		 238 aa  102  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.826104  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1583  RNA methyltransferase TrmH, group 3  28.88 
 
 		 256 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.780301  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1822  rRNA methylase  30.6 
 
 		 249 aa  101  8e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  32.64 
 
 		 247 aa  99.8  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1055  tyrosyl-tRNA synthetase, class Ib  27.47 
 
 		 248 aa  99.4  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.932424 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0230  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.96 
 
 		 237 aa  99  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2065  rRNA methylase  30.99 
 
 		 242 aa  99.4  5e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0596  RNA methyltransferase  30.17 
 
 		 240 aa  98.6  7e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  26.87 
 
 		 323 aa  98.2  9e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  26.75 
 
 		 327 aa  97.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4146  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  27.71 
 
 		 310 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2352  putative tRNA/rRNA methyltransferase YacO  30 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.177652  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1425  rRNA methylase  29.82 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022514  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0340  rRNA methylase  30.86 
 
 		 251 aa  97.4  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000065422  hitchhiker  0.000000457527 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2508  RNA methyltransferase TrmH, group 3  28.12 
 
 		 283 aa  97.1  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0411  RNA methyltransferase  28.88 
 
 		 249 aa  96.7  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2734  RNA methyltransferase  33.05 
 
 		 289 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1473  rRNA methylase  30.16 
 
 		 330 aa  96.7  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2420  RNA methyltransferase  33.05 
 
 		 289 aa  96.7  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0122  tRNA/rRNA methyltransferase  29.57 
 
 		 247 aa  96.3  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0526  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.58 
 
 		 246 aa  96.3  4e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2313  RNA methyltransferase  30.77 
 
 		 288 aa  95.9  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1644  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.27 
 
 		 234 aa  95.1  7e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000329546  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0348  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.57 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35140  rRNA methylase, putative, group 3  33.51 
 
 		 312 aa  94.4  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  28.26 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3844  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  26.55 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1356  RNA methyltransferase TrmH, group 3  27.8 
 
 		 250 aa  93.6  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000394989  hitchhiker  8.416419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3084  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.2 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0401  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  26.41 
 
 		 246 aa  92.8  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000436094  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1180  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.86 
 
 		 338 aa  92.4  5e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000228447  hitchhiker  0.0000274792 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf131  SpoU class tRNA/rRNA methyltransferase  29.46 
 
 		 229 aa  92.4  5e-18  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3641  RNA methyltransferase TrmH, group 3  27.03 
 
 		 275 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.179566  normal  0.181036 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2203  RNA methyltransferase TrmH, group 3  27.11 
 
 		 273 aa  92  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.524372  normal  0.0758016 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0404  RNA methyltransferase  30.3 
 
 		 252 aa  91.7  9e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.106461  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0086  RNA methyltransferase  33.92 
 
 		 247 aa  90.1  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000284808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1462  RNA methyltransferase  26.29 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0405731  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3230  RNA methyltransferase TrmH, group 3  26.09 
 
 		 273 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0416  RNA methyltransferase  32.76 
 
 		 246 aa  90.1  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.896719  normal  0.93402 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1616  RNA methyltransferase TrmH, group 3  26.09 
 
 		 248 aa  89.7  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.439996 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0310  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.19 
 
 		 237 aa  89  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5155  putative rRNA methylase  27.11 
 
 		 280 aa  88.6  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.512859  normal  0.0887365 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2796  RNA methyltransferase  28.82 
 
 		 242 aa  89  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125421  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2889  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.06 
 
 		 248 aa  88.6  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0092  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  27.27 
 
 		 245 aa  88.6  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607271  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0082  RNA methyltransferase  27.95 
 
 		 276 aa  88.6  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1692  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  27.07 
 
 		 256 aa  88.2  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31979  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0091  RNA methyltransferase  32.75 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00797863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0091  RNA methyltransferase  32.75 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0088  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  32.75 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000158072  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0087  TrmH family tRNA methyltransferase  32.75 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0091  RNA methyltransferase  32.75 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000227809  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0122  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.75 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000258465  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.75 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5214  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.75 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000196945  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1867  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.03 
 
 		 246 aa  86.7  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3581  RNA methyltransferase TrmH, group 3  26.29 
 
 		 253 aa  87  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07630  RNA methyltransferase TrmH, group 3  25.96 
 
 		 247 aa  87  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0088  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.04 
 
 		 246 aa  86.3  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2208  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.78 
 
 		 266 aa  86.7  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0305  RNA methyltransferase  26.46 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3629  RNA methyltransferase  31.14 
 
 		 252 aa  86.7  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0470316  normal  0.108479 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0174  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.14 
 
 		 247 aa  86.3  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000034032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3418  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  26.84 
 
 		 246 aa  86.7  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125093  normal  0.287966 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0313  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.15 
 
 		 251 aa  85.9  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000179001  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3859  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.95 
 
 		 267 aa  85.9  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0729978 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0262  RNA methyltransferase  27.27 
 
 		 243 aa  85.9  4e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295307  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0112  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.16 
 
 		 247 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1336  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  27.04 
 
 		 249 aa  85.5  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000822091 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0572  RNA methyltransferase  26.52 
 
 		 252 aa  85.5  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.52 
 
 		 253 aa  85.1  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000129806  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13612  tRNA/rRNA methyltransferase  29.12 
 
 		 322 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.288349 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1765  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.84 
 
 		 271 aa  85.5  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.560778  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0644  RNA methyltransferase  25.33 
 
 		 250 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000634261 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0086  RNA methyltransferase  31.58 
 
 		 247 aa  85.1  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239075  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4658  RNA methyltransferase  30.95 
 
 		 372 aa  85.1  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277573  normal  0.477344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>