More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1068 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1068  lipoyl synthase  100 
 
 		 300 aa  629  1e-179  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.595  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1316  lipoyl synthase  69.78 
 
 		 294 aa  426  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1277  lipoyl synthase  65.72 
 
 		 287 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1213  lipoyl synthase  64.62 
 
 		 292 aa  371  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1370  lipoyl synthase  59.42 
 
 		 288 aa  355  5e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.472643 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1084  lipoyl synthase  59.85 
 
 		 291 aa  354  1e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1149  lipoyl synthase  57.93 
 
 		 292 aa  338  4e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025967  normal  0.19755 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2714  lipoyl synthase  53.57 
 
 		 291 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.171225  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  53.82 
 
 		 283 aa  310  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  51.27 
 
 		 298 aa  308  5e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  50.71 
 
 		 304 aa  308  9e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  50.69 
 
 		 321 aa  306  3e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  53.26 
 
 		 328 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  48.96 
 
 		 290 aa  303  3.0000000000000004e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  50 
 
 		 288 aa  302  4.0000000000000003e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  49.08 
 
 		 299 aa  299  3e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2076  lipoyl synthase  52.35 
 
 		 299 aa  296  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.39872  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1762  lipoyl synthase  53.6 
 
 		 296 aa  296  4e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0164606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  48.39 
 
 		 321 aa  296  4e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6533  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 320 aa  295  5e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2841  lipoyl synthase  49.11 
 
 		 319 aa  295  5e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176893  hitchhiker  0.000447826 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0467  lipoyl synthase  50.35 
 
 		 321 aa  295  6e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00091244  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  48.92 
 
 		 325 aa  295  7e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  48.73 
 
 		 299 aa  295  8e-79  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2079  lipoyl synthase  52.8 
 
 		 298 aa  294  9e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.069299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  48.24 
 
 		 302 aa  295  9e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1401  lipoyl synthase  51.06 
 
 		 300 aa  294  1e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  47.57 
 
 		 291 aa  294  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  48.38 
 
 		 292 aa  294  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  50.9 
 
 		 324 aa  293  3e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5924  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 320 aa  293  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0979  lipoyl synthase  48.96 
 
 		 321 aa  292  4e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.464322  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004228  lipoate synthase  49.65 
 
 		 321 aa  292  5e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000803554  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  50 
 
 		 282 aa  292  6e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0315  lipoyl synthase  48.94 
 
 		 314 aa  291  6e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2970  lipoyl synthase  50.35 
 
 		 321 aa  291  7e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1553  lipoyl synthase  49.28 
 
 		 320 aa  291  7e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.108222  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0110  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 322 aa  291  1e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2662  lipoyl synthase  51.07 
 
 		 281 aa  290  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2955  lipoyl synthase  49.31 
 
 		 321 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000378828  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3460  lipoyl synthase  50 
 
 		 321 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633504  normal  0.0256244 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3202  lipoyl synthase  46.59 
 
 		 292 aa  290  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3027  lipoyl synthase  49.31 
 
 		 321 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3282  lipoyl synthase  50 
 
 		 321 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0177206  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1085  lipoyl synthase  50 
 
 		 321 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00323584  hitchhiker  0.0000378022 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01649  lipoyl synthase  49.28 
 
 		 320 aa  290  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00769873  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3189  lipoyl synthase  47.45 
 
 		 290 aa  290  2e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.411626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1855  lipoyl synthase  49.31 
 
 		 321 aa  290  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000137205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01211  lipoyl synthase  47.97 
 
 		 321 aa  290  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3324  lipoyl synthase  50 
 
 		 321 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0295877  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  48.38 
 
 		 318 aa  290  3e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  48.73 
 
 		 303 aa  289  4e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  48.73 
 
 		 303 aa  289  4e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2595  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 321 aa  289  4e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0686543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2942  lipoyl synthase  50 
 
 		 321 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000018983  hitchhiker  0.00758797 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3156  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 321 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000010408  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0238  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 294 aa  288  7e-77  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.39899  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 355 aa  288  8e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0688  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 321 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0734  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 321 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0674  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 321 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00338135  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4375  lipoyl synthase  48.57 
 
 		 307 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  47.81 
 
 		 297 aa  287  1e-76  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0867  lipoyl synthase  49.28 
 
 		 321 aa  287  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.719819  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0792  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 321 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0748  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 321 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  46.79 
 
 		 321 aa  286  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1195  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 321 aa  286  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3897  lipoyl synthase  49.09 
 
 		 317 aa  287  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.576703 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00597  lipoyl synthase  50 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.361475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2998  lipoic acid synthetase  50 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448089  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0679  lipoyl synthase  50 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215695  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1439  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 319 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.115253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0716  lipoyl synthase  50 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000187845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3017  lipoyl synthase  50 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0056635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0542  lipoyl synthase  50 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0652  lipoyl synthase  50 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000125268  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0648  lipoyl synthase  50 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.017557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00586  hypothetical protein  50 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1086  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 321 aa  286  4e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2572  lipoyl synthase  49.45 
 
 		 319 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.085231  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3715  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 321 aa  286  4e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00165797  hitchhiker  0.00474747 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  48.01 
 
 		 320 aa  285  5e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  46.93 
 
 		 315 aa  285  5.999999999999999e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  46.93 
 
 		 315 aa  285  5.999999999999999e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0692  lipoyl synthase  49.28 
 
 		 321 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 309 aa  285  7e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2876  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 321 aa  285  8e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0754529  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1049  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 321 aa  285  8e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710809  hitchhiker  0.0056856 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  48.94 
 
 		 351 aa  285  9e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1175  lipoyl synthase  49.29 
 
 		 321 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000143147  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  48.04 
 
 		 287 aa  284  1.0000000000000001e-75  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0241  lipoyl synthase  48.39 
 
 		 312 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.395057  normal  0.45798 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1163  lipoyl synthase  48.26 
 
 		 321 aa  284  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3030  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 322 aa  283  2.0000000000000002e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.464318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04289  lipoyl synthase  48.94 
 
 		 327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  47.5 
 
 		 325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  50.53 
 
 		 298 aa  283  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0984  lipoyl synthase  49.28 
 
 		 321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.10688  normal  0.0219109 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0988  lipoyl synthase  49.28 
 
 		 321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0584288  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>