More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3285 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0802  Integrase catalytic region  100 
 
 
299 aa  611  9.999999999999999e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3285  Integrase catalytic region  100 
 
 
299 aa  611  9.999999999999999e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4830  integrase catalytic subunit  63.55 
 
 
299 aa  394  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.798983 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2154  integrase catalytic subunit  63.55 
 
 
299 aa  394  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0575  integrase catalytic subunit  65.22 
 
 
299 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0583  integrase catalytic subunit  65.22 
 
 
299 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308841  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5606  integrase catalytic subunit  66.56 
 
 
299 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398983  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5824  integrase catalytic subunit  66.56 
 
 
299 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.360076 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3218  Integrase catalytic region  60.4 
 
 
302 aa  360  1e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0268  Integrase catalytic region  60.4 
 
 
302 aa  360  1e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154929  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0272  Integrase catalytic region  60.4 
 
 
302 aa  360  1e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.443922  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1648  Integrase catalytic region  60.4 
 
 
302 aa  360  1e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2473  Integrase catalytic region  60.4 
 
 
302 aa  360  1e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0279  Integrase catalytic region  60.4 
 
 
302 aa  360  1e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2606  Integrase catalytic region  60.4 
 
 
302 aa  360  1e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1666  Integrase catalytic region  60.4 
 
 
302 aa  360  1e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0302  Integrase catalytic region  60.27 
 
 
303 aa  358  6e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3741  integrase catalytic subunit  66.3 
 
 
277 aa  355  5.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2246  integrase catalytic subunit  65.55 
 
 
299 aa  345  5e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0582886  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2000  integrase catalytic subunit  65.55 
 
 
299 aa  345  5e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0559  integrase catalytic subunit  65.55 
 
 
299 aa  345  5e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2585  integrase catalytic subunit  65.55 
 
 
299 aa  345  5e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2853  integrase catalytic subunit  65.55 
 
 
299 aa  345  5e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2228  integrase catalytic subunit  65.55 
 
 
299 aa  345  5e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.996851  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1670  integrase catalytic subunit  65.55 
 
 
299 aa  345  5e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.406666  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1626  integrase catalytic subunit  65.55 
 
 
299 aa  345  5e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0832257  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3191  integrase catalytic subunit  65.55 
 
 
299 aa  345  5e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.959465  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0608  integrase catalytic subunit  65.55 
 
 
299 aa  345  5e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1652  integrase catalytic subunit  65.55 
 
 
299 aa  345  5e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3253  integrase catalytic subunit  65.55 
 
 
299 aa  345  5e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0424775  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0576  integrase catalytic subunit  65.22 
 
 
299 aa  342  4e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0687  Integrase catalytic region  43.34 
 
 
292 aa  207  2e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1775  Integrase catalytic region  44.03 
 
 
292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.565196  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0301  Integrase catalytic region  44.03 
 
 
292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0154  Integrase catalytic region  44.03 
 
 
292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0519  Integrase catalytic region  44.03 
 
 
292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.377839  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0979  Integrase catalytic region  44.03 
 
 
292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.319185  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1316  Integrase catalytic region  44.03 
 
 
292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0550565  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4705  integrase catalytic subunit  43.9 
 
 
296 aa  199  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  38.1 
 
 
291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0978  Integrase catalytic region  45.59 
 
 
276 aa  192  4e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.216632  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7355  integrase catalytic region  41.58 
 
 
319 aa  192  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.149793 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  38.52 
 
 
277 aa  191  9e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1727  integrase  41.97 
 
 
281 aa  190  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0647864 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  40 
 
 
286 aa  186  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3664  Integrase catalytic region  40.73 
 
 
294 aa  185  8e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11217  normal  0.13781 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0765  integrase catalytic subunit  42.07 
 
 
271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2400  integrase catalytic subunit  43.75 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3089  integrase catalytic region  40.88 
 
 
296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175977  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4118  integrase catalytic subunit  43.75 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000189778 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2398  integrase catalytic subunit  43.75 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466088  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3189  integrase catalytic subunit  43.75 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3353  integrase catalytic subunit  43.75 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.746992  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0514  integrase catalytic subunit  43.75 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0519  integrase catalytic subunit  43.75 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0693  integrase catalytic subunit  43.75 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0702  integrase catalytic subunit  43.75 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0706  integrase catalytic subunit  43.75 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0708  integrase catalytic subunit  43.75 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1319  Integrase catalytic region  41.98 
 
 
292 aa  183  3e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.586112  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  37.63 
 
 
289 aa  182  6e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  38.97 
 
 
289 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  38.97 
 
 
289 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  38.97 
 
 
289 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0801  Integrase catalytic region  41.88 
 
 
291 aa  181  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0004  ISMca2 transposase OrfB  40.68 
 
 
291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0575577 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0185  ISMca2 transposase OrfB  40.68 
 
 
291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.213513 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0070  ISMca2 transposase OrfB  40.68 
 
 
291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0088066 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1059  ISMca2 transposase OrfB  40.68 
 
 
291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0549  ISMca2 transposase OrfB  40.68 
 
 
291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151699  normal  0.0449666 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0587  ISMca2 transposase OrfB  40.68 
 
 
291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000761461 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0571  ISMca2 transposase OrfB  40.68 
 
 
291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23921  normal  0.0300939 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  37.63 
 
 
289 aa  179  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  39.02 
 
 
286 aa  179  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  39.02 
 
 
286 aa  179  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  39.02 
 
 
286 aa  179  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  39.02 
 
 
286 aa  179  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  39.02 
 
 
286 aa  179  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1288  integrase catalytic subunit  40.96 
 
 
271 aa  178  8e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381698  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  40.69 
 
 
286 aa  178  9e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1846  putative transposase  36.61 
 
 
296 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796912  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2087  putative IS3 family transposase orfB  36.61 
 
 
296 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360317  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2544  IS3 family transposase orfB  36.61 
 
 
296 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2735  putative IS3 transposase integrase  36.61 
 
 
296 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0386866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3565  putative transposase  36.61 
 
 
296 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0131  putative transposase  36.61 
 
 
296 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0634  putative transposase  36.61 
 
 
296 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214662  normal  0.0414488 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0616  integrase catalytic subunit  47.32 
 
 
232 aa  176  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.243414  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  38.01 
 
 
291 aa  176  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  38.01 
 
 
291 aa  176  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  37.28 
 
 
289 aa  175  7e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1091  integrase catalytic subunit  39.32 
 
 
297 aa  175  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1692  integrase catalytic subunit  39.32 
 
 
297 aa  175  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1955  integrase catalytic subunit  39.32 
 
 
297 aa  175  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3659  integrase catalytic subunit  39.32 
 
 
297 aa  175  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3720  integrase catalytic subunit  39.32 
 
 
297 aa  175  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.424054  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3740  integrase catalytic subunit  39.32 
 
 
297 aa  175  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.553095  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5060  integrase catalytic subunit  39.32 
 
 
297 aa  175  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690854  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  37.59 
 
 
281 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  38.14 
 
 
286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>