More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7445 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7445  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  100 
 
 
418 aa  821    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3703  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  48.16 
 
 
433 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.353792  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3690  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  48.16 
 
 
433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3763  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  48.16 
 
 
433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2485  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  46.78 
 
 
430 aa  294  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4169  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  47.15 
 
 
430 aa  275  8e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0752  NADH dehydrogenase (quinone)  35.83 
 
 
505 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2713  NADH dehydrogenase (quinone)  32.5 
 
 
552 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0109  NADH dehydrogenase (quinone)  32.16 
 
 
656 aa  171  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2708  NADH dehydrogenase I, F subunit  31.11 
 
 
488 aa  170  5e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  31.75 
 
 
624 aa  169  7e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  30.81 
 
 
607 aa  168  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2721  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  32.59 
 
 
570 aa  168  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  30.81 
 
 
607 aa  168  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0472  NADH dehydrogenase (quinone)  29.85 
 
 
594 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.524488  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1168  NADH dehydrogenase (quinone)  29 
 
 
538 aa  164  3e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.073062  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1539  NADH dehydrogenase (quinone)  31.93 
 
 
580 aa  161  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2794  NADH dehydrogenase (quinone)  33.17 
 
 
572 aa  161  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0998  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  38.02 
 
 
408 aa  161  3e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.353019  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  29.4 
 
 
614 aa  160  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1545  NADH dehydrogenase (quinone)  31.93 
 
 
668 aa  160  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  31.39 
 
 
597 aa  160  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  29.19 
 
 
610 aa  159  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0991  NADH dehydrogenase (quinone)  29.47 
 
 
539 aa  158  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  29.47 
 
 
545 aa  159  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  29.78 
 
 
626 aa  158  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1693  NADH dehydrogenase (quinone)  33.99 
 
 
416 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0681624  normal  0.883791 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  29.53 
 
 
545 aa  158  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0914  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  32.13 
 
 
446 aa  158  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0332  NADH dehydrogenase (quinone)  29.1 
 
 
629 aa  157  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  29.03 
 
 
602 aa  157  3e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  31.82 
 
 
421 aa  157  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  29.43 
 
 
614 aa  157  4e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3267  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  34.22 
 
 
572 aa  157  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00072788  normal  0.294343 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0633  NADH dehydrogenase (quinone)  30.98 
 
 
427 aa  156  8e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1628  NADH dehydrogenase (quinone)  30.98 
 
 
427 aa  156  8e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3188  NADH dehydrogenase (quinone)  30.98 
 
 
427 aa  156  8e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4588  NADH dehydrogenase (quinone)  33.86 
 
 
414 aa  155  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.31058  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1740  NADH dehydrogenase (quinone)  33.74 
 
 
416 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0104  respiratory-chain NADH dehydrogenase, 51 kDa subunit  33.99 
 
 
416 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4654  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  31.03 
 
 
535 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1248  NADH dehydrogenase (quinone)  27.97 
 
 
604 aa  155  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.600832  normal  0.0289049 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1701  NADH dehydrogenase (quinone)  31.49 
 
 
604 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0146  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  29.87 
 
 
417 aa  154  4e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.28536  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  28.82 
 
 
597 aa  153  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4067  NADH dehydrogenase (quinone)  33.81 
 
 
428 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0902793  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1147  NADH-quinone oxidoreductase, chain F  31.83 
 
 
426 aa  152  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.450213  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1123  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  30.38 
 
 
429 aa  152  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4427  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  40.35 
 
 
412 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.301864  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0954  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  31.14 
 
 
442 aa  151  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4060  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  30.56 
 
 
443 aa  152  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.306589 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1295  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  31.23 
 
 
436 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  29.88 
 
 
442 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.020872  hitchhiker  0.00762126 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2004  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  29.71 
 
 
442 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462519  normal  0.256027 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_154  [Fe] hydrogenase, HymB subunit  29.5 
 
 
417 aa  151  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2831  NADH dehydrogenase I chain F  30.13 
 
 
425 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2700  NADH dehydrogenase I chain F  30.13 
 
 
425 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  32.16 
 
 
592 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0932  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  30.02 
 
 
431 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.5981  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4458  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  30.05 
 
 
443 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  30.5 
 
 
626 aa  151  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1110  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  30.69 
 
 
569 aa  150  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1046  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  29.65 
 
 
432 aa  150  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0429  NADH dehydrogenase (quinone)  30.08 
 
 
624 aa  149  8e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1096  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  30.13 
 
 
425 aa  149  8e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.763284  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1066  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  30.99 
 
 
436 aa  149  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0842517  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2055  NADH dehydrogenase I subunit F  30.31 
 
 
433 aa  149  8e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517668  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3932  NADH dehydrogenase (quinone)  34.33 
 
 
422 aa  149  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1747  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  30.84 
 
 
439 aa  149  8e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  31.25 
 
 
626 aa  149  9e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3209  putative NADH dehydrogenase I (chain F), NuoF  29.47 
 
 
442 aa  149  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489699  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1209  NADH dehydrogenase I subunit F  30.28 
 
 
433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.335616  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1440  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  30.99 
 
 
436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0584655  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1304  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  30.99 
 
 
436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1080  NADH dehydrogenase I subunit F  30.28 
 
 
433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0225  NADH dehydrogenase (quinone)  28.98 
 
 
417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1632  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  30.51 
 
 
436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  29.11 
 
 
596 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2244  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  30.51 
 
 
436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1824  NADH dehydrogenase I, F subunit  30.75 
 
 
436 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  29.43 
 
 
588 aa  147  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0418  NADH dehydrogenase I, F subunit  30.75 
 
 
436 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1014  NADH dehydrogenase I subunit F  30.03 
 
 
433 aa  147  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0732  NADH dehydrogenase I, F subunit  30.75 
 
 
436 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1135  NADH dehydrogenase I, F subunit  30.75 
 
 
436 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305748  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5572  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  30.27 
 
 
436 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294569  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2161  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  30.27 
 
 
440 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615795  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0979  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  31.5 
 
 
439 aa  146  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1604  NADP-reducing hydrogenase chain C  28.02 
 
 
486 aa  146  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0822  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  28.99 
 
 
426 aa  146  5e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.76792  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0714  NADH dehydrogenase I subunit F  29.47 
 
 
413 aa  147  5e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.657968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1311  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  28.89 
 
 
439 aa  147  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  30.27 
 
 
436 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.121706  normal  0.072136 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0826  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  28.94 
 
 
432 aa  146  6e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.725894  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  30.43 
 
 
427 aa  146  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  30.43 
 
 
427 aa  146  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  31 
 
 
447 aa  146  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0248618 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2479  NADH dehydrogenase (quinone)  31.31 
 
 
535 aa  146  8.000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.858375  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1506  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  31.01 
 
 
452 aa  146  8.000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00816775 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1498  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  29.4 
 
 
458 aa  145  9e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>