More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2678 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2678  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 284 aa  593  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2556  AraC family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 290 aa  265  5e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000235949  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3142  AraC family transcriptional regulator  44.15 
 
 		 301 aa  250  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3846  transcriptional regulator, AraC family  43.94 
 
 		 287 aa  248  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2107  AraC family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 313 aa  245  4.9999999999999997e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342925  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5265  transcriptional regulator, AraC family  46.08 
 
 		 281 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0990  AraC family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 281 aa  239  5e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0205  transcriptional activator, AraC family  45.12 
 
 		 281 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524418 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0223  transcriptional activator, AraC family  45.12 
 
 		 281 aa  237  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178737 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3174  AraC family transcriptional regulator  46.44 
 
 		 280 aa  232  5e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.626893  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 290 aa  229  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4582  AraC family transcriptional regulator  44.92 
 
 		 290 aa  228  7e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.763033  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  44.97 
 
 		 290 aa  228  9e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  44.92 
 
 		 290 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0278  transcriptional regulator, AraC family  43.14 
 
 		 290 aa  227  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  45.25 
 
 		 290 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  45.25 
 
 		 290 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4957  transcriptional regulator, AraC family  43.1 
 
 		 290 aa  224  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4672  AraC family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 290 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4566  AraC family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 290 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2759  AraC family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 292 aa  218  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3264  transcriptional regulator, AraC family  40.42 
 
 		 287 aa  217  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3181  AraC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2323  transcriptional regulator, AraC family  40.13 
 
 		 289 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.614848  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2210  transcriptional regulator, AraC family  37.41 
 
 		 291 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1922  transcriptional regulator, AraC family  37.88 
 
 		 291 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.890213  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0011  transcriptional regulator, AraC family  33.67 
 
 		 285 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871788  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3138  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3564  transcriptional regulator, AraC family  34.01 
 
 		 285 aa  172  5e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1802  transcriptional regulator, AraC family  33.22 
 
 		 286 aa  170  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1266  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 300 aa  166  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.23796  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2780  transcriptional regulator, AraC family  30.51 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0531003  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2251  transcriptional regulator, AraC family  32.76 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0674  AraC family transcriptional regulator  56.78 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0137  AraC family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 315 aa  146  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.10009 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2127  transcription activator effector binding protein  30.24 
 
 		 290 aa  142  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  31.02 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 300 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  30.69 
 
 		 300 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  30.36 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1127  transcriptional regulator, AraC family  28.87 
 
 		 288 aa  137  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  30.03 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 300 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1790  transcriptional regulator, AraC family  30.72 
 
 		 282 aa  136  4e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.191731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 300 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3344  helix-turn-helix domain-containing protein  36.14 
 
 		 232 aa  133  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.388455  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1784  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000275244  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0329  transcription activator effector binding protein  28.03 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0236652  normal  0.0105288 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0424  transcriptional regulator, AraC family  30.21 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1798  transcriptional regulator, AraC family  41.89 
 
 		 200 aa  123  4e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  27.48 
 
 		 302 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  25.59 
 
 		 296 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  27.89 
 
 		 279 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  26.51 
 
 		 296 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0165  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 298 aa  102  9e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2843  AraC family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2776  AraC family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3057  AraC family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118978  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0186  transcriptional regulator, AraC family  46.15 
 
 		 452 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  25.93 
 
 		 296 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2193  transcriptional regulator, AraC family  24.92 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412725 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0086  transcriptional regulator, AraC family  28.98 
 
 		 313 aa  99.8  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.353006  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 296 aa  99.4  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2816  AraC family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0261  AraC family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 281 aa  96.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7157  transcriptional regulator, AraC family  26.55 
 
 		 277 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0910  HTH-type transcription regulator, AraC-family  24.59 
 
 		 298 aa  94.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576456  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 288 aa  92.8  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0526  transcriptional regulator, AraC family  39.5 
 
 		 129 aa  92.4  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000198595  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0009  helix-turn-helix domain-containing protein  25.32 
 
 		 306 aa  92.4  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000070115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  26.94 
 
 		 279 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  25.57 
 
 		 279 aa  89  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1472  AraC family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.102681  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1224  AraC family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0494811  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0176  AraC family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  24.6 
 
 		 294 aa  87.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 299 aa  87  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  37.82 
 
 		 299 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 299 aa  86.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 299 aa  86.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0216  transcriptional regulator, AraC family  36.97 
 
 		 299 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  35.51 
 
 		 284 aa  86.3  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003322  hypothetical protein  26.8 
 
 		 310 aa  85.9  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.757084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0182  AraC family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 299 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  40.38 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3219  transcription activator effector binding  32.3 
 
 		 160 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2173  AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1774  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.524324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1952  AraC family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  24.1 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2167  transcriptional regulator, AraC family  23.77 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273156  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2158  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3564  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0076  transcription activator, effector binding  34 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  23.77 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>