More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2307 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  100 
 
 
244 aa  496  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  44.35 
 
 
243 aa  216  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  40.09 
 
 
252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  40 
 
 
241 aa  171  6.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  38.05 
 
 
226 aa  169  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  35.91 
 
 
254 aa  162  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  34.8 
 
 
234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  34.32 
 
 
238 aa  161  7e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  39.27 
 
 
224 aa  160  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  34.7 
 
 
237 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  35.65 
 
 
237 aa  159  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  35.56 
 
 
262 aa  159  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  36.99 
 
 
224 aa  159  6e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  38.18 
 
 
224 aa  158  7e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  36.8 
 
 
292 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  36.17 
 
 
300 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  36.61 
 
 
243 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  36.8 
 
 
292 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  36.17 
 
 
300 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  34.7 
 
 
238 aa  155  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  34.93 
 
 
239 aa  153  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  36.29 
 
 
285 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  35.6 
 
 
261 aa  152  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  34.45 
 
 
292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0317  hypothetical protein  35.14 
 
 
235 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  35.5 
 
 
288 aa  151  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  29.46 
 
 
242 aa  150  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0384  zinc metalloprotease  35.14 
 
 
235 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0625718  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0309  zinc metalloprotease  35.59 
 
 
235 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  33.79 
 
 
244 aa  150  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  35.83 
 
 
245 aa  149  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  34.33 
 
 
295 aa  149  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  31.82 
 
 
246 aa  149  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  31.82 
 
 
246 aa  149  5e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  36.57 
 
 
223 aa  148  6e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  35.78 
 
 
223 aa  148  7e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  34.76 
 
 
292 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0306  zinc metalloprotease  34.68 
 
 
235 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  34.76 
 
 
292 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  33.19 
 
 
286 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  34.76 
 
 
292 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  34.76 
 
 
292 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  34.76 
 
 
292 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  34.76 
 
 
292 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  35.44 
 
 
301 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  34.76 
 
 
292 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  33.89 
 
 
240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0431  hypothetical protein  32.58 
 
 
235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00811962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0431  hypothetical protein  32.58 
 
 
235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0322  hypothetical protein  34.68 
 
 
235 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000118894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0337  hypothetical protein  34.68 
 
 
235 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000389941  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0369  hypothetical protein  34.68 
 
 
235 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  36.4 
 
 
285 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  36.05 
 
 
316 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  36.05 
 
 
295 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  35.62 
 
 
303 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  31.43 
 
 
235 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  35.62 
 
 
295 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  35.62 
 
 
295 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  35.04 
 
 
241 aa  142  4e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  34.3 
 
 
238 aa  141  9e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  35.09 
 
 
234 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  33.05 
 
 
237 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  34.93 
 
 
218 aa  140  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  31.3 
 
 
243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  30.26 
 
 
231 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  29.07 
 
 
235 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  32.6 
 
 
240 aa  138  7e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  32.3 
 
 
240 aa  137  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0448  hypothetical protein  33.33 
 
 
319 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0505  hypothetical protein  33.19 
 
 
233 aa  136  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.722938 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4740  protein of unknown function DUF45  31.78 
 
 
318 aa  135  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  32.3 
 
 
240 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0212  hypothetical protein  33.2 
 
 
321 aa  134  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4199  hypothetical protein  32.3 
 
 
340 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2343  hypothetical protein  32.17 
 
 
238 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.781257  normal  0.0217963 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  31.2 
 
 
251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  29.18 
 
 
244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  29.67 
 
 
254 aa  132  6e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  31.93 
 
 
242 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  30.63 
 
 
241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  33.78 
 
 
227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  33.78 
 
 
227 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  30.18 
 
 
260 aa  129  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  37.37 
 
 
222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1292  hypothetical protein  31.4 
 
 
308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  30.36 
 
 
254 aa  128  7.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  28.96 
 
 
241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  33.04 
 
 
236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4173  hypothetical protein  30.7 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  30.13 
 
 
247 aa  126  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  31.05 
 
 
246 aa  122  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1837  protein of unknown function DUF45  29.25 
 
 
247 aa  122  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  34.64 
 
 
221 aa  122  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  34.96 
 
 
227 aa  122  6e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4010  hypothetical protein  30.36 
 
 
253 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  31.7 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3692  hypothetical protein  29.71 
 
 
314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3377  hypothetical protein  30.83 
 
 
320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  32.02 
 
 
249 aa  120  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>