34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3244 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3244  Immunoglobulin I-set domain protein  100 
 
 		 532 aa  981    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000478897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0992  putative Vgr-related protein  42.58 
 
 		 979 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  41.34 
 
 		 1100 aa  97.4  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  35.47 
 
 		 14944 aa  92.4  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0991  hypothetical protein  41.81 
 
 		 760 aa  87.8  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.021624  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2366  Htaa domain protein  38.86 
 
 		 1127 aa  85.9  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527032  normal  0.0458127 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0581  Htaa domain protein  35.52 
 
 		 1098 aa  74.3  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.892764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  28.68 
 
 		 1969 aa  73.6  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3031  glycoside hydrolase family 9  48.35 
 
 		 1105 aa  68.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2946  Ig family protein  28.28 
 
 		 683 aa  64.3  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0465755  hitchhiker  0.00278278 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2988  Htaa domain protein  40.48 
 
 		 994 aa  63.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360944  normal  0.268871 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  30.92 
 
 		 3563 aa  60.5  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  33.16 
 
 		 737 aa  59.7  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  29.2 
 
 		 1607 aa  59.3  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.31 
 
 		 1292 aa  58.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  30 
 
 		 1507 aa  58.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  27.97 
 
 		 2262 aa  57.8  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2545  hypothetical protein  30.65 
 
 		 4120 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1618  immunoglobulin I-set domain-containing protein  37.21 
 
 		 540 aa  53.9  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3185  hypothetical protein  27.43 
 
 		 2418 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0865533 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  34.23 
 
 		 887 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  39.53 
 
 		 1550 aa  50.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2870  hypothetical protein  30.67 
 
 		 1243 aa  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.772535  hitchhiker  0.00123304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  30.92 
 
 		 1132 aa  47.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4612  immunoglobulin I-set domain-containing protein  36.63 
 
 		 714 aa  47.4  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0327  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.79 
 
 		 1221 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.495752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0808  D-galactoside/L-rhamnose binding SUEL lectin  30.59 
 
 		 1436 aa  45.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  28.39 
 
 		 2421 aa  45.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  26.79 
 
 		 627 aa  44.7  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  33.33 
 
 		 1657 aa  45.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  27.78 
 
 		 2411 aa  44.3  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5626  Htaa domain protein  39.85 
 
 		 800 aa  44.3  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.259672 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  27.09 
 
 		 2367 aa  43.9  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  28.14 
 
 		 2454 aa  43.5  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>