More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0582 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0032  acetoin dehydrogenase, alpha/beta subunit, putative  76.18 
 
 		 729 aa  1097    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3319  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  63.05 
 
 		 724 aa  888    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0163319  hitchhiker  0.00280093 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1571  dehydrogenase E1 component  77.53 
 
 		 728 aa  1100    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0029  putative acetoin dehydrogenase, alpha/beta subunit  76.03 
 
 		 729 aa  1093    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0851607  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2114  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  64.11 
 
 		 726 aa  913    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0490286  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4454  dehydrogenase, E1 component  65.23 
 
 		 726 aa  927    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2782  pyruvate dehydrogenase complex, E1 beta subunit  54.99 
 
 		 727 aa  794    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0582  dehydrogenase E1 component  100 
 
 		 714 aa  1451    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3081  dehydrogenase, E1 component  35.63 
 
 		 675 aa  353  5e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0845423  normal  0.132557 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0419  Transketolase central region  31.64 
 
 		 791 aa  314  3.9999999999999997e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0246116  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2596  dehydrogenase, E1 component  32.82 
 
 		 669 aa  291  4e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.817741  hitchhiker  0.000871115 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0587  dehydrogenase E1 component  32.46 
 
 		 680 aa  276  7e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0704  Transketolase central region  31.22 
 
 		 823 aa  266  1e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0991  dehydrogenase E1 component  32.82 
 
 		 710 aa  265  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.892178  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10943  putative oxidoreductase  30.62 
 
 		 668 aa  263  1e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.345452  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3824  dehydrogenase E1 component  28.86 
 
 		 659 aa  261  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200241  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1486  dehydrogenase E1 component  32.11 
 
 		 657 aa  259  9e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.004553  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2840  dehydrogenase, E1 component  28.92 
 
 		 658 aa  257  5e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479964  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0808  dehydrogenase E1 component  29.15 
 
 		 659 aa  246  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.222813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0566  dehydrogenase E1 component  32.85 
 
 		 666 aa  244  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2793  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  31.78 
 
 		 702 aa  244  5e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3183  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta fusion  28.99 
 
 		 659 aa  236  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.954931 
 
 
-
 
NC_002620  TC0618  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta subunit  29.61 
 
 		 678 aa  231  5e-59  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1786  dehydrogenase, E1 component  31.23 
 
 		 736 aa  227  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3050  pyruvate dehydrogenase (lipoamide)  39.76 
 
 		 332 aa  226  8e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2363  dehydrogenase E1 component  41.41 
 
 		 332 aa  226  2e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.706778  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4117  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  39.24 
 
 		 345 aa  217  7e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.314737  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2033  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  39.87 
 
 		 328 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3049  transketolase, central region  30.8 
 
 		 617 aa  213  7e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3772  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  34.84 
 
 		 320 aa  208  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.514041  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0029  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  34.84 
 
 		 320 aa  209  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0416  pyruvate dehydrogenase complex, E1 component, pyruvate dehydrogenase alpha subunit  38.76 
 
 		 326 aa  205  3e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3019  dehydrogenase, E1 component, alpha and beta subunits  28.35 
 
 		 652 aa  204  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0878  acetoin dehydrogenase, thymine PPi dependent, E1 component, alpha subunit  37.94 
 
 		 322 aa  203  9e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00306772  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1630  dehydrogenase, E1 component  37.86 
 
 		 360 aa  202  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0754823  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  39.6 
 
 		 327 aa  201  5e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  39.6 
 
 		 327 aa  201  5e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  39.2 
 
 		 328 aa  201  6e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  37.35 
 
 		 324 aa  201  6e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1505  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  39.68 
 
 		 345 aa  200  7e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0721667  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5126  Transketolase central region  39.43 
 
 		 327 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1036  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, alpha subunit  37.46 
 
 		 323 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0124954  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0525  pyruvate dehydrogenase (lipoamide)  38.08 
 
 		 356 aa  198  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.3038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4083  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  41.84 
 
 		 326 aa  198  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.273828 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1218  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  34.49 
 
 		 322 aa  198  3e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2539  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component alpha subunit  39.26 
 
 		 332 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  37.96 
 
 		 328 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2588  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 alpha-subunit  39.26 
 
 		 332 aa  197  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2776  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 alpha-subunit  39.26 
 
 		 332 aa  197  6e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2505  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component alpha subunit  39.26 
 
 		 332 aa  197  7e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2230  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  38.75 
 
 		 346 aa  197  7e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.753771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2780  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 alpha-subunit  39.26 
 
 		 332 aa  197  7e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0316753 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  36.67 
 
 		 328 aa  196  9e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  38.51 
 
 		 328 aa  195  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2059  dehydrogenase E1 component  37.34 
 
 		 346 aa  194  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.736481  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2825  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 alpha-subunit  39.26 
 
 		 332 aa  195  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.555621  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  37.96 
 
 		 332 aa  194  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1603  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  37.22 
 
 		 348 aa  194  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0112007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0171  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  35.33 
 
 		 331 aa  194  4e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  37.25 
 
 		 325 aa  194  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  37.35 
 
 		 324 aa  194  6e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0936  acetoin catabolism protein AcoB  36.5 
 
 		 339 aa  194  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1908  pyruvate dehydrogenase (lipoamide)  38.53 
 
 		 381 aa  194  7e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2578  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  38.93 
 
 		 332 aa  194  7e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000958625  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1224  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  40.38 
 
 		 376 aa  193  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.42946  normal  0.749975 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1796  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  36.89 
 
 		 348 aa  193  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.281194  hitchhiker  0.0011937 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2804  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 alpha-subunit  38.93 
 
 		 332 aa  193  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.151867  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1944  pyruvate dehydrogenase (lipoamide)  37.7 
 
 		 342 aa  193  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.13679  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4805  Transketolase central region  37.84 
 
 		 337 aa  192  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2909  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  38.51 
 
 		 349 aa  192  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6515  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  37.54 
 
 		 346 aa  192  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0599  transketolase central region  35.03 
 
 		 340 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315571  normal  0.029192 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1881  pyruvate dehydrogenase (lipoamide)  38.11 
 
 		 336 aa  192  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1404  transketolase, central region  39.51 
 
 		 330 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0127505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1491  transketolase  36.67 
 
 		 327 aa  192  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2846  transketolase central region  40.48 
 
 		 325 aa  191  5e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00429271  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  33.23 
 
 		 325 aa  191  5.999999999999999e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4178  Transketolase central region  34.45 
 
 		 328 aa  190  7e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008867 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0554  acetoin dehydrogenase, beta subunit  34.73 
 
 		 340 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0593  transketolase, central region  34.73 
 
 		 340 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.90523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5154  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  37.76 
 
 		 360 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3038  transketolase central region  38.49 
 
 		 325 aa  189  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4984  transketolase, central region  36.39 
 
 		 335 aa  189  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.670882 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0220  pyruvate dehydrogenase complex, E1 component, pyruvate dehydrogenase alpha subunit  35.47 
 
 		 327 aa  189  1e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.212045  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3069  pyruvate dehydrogenase, E1 component, pyruvate dehydrogenase beta subunit  37.34 
 
 		 326 aa  189  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.829686  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2675  Transketolase central region  37.34 
 
 		 326 aa  189  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5896  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  37.62 
 
 		 346 aa  189  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.766336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0856  putative 2-oxo acid dehydrogenase beta subunit  41.22 
 
 		 324 aa  189  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.389429  normal  0.709595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5215  Transketolase central region  39.6 
 
 		 343 aa  188  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1776  transketolase, central region  37.58 
 
 		 334 aa  189  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174657  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2770  pyruvate dehydrogenase subunit beta  36.75 
 
 		 467 aa  188  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0988  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  37.54 
 
 		 361 aa  188  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0916856  normal  0.876159 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0589  transketolase, central region  37.62 
 
 		 331 aa  188  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3014  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  37.86 
 
 		 349 aa  187  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.449207  normal  0.161117 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  37.73 
 
 		 324 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0802  pyruvate dehydrogenase complex, E1 component, pyruvate dehydrogenase alpha subunit  37.37 
 
 		 334 aa  187  4e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.565164  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2786  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  37.86 
 
 		 349 aa  187  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1267  transketolase, central region  35.76 
 
 		 328 aa  187  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5078  transketolase, central region  37.3 
 
 		 327 aa  187  5e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0584  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  37.54 
 
 		 338 aa  187  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.576457  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>