52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2443 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2443  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 457 aa  913    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000052902  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2087  major facilitator superfamily MFS_1  37.24 
 
 		 446 aa  307  3e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000442741  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 504 aa  156  9e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 453 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 446 aa  137  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1907  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 469 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000193036  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 		 462 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  24.41 
 
 		 531 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  23.43 
 
 		 445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3236  major facilitator superfamily MFS_1  22.71 
 
 		 513 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.113654 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0355  major facilitator transporter  23.21 
 
 		 459 aa  108  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720237  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  24.57 
 
 		 480 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0373  major facilitator transporter  21.89 
 
 		 459 aa  103  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.259758  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3428  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 482 aa  99.8  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1339  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 		 471 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0968  major facilitator superfamily protein  25.12 
 
 		 468 aa  97.8  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.623645  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0365  major facilitator superfamily permease  25.38 
 
 		 474 aa  94.7  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0271  hypothetical protein  24.87 
 
 		 491 aa  94.4  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1691  major facilitator transporter  22.62 
 
 		 445 aa  94  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000499428  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1748  major facilitator transporter  22.62 
 
 		 444 aa  94  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0189374  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3845  twin-arginine translocation pathway signal  24.32 
 
 		 476 aa  93.6  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0682  major facilitator transporter  23.15 
 
 		 454 aa  93.2  9e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0334  twin-arginine translocation pathway signal  25.06 
 
 		 474 aa  90.1  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0184  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 470 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012641 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3806  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 495 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3609  twin-arginine translocation pathway signal  25.06 
 
 		 474 aa  88.2  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2800  hypothetical protein  24.1 
 
 		 397 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  25.47 
 
 		 461 aa  87  7e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0367  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 472 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 461 aa  85.5  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0357  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 472 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0364  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 472 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0201  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.196345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0359  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 471 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0029  major facilitator superfamily MFS_1  21.79 
 
 		 427 aa  80.9  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0874  major facilitator transporter  22.99 
 
 		 450 aa  80.1  0.00000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0233  major facilitator superfamily MFS_1  23.06 
 
 		 457 aa  79  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0397  hypothetical protein  23.23 
 
 		 422 aa  76.3  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0195929  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  25.06 
 
 		 440 aa  75.5  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2583  major facilitator transporter  22.1 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2056  major facilitator transporter  20.78 
 
 		 413 aa  63.2  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000877049  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0398  major facilitator transporter  21.51 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2212  hypothetical protein  21.01 
 
 		 490 aa  61.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.814869  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1026  major facilitator transporter  21.88 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  23.97 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1979  major facilitator transporter  23.86 
 
 		 406 aa  49.7  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.44928  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0793  major facilitator transporter  21.51 
 
 		 482 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5604  major facilitator superfamily MFS_1  23.22 
 
 		 457 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.638903  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  21.2 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1067  major facilitator superfamily MFS_1  22.1 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0207259  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1577  major facilitator transporter  23.64 
 
 		 383 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0471047  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 406 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>