More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3394 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2930  AMP-dependent synthetase and ligase  71.19 
 
 
1912 aa  2727    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0842557 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3394  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
1823 aa  3730    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3202  AMP-dependent synthetase and ligase  71.13 
 
 
1912 aa  2740    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.213364 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  33.84 
 
 
656 aa  255  5.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  34.52 
 
 
650 aa  254  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  34.49 
 
 
666 aa  254  1e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  33.33 
 
 
638 aa  251  7e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  33.46 
 
 
667 aa  251  1e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  33.08 
 
 
666 aa  249  3e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2810  acetate/CoA ligase  33.4 
 
 
674 aa  248  6.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  33.73 
 
 
650 aa  248  8e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  32.68 
 
 
655 aa  247  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1451  acetyl-CoA synthetase  32 
 
 
651 aa  247  1.9999999999999999e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2043  acetyl-CoA synthetase  34.75 
 
 
662 aa  246  3e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  32.88 
 
 
660 aa  244  7.999999999999999e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12630  acetyl-coenzyme A synthetase  32.7 
 
 
658 aa  244  1e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406293  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1385  acetyl-coenzyme A synthetase  32.29 
 
 
633 aa  244  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1791  acetyl-CoA synthetase  32.85 
 
 
650 aa  243  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  32.76 
 
 
654 aa  243  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2652  acetyl-CoA synthetase  33.53 
 
 
654 aa  243  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.822271  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  33.73 
 
 
656 aa  243  2.9999999999999997e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  33.72 
 
 
648 aa  243  2.9999999999999997e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  33.78 
 
 
661 aa  243  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  33 
 
 
657 aa  242  4e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2532  acetyl-CoA synthetase  32.67 
 
 
650 aa  242  5e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165664  hitchhiker  0.000575675 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1748  acetyl-CoA synthetase  32.67 
 
 
650 aa  242  5e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0611  acetate/CoA ligase  33.21 
 
 
667 aa  242  5e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1752  acetyl-CoA synthetase  32.67 
 
 
650 aa  242  5e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5367  acetate/CoA ligase  33.46 
 
 
655 aa  241  6.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657438  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2743  acetyl-CoA synthetase  33.52 
 
 
650 aa  241  8e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  33.2 
 
 
652 aa  241  1e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  32.04 
 
 
649 aa  241  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  35.9 
 
 
668 aa  240  1e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  34.43 
 
 
657 aa  241  1e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1975  acetate--CoA ligase  33.08 
 
 
654 aa  240  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2054  acetyl-CoA synthetase  33.98 
 
 
660 aa  240  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2349  acetyl-CoA synthetase  33.03 
 
 
650 aa  240  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1794  acetyl-CoA synthetase  33.98 
 
 
660 aa  240  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562409  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  32.95 
 
 
654 aa  240  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1939  acetyl-CoA synthetase  33.98 
 
 
660 aa  240  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5520  acetyl-CoA synthetase  33.33 
 
 
660 aa  240  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  31.95 
 
 
673 aa  239  2e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  32.42 
 
 
652 aa  240  2e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2017  acetyl-CoA synthetase  33.53 
 
 
660 aa  240  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0682887  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0530  acetyl-CoA synthetase  33.98 
 
 
660 aa  240  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4701  acetyl-CoA synthetase  32.83 
 
 
644 aa  240  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120403  normal  0.0122351 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0628  acetyl-CoA synthetase  33.98 
 
 
660 aa  240  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185058  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  32.81 
 
 
652 aa  240  2e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2109  acetyl-CoA synthetase  33.14 
 
 
660 aa  240  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.712905  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1081  acetyl-CoA synthetase  33.98 
 
 
660 aa  240  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.476732  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0788  acetyl-CoA synthetase  33.98 
 
 
660 aa  240  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5891  acetyl-CoA synthetase  32.75 
 
 
664 aa  239  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2079  acetyl-CoA synthetase  32.74 
 
 
650 aa  239  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  33.14 
 
 
660 aa  239  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5450  acetyl-CoA synthetase  33.8 
 
 
645 aa  239  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820254  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6158  acetyl-CoA synthetase  32.75 
 
 
664 aa  239  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560029  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  33.8 
 
 
645 aa  239  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42750  acetyl-CoA synthetase  33.4 
 
 
645 aa  239  5.0000000000000005e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.74253  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2216  acetyl-CoA synthetase  33.4 
 
 
660 aa  239  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187269  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2523  acetyl-CoA synthetase  32.97 
 
 
650 aa  239  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2230  acetyl-CoA synthetase  33.14 
 
 
660 aa  238  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5886  acetyl-CoA synthetase  33.2 
 
 
660 aa  238  7e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2191  acetyl-CoA synthetase  33.2 
 
 
660 aa  238  7e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  32.38 
 
 
660 aa  238  7e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  32.84 
 
 
654 aa  238  9e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0467  acetyl-CoA synthetase  32.67 
 
 
652 aa  238  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  31.36 
 
 
638 aa  238  1.0000000000000001e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  33.27 
 
 
645 aa  237  1.0000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3238  acetyl-CoA synthetase  33.2 
 
 
664 aa  237  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  32.11 
 
 
660 aa  237  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2747  acetate--CoA ligase  36.26 
 
 
666 aa  237  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2362  acetyl-CoA synthetase  32.97 
 
 
650 aa  237  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0493483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2434  acetyl-CoA synthetase  32.97 
 
 
650 aa  237  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5130  acetyl-CoA synthetase  33.2 
 
 
664 aa  237  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  32.11 
 
 
660 aa  237  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  32.82 
 
 
670 aa  238  1.0000000000000001e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  31.91 
 
 
666 aa  237  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002199  acetyl-coenzyme A synthetase  31.29 
 
 
650 aa  237  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5151  acetyl-CoA synthetase  33.01 
 
 
664 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  30.98 
 
 
664 aa  236  3e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0042  acetyl-CoA synthetase  31.35 
 
 
647 aa  236  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  35.71 
 
 
655 aa  236  3e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  31.95 
 
 
657 aa  236  4.0000000000000004e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4702  acetyl-CoA synthetase  32.26 
 
 
644 aa  235  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105105 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2229  acetyl-CoA synthetase  33.2 
 
 
660 aa  235  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0983  acetate/CoA ligase  35.11 
 
 
665 aa  235  5e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1067  acetyl-coenzyme A synthetase  35.11 
 
 
665 aa  235  5e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0785077  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1499  acetate/CoA ligase  33.53 
 
 
661 aa  235  5e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00738243  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  32.28 
 
 
656 aa  235  6e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  33.07 
 
 
656 aa  235  6e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  32.2 
 
 
661 aa  235  7.000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00169  acetyl-CoA synthetase  31.47 
 
 
682 aa  235  7.000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0865  acetyl-coenzyme A synthetase  32.67 
 
 
649 aa  235  7.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  31.92 
 
 
644 aa  235  7.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1085  acetyl-CoA synthetase  33.6 
 
 
660 aa  235  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379038  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  33.13 
 
 
649 aa  234  8.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4567  acetyl-CoA synthetase  32.26 
 
 
644 aa  234  9e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5976  acetyl-CoA synthetase  33.53 
 
 
680 aa  234  9e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0371909 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1380  acetyl-CoA synthetase  33.66 
 
 
653 aa  234  9e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.110945  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1744  acetyl-CoA synthetase  32.61 
 
 
651 aa  234  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>