More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3229 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2220  ABC transporter related  70.1 
 
 		 492 aa  711    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3229  ABC transporter related  100 
 
 		 495 aa  1015    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736702  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1612  ABC transporter related  72.12 
 
 		 495 aa  731    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.052092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2546  ABC transporter, ATP-binding protein  60.61 
 
 		 492 aa  615  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.55199e-45 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2313  ABC transporter, ATP-binding protein  60.61 
 
 		 492 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000196397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2355  ABC transporter ATP-binding protein  60.2 
 
 		 492 aa  610  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0376605  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2271  ABC transporter, ATP-binding protein  60.2 
 
 		 492 aa  609  1e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.11466  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2531  ABC transporter ATP-binding protein  60.2 
 
 		 492 aa  610  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1690  ABC transporter, ATP-binding protein  59.39 
 
 		 492 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.359726  hitchhiker  0.0000000000000525976 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3162  ABC transporter related protein  59.6 
 
 		 488 aa  581  1.0000000000000001e-165  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0458111  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3631  ABC transporter, ATP-binding protein  59.6 
 
 		 460 aa  544  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2109  ABC transporter related  50.1 
 
 		 492 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0497  ABC transporter, ATP-binding protein  50.3 
 
 		 523 aa  498  1e-140  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.208057 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0044  ABC transporter, ATP-binding protein  49.29 
 
 		 490 aa  485  1e-136  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0818  ABC transporter ATPase  40.6 
 
 		 501 aa  378  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000307399  normal  0.444871 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0976  ABC transporter ATPase  41.24 
 
 		 516 aa  366  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2020  ABC transporter related  34.59 
 
 		 522 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  27.2 
 
 		 620 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1961  ABC transporter related  27.33 
 
 		 577 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0368  ABC transporter related  27.13 
 
 		 606 aa  179  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1548  ABC transporter related  37.83 
 
 		 305 aa  176  6e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2381  ABC transporter, ATP-binding protein  30.02 
 
 		 543 aa  176  7e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.138547  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2617  ABC transporter, ATP-binding protein  29.24 
 
 		 548 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000147161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6763  ABC transporter related  26.14 
 
 		 623 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2346  ABC transporter ATP-binding protein  28.39 
 
 		 542 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.574829  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2573  ABC transporter, ATP-binding protein  29.81 
 
 		 542 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  26.37 
 
 		 709 aa  172  9e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2003  ABC transporter related  26.08 
 
 		 528 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118433  decreased coverage  0.00762466 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  26.17 
 
 		 627 aa  171  2e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2620  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  29.61 
 
 		 542 aa  171  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00269042  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  26.63 
 
 		 630 aa  171  3e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2750  nucleotide-binding protein ExpZ  28.02 
 
 		 548 aa  170  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000173219 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6573  ABC transporter related  26.14 
 
 		 623 aa  170  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902465 
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  26.27 
 
 		 645 aa  170  6e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  26.62 
 
 		 690 aa  170  6e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2658  ABC transporter, ATP-binding protein  28.76 
 
 		 548 aa  170  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000890134  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0831  ABC transporter related  26.95 
 
 		 577 aa  169  9e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00618018  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  28.21 
 
 		 535 aa  169  1e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  28.65 
 
 		 636 aa  169  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4782  ABC transporter related  26.22 
 
 		 620 aa  168  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  25.32 
 
 		 636 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2534  ABC transporter related  27.91 
 
 		 542 aa  168  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165488  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  30.02 
 
 		 644 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2171  ABC transporter, ATP-binding protein  25.45 
 
 		 539 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0650343  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4634  ABC transporter related  25.84 
 
 		 621 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2836  ABC transporter related  25.27 
 
 		 528 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104102  normal  0.187196 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0954  ABC transporter related  25.05 
 
 		 633 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2877  ABC transporter related  25.38 
 
 		 621 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358823  normal  0.296098 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2750  ABC transporter related  25.27 
 
 		 528 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.742675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  26.96 
 
 		 641 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  25.5 
 
 		 663 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4267  ABC transporter related  25.66 
 
 		 621 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183783  normal  0.517303 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.2 
 
 		 550 aa  165  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2755  ABC transporter related  25.82 
 
 		 528 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0013  ABC transporter related  25.32 
 
 		 540 aa  164  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0204  ABC transporter, ATP-binding protein  29.93 
 
 		 626 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2936  ABC transporter ATP-binding protein  25.27 
 
 		 528 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.914866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0920  ABC transporter related  24.47 
 
 		 596 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  28.42 
 
 		 630 aa  163  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2609  ABC transporter-like  24.73 
 
 		 528 aa  163  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2924  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.23 
 
 		 555 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570812  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  26.28 
 
 		 646 aa  163  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  26.48 
 
 		 659 aa  162  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3159  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.7 
 
 		 555 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146292 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2810  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.7 
 
 		 555 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1747  ABC transporter related  25.65 
 
 		 615 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219257  normal  0.123618 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1126  ABC transporter related  24.48 
 
 		 642 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0852453 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  29.57 
 
 		 641 aa  162  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1539  ABC transporter related  24.53 
 
 		 615 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.176229  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0217  ABC transporter ATP-binding protein  30.11 
 
 		 626 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2895  putative ABC transporter, fused ATPase subunits  24.53 
 
 		 615 aa  162  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0228  ABC transporter ATP-binding protein  30.11 
 
 		 626 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2198  ABC transporter ATP-binding protein  25.59 
 
 		 529 aa  161  2e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0113236  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  27.34 
 
 		 656 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1995  ABC transporter ATPase  25.45 
 
 		 540 aa  162  2e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.79953  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1367  ABC transporter, ATP-binding protein  26.1 
 
 		 634 aa  160  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2913  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.47 
 
 		 555 aa  161  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.010089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0205  ABC transporter related  28.75 
 
 		 628 aa  161  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  25.83 
 
 		 688 aa  161  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0889  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.32 
 
 		 554 aa  160  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  28.64 
 
 		 636 aa  161  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0245  ABC transporter, ATP-binding protein  29.07 
 
 		 626 aa  160  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2713  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.04 
 
 		 555 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2091  ABC transporter related  26.53 
 
 		 627 aa  160  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4057  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.91 
 
 		 554 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0238  ABC transporter, ATP-binding protein  29.2 
 
 		 626 aa  160  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  26.68 
 
 		 632 aa  159  7e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49454  ABC(ATP-binding) family transporter  24.58 
 
 		 649 aa  159  8e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00209815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5082  ABC transporter, ATP-binding protein  28.91 
 
 		 626 aa  159  9e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0119916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0945  ABC transporter related  27.26 
 
 		 580 aa  159  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  26.42 
 
 		 637 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  26.42 
 
 		 637 aa  158  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4024  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.32 
 
 		 554 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.640286  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.42 
 
 		 637 aa  158  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  26.42 
 
 		 637 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  26.17 
 
 		 545 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.42 
 
 		 637 aa  158  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  25.73 
 
 		 634 aa  158  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.42 
 
 		 637 aa  158  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.91 
 
 		 555 aa  158  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>