More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4072 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4072  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
349 aa  690    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3118  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  66.86 
 
 
351 aa  434  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58644  hitchhiker  0.000268199 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2011  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  67.06 
 
 
353 aa  428  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251769  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3567  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  65.37 
 
 
341 aa  427  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3946  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  65.37 
 
 
341 aa  426  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.182306 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0420  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  65.78 
 
 
349 aa  422  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04750  aspartate semialdehyde dehydrogenase  65.4 
 
 
351 aa  419  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148631  normal  0.366331 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0505  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  62.75 
 
 
356 aa  417  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0695  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  65.12 
 
 
353 aa  413  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36370  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  63.45 
 
 
349 aa  413  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3981  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  64.99 
 
 
341 aa  410  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0463  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  64.2 
 
 
342 aa  409  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.411307  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0560  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  65.01 
 
 
355 aa  410  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5256  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  64.79 
 
 
344 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.506217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4888  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  64.79 
 
 
344 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0210913  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1305  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  63.64 
 
 
347 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.918677 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0322  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  63.93 
 
 
341 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.875332  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4977  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  64.79 
 
 
344 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5503  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  64.69 
 
 
344 aa  404  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28310  aspartate semialdehyde dehydrogenase  58.03 
 
 
365 aa  380  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13740  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  62.76 
 
 
345 aa  380  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.363884  normal  0.189001 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0283  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  62.46 
 
 
366 aa  380  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19630  aspartate semialdehyde dehydrogenase  57.73 
 
 
365 aa  374  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00392335 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0130  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.6 
 
 
355 aa  365  1e-100  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0112  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.44 
 
 
341 aa  322  6e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.241314  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1047  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 
339 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00486598  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0604  aspartate semialdehyde dehydrogenase  51.6 
 
 
339 aa  310  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000271293  hitchhiker  0.00940362 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01262  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.71 
 
 
341 aa  309  4e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0724  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.41 
 
 
344 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.675858  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1265  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.99 
 
 
336 aa  307  2.0000000000000002e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0945  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.62 
 
 
336 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0640  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.41 
 
 
344 aa  307  2.0000000000000002e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3351  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.73 
 
 
339 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0830053 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2854  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.54 
 
 
342 aa  304  2.0000000000000002e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.923137  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2986  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.7 
 
 
332 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0787481  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0910  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.44 
 
 
339 aa  301  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000070881  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1186  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.69 
 
 
344 aa  301  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1106  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.68 
 
 
340 aa  300  2e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0598378  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1903  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.27 
 
 
339 aa  300  3e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116797  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2382  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.69 
 
 
349 aa  298  7e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0328  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.98 
 
 
349 aa  298  7e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.06 
 
 
335 aa  298  9e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.133119  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1757  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.81 
 
 
341 aa  298  1e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.783502  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2274  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.84 
 
 
348 aa  298  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0254  aspartate semialdehyde dehydrogenase  49.56 
 
 
348 aa  297  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0338  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.81 
 
 
344 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3908  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.38 
 
 
344 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0997  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.65 
 
 
328 aa  296  3e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2220  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.69 
 
 
340 aa  296  3e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.763212  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4232  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.38 
 
 
344 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0846709 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1135  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.06 
 
 
333 aa  296  4e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2160  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.8 
 
 
325 aa  295  7e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0344  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.23 
 
 
344 aa  295  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.034026 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4363  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.09 
 
 
344 aa  295  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1808  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.13 
 
 
340 aa  294  1e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.996773  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0493  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.94 
 
 
344 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.60024  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_845  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.95 
 
 
338 aa  293  3e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.514485  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1871  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.8 
 
 
325 aa  293  4e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3482  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.28 
 
 
348 aa  292  6e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.513143 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1731  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.92 
 
 
340 aa  292  7e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0683511  hitchhiker  0.00261875 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2074  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.92 
 
 
340 aa  292  7e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0229  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.36 
 
 
344 aa  291  8e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4618  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.66 
 
 
342 aa  291  9e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0687  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.88 
 
 
337 aa  291  1e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0972  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.66 
 
 
338 aa  290  2e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2664  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.54 
 
 
341 aa  290  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2876  aspartate semialdehyde dehydrogenase  47.25 
 
 
341 aa  290  2e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0863  aspartate semialdehyde dehydrogenase  47.66 
 
 
338 aa  290  2e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1426  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.23 
 
 
359 aa  289  4e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1941  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.06 
 
 
340 aa  289  4e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.733379  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3384  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.09 
 
 
344 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2214  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.8 
 
 
344 aa  288  7e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244055  normal  0.319963 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2183  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.92 
 
 
329 aa  287  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3514  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.08 
 
 
357 aa  287  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000101086 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3170  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.09 
 
 
348 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5289  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.45 
 
 
347 aa  287  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2990  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.51 
 
 
339 aa  287  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.478455  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3032  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.51 
 
 
339 aa  287  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3899  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.37 
 
 
348 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00229604  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1400  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.37 
 
 
348 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00002128  hitchhiker  5.26638e-21 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0887  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.96 
 
 
344 aa  286  4e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3182  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.22 
 
 
344 aa  286  4e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3290  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.67 
 
 
344 aa  286  4e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378777  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0831  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.96 
 
 
344 aa  286  4e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3838  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.08 
 
 
348 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.747438  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0237  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.36 
 
 
344 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00833547 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3848  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.08 
 
 
348 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000145815  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0961  aspartate semialdehyde dehydrogenase  44.87 
 
 
332 aa  285  7e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3660  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.87 
 
 
329 aa  285  7e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.487501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3560  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.08 
 
 
349 aa  285  7e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0433298  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1848  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.99 
 
 
354 aa  285  7e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.301002 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2465  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.35 
 
 
347 aa  285  8e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.844771  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1248  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.82 
 
 
340 aa  285  8e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207297  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2926  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.8 
 
 
348 aa  285  8e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3652  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.08 
 
 
349 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0452792  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3542  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.08 
 
 
349 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000959699  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2392  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.22 
 
 
347 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3937  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.08 
 
 
348 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00621767  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3593  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.36 
 
 
344 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3185  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.65 
 
 
344 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>