More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0498 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1261  excinuclease ABC subunit C  65.71 
 
 		 600 aa  789    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0641  excinuclease ABC subunit C  58.09 
 
 		 607 aa  716    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.901377  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1382  excinuclease ABC subunit C  65.71 
 
 		 600 aa  791    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0480  excinuclease ABC subunit C  65.88 
 
 		 600 aa  794    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.867609  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0936  excinuclease ABC subunit C  56.23 
 
 		 607 aa  701    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1559  excinuclease ABC subunit C  57.5 
 
 		 605 aa  721    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0498  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 597 aa  1209    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1266  excinuclease ABC subunit C  61.41 
 
 		 602 aa  744    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0418  excinuclease ABC subunit C  48.83 
 
 		 600 aa  553  1e-156  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0591  excinuclease ABC, C subunit  47.33 
 
 		 599 aa  544  1e-153  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  34.72 
 
 		 614 aa  323  4e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  32.59 
 
 		 631 aa  310  4e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1082  excinuclease ABC subunit C  31.07 
 
 		 644 aa  299  1e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  32.57 
 
 		 617 aa  299  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0772  excinuclease ABC subunit C  32.52 
 
 		 633 aa  297  4e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00962744  normal  0.347624 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  31.92 
 
 		 624 aa  295  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1975  excinuclease ABC subunit C  30.9 
 
 		 653 aa  294  3e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4491  excinuclease ABC subunit C  31.44 
 
 		 642 aa  293  5e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.191027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  34.39 
 
 		 623 aa  293  7e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  34.39 
 
 		 649 aa  293  7e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  31.96 
 
 		 628 aa  293  8e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  32.38 
 
 		 619 aa  291  3e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  32.89 
 
 		 613 aa  290  4e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2220  excinuclease ABC subunit C  32.09 
 
 		 639 aa  288  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0021269  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2520  excinuclease ABC subunit C  31.29 
 
 		 635 aa  288  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  31.18 
 
 		 610 aa  288  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  33.17 
 
 		 622 aa  287  2.9999999999999996e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  31.8 
 
 		 616 aa  285  2.0000000000000002e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  31.09 
 
 		 601 aa  285  2.0000000000000002e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  33.06 
 
 		 588 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  31.72 
 
 		 627 aa  283  5.000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5405  excinuclease ABC, C subunit  30.3 
 
 		 688 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  32.15 
 
 		 607 aa  283  7.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  31.99 
 
 		 613 aa  282  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0901  excinuclease ABC subunit C  30.6 
 
 		 699 aa  281  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.686054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1086  excinuclease ABC subunit C  30.41 
 
 		 680 aa  280  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000501867 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  31.33 
 
 		 615 aa  279  9e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  31.86 
 
 		 636 aa  279  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  31.8 
 
 		 615 aa  279  1e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3104  excinuclease ABC, C subunit  29.89 
 
 		 682 aa  279  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.299342  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  32.57 
 
 		 613 aa  279  1e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2878  excinuclease ABC, C subunit  29.89 
 
 		 682 aa  279  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  30.21 
 
 		 617 aa  278  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0644  excinuclease ABC subunit C  31.58 
 
 		 631 aa  278  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0782  excinuclease ABC subunit C  30.65 
 
 		 674 aa  278  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191761  normal  0.0714693 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  31.28 
 
 		 638 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3001  excinuclease ABC, C subunit  30.06 
 
 		 700 aa  278  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1281  excinuclease ABC subunit C  30.71 
 
 		 695 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.280524  normal  0.136737 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  31.14 
 
 		 625 aa  276  6e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  31 
 
 		 628 aa  276  8e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  29.58 
 
 		 612 aa  276  8e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2589  excinuclease ABC subunit C  29.86 
 
 		 691 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0718587  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  32.96 
 
 		 620 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2735  excinuclease ABC subunit C  30.82 
 
 		 623 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.0935486 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0046  excinuclease ABC subunit C  31.94 
 
 		 629 aa  275  2.0000000000000002e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.714841  hitchhiker  0.00962006 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1074  excinuclease ABC subunit C  30.82 
 
 		 623 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.969621  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1177  excinuclease ABC subunit C  30.79 
 
 		 695 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.8668  normal  0.100977 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3713  excinuclease ABC, C subunit  31.67 
 
 		 668 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2276  excinuclease ABC, C subunit  29.21 
 
 		 644 aa  274  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1060  excinuclease ABC subunit C  29.22 
 
 		 658 aa  274  3e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41739  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2859  excinuclease ABC subunit C  31.07 
 
 		 623 aa  274  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1615  excinuclease ABC subunit C  32.08 
 
 		 609 aa  274  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000543557  normal  0.3636 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0420  excinuclease ABC subunit C  31.4 
 
 		 620 aa  274  4.0000000000000004e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000882939  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2698  excinuclease ABC subunit C  30.47 
 
 		 618 aa  273  5.000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  32.78 
 
 		 599 aa  273  5.000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1548  excinuclease ABC subunit C  32.08 
 
 		 609 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000704584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2306  excinuclease ABC subunit C  33 
 
 		 605 aa  273  6e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.391453  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2652  excinuclease ABC, C subunit  30.92 
 
 		 668 aa  273  8.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  32.61 
 
 		 612 aa  273  9e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0690  excinuclease ABC subunit C  30.39 
 
 		 690 aa  273  9e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.485523  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1712  excinuclease ABC, C subunit  30.9 
 
 		 692 aa  272  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  32.63 
 
 		 620 aa  272  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2570  excinuclease ABC subunit C  30.72 
 
 		 618 aa  271  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  32.52 
 
 		 593 aa  271  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1861  excinuclease ABC subunit C  31.92 
 
 		 609 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1609  excinuclease ABC subunit C  31.92 
 
 		 609 aa  270  4e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000167064  normal  0.0818954 
 
 
-
 
NC_004310  BR0699  excinuclease ABC subunit C  30.23 
 
 		 690 aa  270  5e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2133  excinuclease ABC subunit C  29.71 
 
 		 604 aa  270  5e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00985622  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4277  excinuclease ABC subunit C  31.02 
 
 		 634 aa  270  5.9999999999999995e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.471865 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  31.8 
 
 		 629 aa  269  1e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1558  excinuclease ABC subunit C  30.82 
 
 		 690 aa  269  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  31.48 
 
 		 624 aa  269  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1728  excinuclease ABC subunit C  30.84 
 
 		 688 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0415792 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  30.38 
 
 		 607 aa  268  2e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0845  excinuclease ABC, C subunit  29.7 
 
 		 620 aa  268  2e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.866518  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3919  excinuclease ABC subunit C  30.46 
 
 		 631 aa  268  2e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  31.87 
 
 		 598 aa  268  2e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1232  excinuclease ABC subunit C  29.87 
 
 		 680 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101228 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  32.1 
 
 		 619 aa  268  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  31.68 
 
 		 627 aa  267  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  32.03 
 
 		 613 aa  267  4e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1437  excinuclease ABC subunit C  32.17 
 
 		 609 aa  267  4e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0535013  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2312  excinuclease ABC subunit C  32.08 
 
 		 623 aa  267  4e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.136814 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  28.75 
 
 		 653 aa  266  8.999999999999999e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1276  excinuclease ABC subunit C  32.74 
 
 		 609 aa  265  1e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00138903  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2526  excinuclease ABC subunit C  30.65 
 
 		 666 aa  265  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1334  excinuclease ABC subunit C  32.9 
 
 		 609 aa  265  2e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000285239  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  31.1 
 
 		 617 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0516  excinuclease ABC subunit C  31.8 
 
 		 658 aa  265  2e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1362  excinuclease ABC subunit C  30.51 
 
 		 704 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>