30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2237 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2237  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 198 aa  370  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1983  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0677  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 254 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 235 aa  45.1  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2591  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 204 aa  44.7  0.0009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3397  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00851285  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  37.8 
 
 		 218 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5559  transcriptional regulator GntR family  44.64 
 
 		 252 aa  43.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3609  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  37.84 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  43.48 
 
 		 221 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4215  transcriptional regulator, GntR family  47.83 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.162899  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11670  transcriptional regulator  36.19 
 
 		 210 aa  42  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615947  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6449  transcriptional regulator, GntR family  42.67 
 
 		 236 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  normal  0.091376 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2126  transcriptional regulator, GntR family  39.19 
 
 		 215 aa  42  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1479  transcriptional regulator, GntR family  45.9 
 
 		 256 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  38.2 
 
 		 224 aa  42  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 219 aa  42  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 211 aa  42  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3643  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 		 239 aa  41.6  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0240  GntR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 228 aa  41.6  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  58.54 
 
 		 221 aa  41.2  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 232 aa  41.2  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 229 aa  41.2  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 218 aa  41.2  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 223 aa  41.2  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4183  regulatory protein GntR HTH  41.27 
 
 		 222 aa  41.2  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>