More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0978 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0978  undecaprenyl diphosphate synthetase  100 
 
 
222 aa  447  1e-125  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.911321  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0841  undecaprenyl diphosphate synthase  63.96 
 
 
222 aa  307  6.999999999999999e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0911  undecaprenyl diphosphate synthase  63.96 
 
 
222 aa  307  6.999999999999999e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.220596  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1190  undecaprenyl diphosphate synthase  63.51 
 
 
222 aa  305  3e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0848371  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0970  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  49.33 
 
 
226 aa  230  2e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.542605  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0750  undecaprenyl diphosphate synthase  50.67 
 
 
225 aa  226  2e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.397744  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0695  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  47.96 
 
 
223 aa  214  7e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0997  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  44.59 
 
 
225 aa  206  2e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0444  undecaprenyl diphosphate synthase  44.39 
 
 
228 aa  201  7e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00160687  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2344  undecaprenyl diphosphate synthase  43.95 
 
 
227 aa  194  7e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0350605  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  42.42 
 
 
240 aa  192  4e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.41 
 
 
258 aa  187  8e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  43.48 
 
 
246 aa  186  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.89 
 
 
249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3706  undecaprenyl diphosphate synthase  38.18 
 
 
255 aa  181  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.71 
 
 
258 aa  179  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1193  undecaprenyl diphosphate synthase  40.89 
 
 
238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000857215  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1686  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  35.4 
 
 
260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.184494 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2451  undecaprenyl diphosphate synthase  34.96 
 
 
260 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351956  hitchhiker  0.00162806 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1746  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.39 
 
 
253 aa  177  8e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  36.52 
 
 
260 aa  177  9e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1252  undecaprenyl diphosphate synthase  39.46 
 
 
233 aa  177  1e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.56 
 
 
252 aa  176  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1281  undecaprenyl diphosphate synthase  40.44 
 
 
244 aa  176  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000016343  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.38 
 
 
258 aa  176  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3193  undecaprenyl diphosphate synthase  35.71 
 
 
250 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0231414 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2675  undecaprenyl diphosphate synthase  37.5 
 
 
242 aa  176  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.93656  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.33 
 
 
249 aa  176  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.04 
 
 
233 aa  176  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  34.67 
 
 
256 aa  175  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1199  undecaprenyl diphosphate synthase  40.43 
 
 
244 aa  175  6e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0136405  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  40.91 
 
 
245 aa  174  6e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  39.82 
 
 
256 aa  174  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1859  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.56 
 
 
257 aa  174  8e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470988  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.5 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.5 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.5 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.5 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.5 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.5 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  38.16 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.27 
 
 
243 aa  174  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2174  undecaprenyl diphosphate synthase  36.61 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0790587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.05 
 
 
258 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  38.77 
 
 
246 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.05 
 
 
258 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0661  undecaprenyl diphosphate synthase  36.16 
 
 
265 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.896818  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1261  undecaprenyl diphosphate synthase  34.07 
 
 
260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.12657  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  37.39 
 
 
244 aa  172  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.05 
 
 
258 aa  172  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  39.11 
 
 
240 aa  171  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  34.51 
 
 
260 aa  172  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1279  undecaprenyl diphosphate synthase  40.72 
 
 
225 aa  172  5e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  37 
 
 
249 aa  171  6.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1877  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  32.89 
 
 
261 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.05 
 
 
258 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.05 
 
 
257 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1447  undecaprenyl diphosphate synthase  36 
 
 
257 aa  171  7.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5325  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  33.63 
 
 
260 aa  171  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00863948  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1526  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  35.71 
 
 
250 aa  171  9e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00254317  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  39.65 
 
 
248 aa  171  9e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2489  undecaprenyl diphosphate synthase  34.07 
 
 
260 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0373  undecaprenyl diphosphate synthase  38.46 
 
 
236 aa  170  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0527  undecaprenyl diphosphate synthase  40.62 
 
 
231 aa  170  1e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2579  undecaprenyl diphosphate synthase  34.07 
 
 
260 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93392  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6062  undecaprenyl diphosphate synthase  33.63 
 
 
260 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2035  undecaprenyl diphosphate synthase  33.63 
 
 
260 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  33.63 
 
 
260 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2048  undecaprenyl diphosphate synthase  33.63 
 
 
260 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.21 
 
 
249 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  33.63 
 
 
260 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.68 
 
 
247 aa  169  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1324  undecaprenyl diphosphate synthase  34.07 
 
 
260 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.134804  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1551  undecaprenyl diphosphate synthase  34.07 
 
 
260 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0705  undecaprenyl diphosphate synthase  41.1 
 
 
228 aa  170  2e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000222485 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  37.61 
 
 
251 aa  170  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81385e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2052  undecaprenyl diphosphate synthase  34.07 
 
 
260 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3259  undecaprenyl diphosphate synthase  34.07 
 
 
260 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540086  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1800  undecaprenyl diphosphate synthase  34.36 
 
 
268 aa  170  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302341  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0243  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.73 
 
 
252 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.296524 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0640  undecaprenyl diphosphate synthase  40 
 
 
231 aa  169  4e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000259882  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  38.22 
 
 
239 aa  169  4e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1956  undecaprenyl diphosphate synthase  36.99 
 
 
228 aa  169  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.6 
 
 
233 aa  169  4e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14881  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.65 
 
 
256 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.574217 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2433  undecaprenyl diphosphate synthase  33.63 
 
 
260 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0292825  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  37.17 
 
 
257 aa  168  5e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0591  undecaprenyl diphosphate synthase  46.12 
 
 
244 aa  168  5e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0243  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.28 
 
 
252 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0246  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.28 
 
 
252 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.704245 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0261  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.28 
 
 
252 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00664761  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0259  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.28 
 
 
252 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.324297 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3429  undecaprenyl diphosphate synthase  36.73 
 
 
252 aa  167  8e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278251  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3585  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.1 
 
 
251 aa  167  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0178  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.73 
 
 
252 aa  167  8e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405538  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0176  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.73 
 
 
252 aa  167  8e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000145579  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00172  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.73 
 
 
253 aa  167  9e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0442077  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_317  undecaprenyl diphosphate synthase  37.1 
 
 
236 aa  167  9e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0184  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.73 
 
 
253 aa  167  9e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0185  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.73 
 
 
253 aa  167  9e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0180399  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>