More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2027 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
691 aa  1394    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  51.15 
 
 
660 aa  644    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  52.09 
 
 
666 aa  700    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  62.07 
 
 
692 aa  832    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  52.35 
 
 
697 aa  699    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  48.2 
 
 
675 aa  634  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  46.74 
 
 
677 aa  607  9.999999999999999e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  45.51 
 
 
666 aa  593  1e-168  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  43.98 
 
 
713 aa  581  1e-164  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  43.27 
 
 
679 aa  533  1e-150  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  44.08 
 
 
673 aa  519  1e-146  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  41.3 
 
 
655 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  43.51 
 
 
674 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  42.44 
 
 
673 aa  513  1e-144  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  40.71 
 
 
685 aa  514  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  41.99 
 
 
671 aa  509  1e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  42.84 
 
 
671 aa  503  1e-141  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  38.49 
 
 
670 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1806  chemotaxis protein CheA  38.35 
 
 
670 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.917647  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 
696 aa  495  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  38.23 
 
 
667 aa  489  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  38.23 
 
 
667 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  38.52 
 
 
667 aa  488  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1343  CheA signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 
653 aa  489  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0441377  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  40.37 
 
 
681 aa  483  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1696  chemotaxis protein CheA  38.4 
 
 
672 aa  481  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3650  chemotaxis protein CheA  38.96 
 
 
667 aa  478  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  37.48 
 
 
701 aa  474  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1547  CheA signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 
656 aa  473  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 
695 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 
729 aa  437  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0059  CheA signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 
675 aa  434  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.850831  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1856  CheA signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 
658 aa  424  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2284  CheA signal transduction histidine kinases  36.62 
 
 
702 aa  425  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0943  CheA signal transduction histidine kinases  34.52 
 
 
660 aa  419  1e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1414  CheA signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 
664 aa  410  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0249  CheA signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 
649 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818648  normal  0.0240332 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 
719 aa  401  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 
694 aa  394  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 
650 aa  386  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 
686 aa  389  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
687 aa  385  1e-105  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2311  CheA signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 
690 aa  383  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2920  CheA signal transduction histidine kinase  33 
 
 
685 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.038084  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2828  CheA signal transduction histidine kinase  33.29 
 
 
685 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3146  CheA signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
671 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1336  CheA signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 
657 aa  385  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280744  normal  0.428976 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  33.29 
 
 
682 aa  381  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  47.06 
 
 
774 aa  382  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1491  chemotaxis protein CheA  31.42 
 
 
801 aa  377  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0942  CheA signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 
670 aa  376  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  33.76 
 
 
681 aa  376  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  46.73 
 
 
783 aa  378  1e-103  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2888  CheA signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 
671 aa  377  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  43.89 
 
 
803 aa  373  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2736  CheA signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 
687 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0755  CheA signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 
688 aa  375  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0128541 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  45.79 
 
 
770 aa  375  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2222  chemotaxis protein CheA  33.76 
 
 
692 aa  372  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  43.21 
 
 
769 aa  371  1e-101  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  33.29 
 
 
700 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  46.67 
 
 
785 aa  371  1e-101  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  42.98 
 
 
769 aa  369  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  45.45 
 
 
770 aa  369  1e-101  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0740  CheA signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 
686 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  42.89 
 
 
770 aa  369  1e-100  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  47.78 
 
 
606 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 
677 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0567  CheA signal transduction histidine kinases  33.56 
 
 
729 aa  366  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176437  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 
919 aa  366  1e-100  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 
920 aa  368  1e-100  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  42.98 
 
 
769 aa  368  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 
957 aa  364  2e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  39.49 
 
 
919 aa  365  2e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  31.99 
 
 
758 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2123  CheA signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
701 aa  365  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  47.58 
 
 
1089 aa  365  2e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  32.77 
 
 
705 aa  364  3e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  45.94 
 
 
1031 aa  363  5.0000000000000005e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  33.79 
 
 
720 aa  363  7.0000000000000005e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  48.04 
 
 
601 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2263  CheA signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 
741 aa  363  7.0000000000000005e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0131466 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 
684 aa  362  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3299  CheA signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 
671 aa  362  2e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 
688 aa  360  4e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1543  two component signalling adaptor domain-containing protein  42.93 
 
 
468 aa  360  4e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.322642  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 
652 aa  360  4e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  32.45 
 
 
720 aa  360  4e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  43.24 
 
 
745 aa  360  6e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 
702 aa  359  8e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  32.27 
 
 
715 aa  359  9e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  47.19 
 
 
954 aa  359  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  33.14 
 
 
674 aa  358  1.9999999999999998e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 
654 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  32.33 
 
 
655 aa  358  2.9999999999999997e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
695 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  32.95 
 
 
662 aa  357  5e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  33.67 
 
 
669 aa  356  7.999999999999999e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0774  CheA signal transduction histidine kinase  47.19 
 
 
1030 aa  356  1e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142014 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  47.12 
 
 
610 aa  355  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>