289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1717 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1717  cell envelope-related transcriptional attenuator  100 
 
 		 379 aa  767    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0474676  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0666  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.9 
 
 		 377 aa  292  5e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0727  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.99 
 
 		 308 aa  167  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0775994  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3102  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.99 
 
 		 311 aa  143  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4120  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.24 
 
 		 445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000955467  unclonable  0.000000000378568 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2873  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.68 
 
 		 475 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1399  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.34 
 
 		 414 aa  117  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1921  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.67 
 
 		 406 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1252  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.06 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912522  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0411  cell envelope-like transcriptional attenuator  31.14 
 
 		 472 aa  106  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3223  cell envelope-like transcriptional attenuator  30.77 
 
 		 471 aa  104  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3112  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.4 
 
 		 419 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132049  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2095  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.03 
 
 		 411 aa  102  9e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1138  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.17 
 
 		 481 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1109  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.17 
 
 		 481 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3582  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.92 
 
 		 492 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0640  transcriptional regulator, putative  25.86 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00230389  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2524  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.53 
 
 		 492 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2377  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.18 
 
 		 344 aa  100  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00145979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1360  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.15 
 
 		 436 aa  99.8  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2604  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.05 
 
 		 471 aa  99.8  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.22991 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1830  LytR family transcription antiterminator  27.53 
 
 		 333 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.241912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1804  LytR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 333 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00220424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1973  LytR family transcription antiterminator  27.53 
 
 		 333 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2008  transcription antiterminator, LytR family  27.53 
 
 		 333 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.0610299999999994e-43 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2953  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.01 
 
 		 502 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873931 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1975  transcription antiterminator, LytR family  27.53 
 
 		 333 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.258453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2056  LytR family transcription antiterminator  27.53 
 
 		 333 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00905786  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1787  LytR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 335 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2078  transcription antiterminator, LytR family  27.53 
 
 		 333 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542577  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1138  transcription attenuator LytR  27.98 
 
 		 405 aa  98.6  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.195072  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1115  hypothetical protein  27.98 
 
 		 405 aa  98.6  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.108667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3352  transcription antiterminator, LytR family  27.13 
 
 		 335 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  hitchhiker  0.0000000000000086496 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2090  transcription regulator LytR-like protein  27.5 
 
 		 437 aa  97.4  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.853394  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3243  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.92 
 
 		 335 aa  96.7  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0400  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.06 
 
 		 308 aa  96.3  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000257107  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1572  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.8 
 
 		 384 aa  96.3  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0072424  normal  0.757675 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1838  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.72 
 
 		 333 aa  95.9  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1973  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.37 
 
 		 418 aa  96.3  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.554316  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3735  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.08 
 
 		 383 aa  93.2  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2378  cell envelope-related function transcriptional attenuator  27.14 
 
 		 437 aa  93.2  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0983623  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4100  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.37 
 
 		 426 aa  92.8  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000199964  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1499  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.32 
 
 		 329 aa  92.4  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3430  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.1 
 
 		 439 aa  92  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0225853  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0861  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.37 
 
 		 378 aa  92.4  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13390  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.93 
 
 		 405 aa  90.9  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  27.55 
 
 		 375 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  27.55 
 
 		 375 aa  89.7  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  27.55 
 
 		 375 aa  89.7  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 375 aa  89.7  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 375 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1857  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.49 
 
 		 456 aa  89.4  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.046941  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  27.55 
 
 		 377 aa  89  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5319  transcription antiterminator, LytR family  28.36 
 
 		 374 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5640  transcription antiterminator, LytR family  27.17 
 
 		 372 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000247251 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2090  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.19 
 
 		 417 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  27.24 
 
 		 377 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1641  cell envelope-related function transcriptional attenuator  29.95 
 
 		 314 aa  88.6  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1232  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.79 
 
 		 377 aa  87.4  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.113674  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0572  LytR family transcription antiterminator  27.05 
 
 		 337 aa  87  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3856  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.69 
 
 		 451 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2366  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.53 
 
 		 319 aa  87  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000181907  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0516  LytR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 337 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0605  LytR family transcription antiterminator  27.05 
 
 		 333 aa  86.7  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0661  transcription antiterminator, LytR family  27.05 
 
 		 338 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34714e-25 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0125  putative transcriptional regulator  27.18 
 
 		 380 aa  86.3  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00440963  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0519  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.67 
 
 		 338 aa  86.7  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3272  membrane-bound transcriptional regulator LytR  27.91 
 
 		 310 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000512755  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0673  LytR family transcription antiterminator  27.05 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0516  LytR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0643  transcription antiterminator, LytR family  27.24 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.849345  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2282  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.25 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.072814  hitchhiker  0.000000103578 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0523  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.1 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3046  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.14 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.634845  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4992  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.06 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0732  transcription antiterminator, LytR family  26.83 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0803  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.05 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3385  membrane-bound transcriptional regulator LytR  24.22 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4695  transcription antiterminator, LytR family  27.05 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.541641  hitchhiker  0.0000000308245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0369  cell envelope-related transcriptional attenuator  23.97 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.117824  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1875  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.5 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0893  cell envelope-related transcriptional attenuator  25 
 
 		 453 aa  82  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.301121  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01650  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  30.35 
 
 		 512 aa  79.3  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.475151  hitchhiker  0.0000000000510123 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1295  cell envelope-related transcriptional attenuator  30 
 
 		 407 aa  79.3  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.865299 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08290  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  28.77 
 
 		 443 aa  78.6  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154905  normal  0.235154 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3000  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.98 
 
 		 495 aa  77.4  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0694  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.97 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12922  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0838  transcription antiterminator, LytR family  25.97 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0946  transcription antiterminator, LytR family  25.54 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5115  membrane-bound transcriptional regulator LytR  25.99 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0189  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.03 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5506  membrane-bound transcriptional regulator LytR  25.99 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00691653  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0131  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.48 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763008  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1893  transcriptional regulator, putative  27.02 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4961  membrane-bound transcriptional regulator LytR  25.99 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0205697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0875  LytR family transcription antiterminator  25.54 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0676567  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5436  membrane-bound transcriptional regulator LytR  27.17 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4498  transcription antiterminator, LytR family  25.97 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000182536 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1005  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.68 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1762  cell envelope-like transcriptional attenuator  25.43 
 
 		 501 aa  73.2  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.103676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>