More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1208 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1208  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 		 226 aa  449  1e-125  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1338  F0F1 ATP synthase subunit A  79.65 
 
 		 226 aa  383  1e-105  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.757914  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0526  F0F1 ATP synthase subunit A  79.2 
 
 		 226 aa  382  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  79.65 
 
 		 226 aa  383  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0771  F0F1 ATP synthase subunit A  76.55 
 
 		 226 aa  361  7.0000000000000005e-99  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00573947  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0790  F0F1 ATP synthase subunit A  70.67 
 
 		 225 aa  339  2e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0159  F0F1 ATP synthase subunit A  69.03 
 
 		 227 aa  333  1e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0542441  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1134  ATP synthase F0, A subunit  68.14 
 
 		 225 aa  319  1.9999999999999998e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0723  F0F1 ATP synthase subunit A  63.88 
 
 		 228 aa  288  4e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1339  F0F1 ATP synthase subunit A  59.56 
 
 		 224 aa  275  4e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0989022  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  46.04 
 
 		 229 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  45.05 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  44.74 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  44.04 
 
 		 229 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  45.26 
 
 		 229 aa  171  5.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  41.7 
 
 		 234 aa  170  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  42.86 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  46.03 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  44.44 
 
 		 229 aa  167  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  43.39 
 
 		 229 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  41.95 
 
 		 234 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  42.55 
 
 		 234 aa  162  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  42.2 
 
 		 229 aa  158  6e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705788  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1605  ATP synthase F0, A subunit  41.87 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  38.92 
 
 		 233 aa  152  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  38.42 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2254  ATP synthase F0, A subunit  37.28 
 
 		 234 aa  149  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0384265  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0877  ATP synthase F0, A subunit  43 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2700  ATP synthase F0, A subunit  35.58 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208406  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2087  ATP synthase F0, A subunit  43.3 
 
 		 226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000656805  normal  0.938168 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  32.38 
 
 		 218 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1299  ATP synthase F0, A subunit  35.47 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  32.65 
 
 		 216 aa  111  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2776  F0F1 ATP synthase subunit A  34.39 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261232  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  31.38 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1657  F0F1 ATP synthase subunit A  30.62 
 
 		 251 aa  107  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  33.99 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0046  F0F1 ATP synthase subunit A  33.16 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.959429  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  33.51 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  33 
 
 		 241 aa  105  4e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4472  ATP synthase F0, A subunit  36.22 
 
 		 258 aa  105  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3102  F0F1 ATP synthase subunit A  33.63 
 
 		 229 aa  105  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00224256  normal  0.218622 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1067  F0F1 ATP synthase subunit A  36.42 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.560179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  34.18 
 
 		 224 aa  102  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16461  F0F1 ATP synthase subunit A  33.5 
 
 		 241 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0948  F0F1 ATP synthase subunit A  30.59 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0817957  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1549  F0F1 ATP synthase subunit A  33.5 
 
 		 241 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2204  F0F1 ATP synthase subunit A  34.12 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3581  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04781  F0F1 ATP synthase subunit A  34.91 
 
 		 241 aa  99.8  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16581  F0F1 ATP synthase subunit A  33.01 
 
 		 241 aa  99.4  4e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2331  F0F1 ATP synthase subunit A  34.71 
 
 		 230 aa  99.4  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  32.23 
 
 		 246 aa  99.4  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2672  F0F1 ATP synthase subunit A  32.68 
 
 		 239 aa  99.4  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  34.83 
 
 		 252 aa  98.6  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0848  F0F1 ATP synthase subunit A  32.14 
 
 		 228 aa  97.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1165  F0F1 ATP synthase subunit A  31.05 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.273852  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0135  ATP synthase F0, A subunit  36.2 
 
 		 220 aa  96.3  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.276853  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1882  F0F1 ATP synthase subunit A  29.52 
 
 		 231 aa  96.3  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195651  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5556  F0F1 ATP synthase subunit A  30.32 
 
 		 232 aa  95.9  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0415006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3053  F0F1 ATP synthase subunit A  30.63 
 
 		 246 aa  95.9  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2699  F0F1 ATP synthase subunit A  27.91 
 
 		 228 aa  94.7  9e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2332  F0F1 ATP synthase subunit A  28.57 
 
 		 236 aa  94.7  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  29.88 
 
 		 261 aa  93.6  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1973  ATP synthase F0, A subunit  32.35 
 
 		 303 aa  93.6  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000495974  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16351  F0F1 ATP synthase subunit A  34.18 
 
 		 188 aa  93.6  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1958  F0F1 ATP synthase subunit A  28.97 
 
 		 243 aa  92.4  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0986  F0F1 ATP synthase subunit A  34.95 
 
 		 241 aa  92.4  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18541  F0F1 ATP synthase subunit A  34.95 
 
 		 241 aa  92.4  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0228025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1487  F0F1 ATP synthase subunit A  33.95 
 
 		 257 aa  92  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.327083  normal  0.531066 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1125  F0F1 ATP synthase subunit A  32.12 
 
 		 231 aa  91.7  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1053  F0F1 ATP synthase subunit A  29.85 
 
 		 232 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15751  F0F1 ATP synthase subunit A  34.47 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  33.18 
 
 		 261 aa  90.1  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0892  F0F1 ATP synthase subunit A  32.95 
 
 		 223 aa  90.1  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.546785  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3831  F0F1 ATP synthase subunit A  28.97 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000137067  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2851  ATP synthase F0, A subunit  33.16 
 
 		 217 aa  89.7  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0522079 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0069  ATP synthase F0, A subunit  27.78 
 
 		 284 aa  89  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3333  ATP synthase F0 subunit A  33.13 
 
 		 253 aa  88.6  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0516  F0F1 ATP synthase subunit A  28.78 
 
 		 235 aa  88.6  7e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000641483  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  29.2 
 
 		 258 aa  88.6  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3421  F0F1 ATP synthase subunit A  30.33 
 
 		 237 aa  88.6  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0077  ATP synthase F0, A subunit  27.75 
 
 		 271 aa  87  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5109  F0F1 ATP synthase subunit A  29.49 
 
 		 239 aa  86.7  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00506372  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1310  ATP synthase F0 subunit A  30.36 
 
 		 265 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21460  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  26.7 
 
 		 267 aa  86.3  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2143  ATP synthase F0, A subunit  27.44 
 
 		 257 aa  86.3  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3309  F0F1 ATP synthase subunit A  30.13 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000902841  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0743  F0F1 ATP synthase subunit A  35.32 
 
 		 253 aa  86.3  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230064  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5402  F0F1 ATP synthase subunit A  29.03 
 
 		 239 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.39849e-58 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5161  F0F1 ATP synthase subunit A  29.03 
 
 		 239 aa  85.9  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4994  F0F1 ATP synthase subunit A  29.03 
 
 		 239 aa  85.9  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000342727  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5011  F0F1 ATP synthase subunit A  29.03 
 
 		 239 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110706  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5553  F0F1 ATP synthase subunit A  29.03 
 
 		 239 aa  85.9  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000158416  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  36.07 
 
 		 251 aa  85.9  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  34.72 
 
 		 268 aa  85.9  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5436  F0F1 ATP synthase subunit A  29.03 
 
 		 239 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0528964  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5489  F0F1 ATP synthase subunit A  29.03 
 
 		 239 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000703666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>