More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1326 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 180 aa  365  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  55.37 
 
 		 198 aa  189  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  52.25 
 
 		 189 aa  167  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  51.41 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  50.57 
 
 		 183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  50.84 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  50.28 
 
 		 185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  51.14 
 
 		 184 aa  160  7e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  50.82 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  50.57 
 
 		 183 aa  156  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  47.25 
 
 		 186 aa  152  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  48.89 
 
 		 190 aa  150  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  49.44 
 
 		 191 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  48.35 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  47.19 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  48.9 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  47.8 
 
 		 205 aa  148  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  47.8 
 
 		 205 aa  148  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  48.37 
 
 		 205 aa  147  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  47.75 
 
 		 190 aa  147  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  47.22 
 
 		 185 aa  147  8e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  47.54 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  46.67 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  45.05 
 
 		 182 aa  145  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  47.78 
 
 		 186 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  46.96 
 
 		 186 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  46.96 
 
 		 186 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  46.96 
 
 		 186 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  46.37 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  45.56 
 
 		 183 aa  137  7.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  43.09 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  40.54 
 
 		 181 aa  136  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  43.09 
 
 		 192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  43.09 
 
 		 196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  44.02 
 
 		 197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 		 201 aa  134  5e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  42.54 
 
 		 206 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  42.54 
 
 		 206 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  42.46 
 
 		 193 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 		 199 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  40.22 
 
 		 188 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  45.58 
 
 		 183 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  47.22 
 
 		 184 aa  133  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  41.9 
 
 		 193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  40.98 
 
 		 194 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  41.9 
 
 		 193 aa  132  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  41.9 
 
 		 180 aa  132  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  41.9 
 
 		 193 aa  131  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  41.9 
 
 		 193 aa  131  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  45.76 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  42.78 
 
 		 195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4885  resolvase domain-containing protein  41.48 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  45 
 
 		 181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5122  resolvase domain-containing protein  41.81 
 
 		 290 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  42.37 
 
 		 191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  41.99 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  43.09 
 
 		 188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  42.37 
 
 		 191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  41.76 
 
 		 185 aa  128  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  41.44 
 
 		 185 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  45.06 
 
 		 194 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  44.9 
 
 		 199 aa  128  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  41.99 
 
 		 185 aa  128  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  39.44 
 
 		 201 aa  127  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  39.34 
 
 		 184 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  41.76 
 
 		 188 aa  127  8.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  39.89 
 
 		 196 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  43.26 
 
 		 194 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  41.81 
 
 		 181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  39.34 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  40.45 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  41.11 
 
 		 193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  37.91 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  38.67 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  37.63 
 
 		 201 aa  125  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  44.14 
 
 		 186 aa  125  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5066  resolvase domain-containing protein  41.81 
 
 		 313 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  43.58 
 
 		 197 aa  124  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  41.36 
 
 		 215 aa  124  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  40.33 
 
 		 185 aa  124  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  39.78 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  41.44 
 
 		 185 aa  123  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  41.44 
 
 		 185 aa  123  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  42.08 
 
 		 186 aa  122  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  42.7 
 
 		 196 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  43.5 
 
 		 198 aa  122  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0747  resolvase domain-containing protein  41.24 
 
 		 181 aa  122  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  45.14 
 
 		 209 aa  121  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  40.33 
 
 		 188 aa  121  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  38.92 
 
 		 196 aa  121  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  44.83 
 
 		 191 aa  121  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  38.33 
 
 		 179 aa  121  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0938  site-specific recombinase  50.71 
 
 		 154 aa  120  7e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  38.25 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  40.33 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  42.08 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  42.08 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  42.08 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  42.08 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  42.08 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>