More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4877 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4877  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 346 aa  694    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00304627  normal  0.857214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4933  transcriptional regulator, LacI family  66.18 
 
 		 339 aa  406  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0794709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3338  transcriptional regulator, LacI family  62.2 
 
 		 341 aa  361  8e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.680798  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1824  transcriptional regulator, LacI family  53.75 
 
 		 347 aa  312  5.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.021809  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2344  transcriptional regulator, LacI family  52.85 
 
 		 349 aa  300  4e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3319  transcriptional regulator, LacI family  51.06 
 
 		 337 aa  296  4e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419074  normal  0.0675752 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3001  transcriptional regulator, LacI family  49.55 
 
 		 343 aa  294  2e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33130  transcriptional regulator, LacI family  49.54 
 
 		 361 aa  293  4e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.260263  normal  0.79569 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2320  LacI family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 340 aa  291  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316441  normal  0.202359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6831  LacI family transcription regulator  50.15 
 
 		 337 aa  288  9e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1983  transcriptional regulator, LacI family  49.24 
 
 		 345 aa  280  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.597613  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0366  transcriptional regulator, LacI family  47.75 
 
 		 344 aa  273  3e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2046  LacI family transcription regulator  45.05 
 
 		 344 aa  268  1e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0549  Alanine racemase  50.15 
 
 		 340 aa  267  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2659  transcriptional regulator, LacI family  47.31 
 
 		 339 aa  263  3e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.34431  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0461  transcriptional regulator, LacI family  44.72 
 
 		 353 aa  258  8e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.686839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1873  LacI family response repressor  41.21 
 
 		 368 aa  247  2e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.845568  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2790  LacI family transcription regulator  48.05 
 
 		 348 aa  243  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1620  LacI family transcription regulator  45.9 
 
 		 337 aa  236  4e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3985  transcriptional regulator, LacI family  50.46 
 
 		 338 aa  236  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.610149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3482  Alanine racemase  45.06 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0777863  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0181  transcriptional regulator, LacI family  42.34 
 
 		 341 aa  215  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844091 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30450  transcriptional regulator  45.37 
 
 		 349 aa  211  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.158752  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23440  transcriptional regulator, LacI family  41.02 
 
 		 350 aa  210  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.769589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0091  LacI family transcription regulator  40.29 
 
 		 346 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1825  transcriptional regulator, LacI family  45.65 
 
 		 346 aa  206  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319362  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0193  transcriptional regulator, LacI family  39.22 
 
 		 340 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0971  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.06 
 
 		 350 aa  199  5e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3252  transcriptional regulator, LacI family  38.51 
 
 		 351 aa  199  7e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  37.87 
 
 		 353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0819  transcriptional regulator, LacI family  38.61 
 
 		 348 aa  192  6e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  36.8 
 
 		 368 aa  189  5.999999999999999e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3586  transcriptional regulator, LacI family  38.51 
 
 		 333 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  38.58 
 
 		 342 aa  179  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  37.39 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11530  transcriptional regulator, LacI family  35.44 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809623 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0186  transcriptional regulator, LacI family  36.78 
 
 		 330 aa  175  9e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.63 
 
 		 336 aa  175  9e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0113  transcriptional regulator, LacI family  37.2 
 
 		 350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0069  transcriptional regulator, LacI family  36.83 
 
 		 342 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  31.83 
 
 		 335 aa  172  6.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01670  transcriptional regulator  35.31 
 
 		 348 aa  172  9e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0502  transcriptional regulator, LacI family  36.9 
 
 		 344 aa  170  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0979375 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  35.12 
 
 		 348 aa  168  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 341 aa  168  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  36.12 
 
 		 336 aa  162  7e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0907  LacI family transcription regulator  35.82 
 
 		 341 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  32.34 
 
 		 331 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1125  transcriptional regulator, LacI family  36.45 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  35.22 
 
 		 338 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6720  transcriptional regulator, LacI family  36.13 
 
 		 374 aa  159  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.396206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2403  transcriptional regulator, LacI family  36.5 
 
 		 379 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00011763  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.26 
 
 		 335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.74 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  31.58 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1486  transcriptional regulator, LacI family  31.66 
 
 		 334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.479144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2511  transcriptional regulator, LacI family  34.51 
 
 		 334 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 337 aa  153  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 342 aa  153  5e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.93 
 
 		 330 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  34.63 
 
 		 359 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.42 
 
 		 335 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.61 
 
 		 339 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  36.83 
 
 		 353 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  30.61 
 
 		 334 aa  150  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.26 
 
 		 335 aa  150  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  31.34 
 
 		 342 aa  149  8e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3470  transcriptional regulator, LacI family  38.92 
 
 		 331 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0918  transcriptional regulator, LacI family  36.6 
 
 		 349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  29.59 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2445  LacI family transcription regulator  33.03 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0524  alanine racemase  36.5 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.53 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_003296  RS02195  transcription regulator transcription regulator protein  34.01 
 
 		 355 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.479594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32 
 
 		 336 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  32.84 
 
 		 337 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2475  transcriptional regulator, LacI family  37.3 
 
 		 340 aa  146  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000232076  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2720  transcriptional regulator, LacI family  35.36 
 
 		 337 aa  146  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.687845  normal  0.476409 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  31.96 
 
 		 337 aa  146  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3676  LacI family transcription regulator  34.54 
 
 		 323 aa  146  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  31.95 
 
 		 386 aa  146  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.15 
 
 		 335 aa  146  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  29.94 
 
 		 330 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2686  transcriptional regulator, LacI family  32.54 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241666  normal  0.163804 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  29.71 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0163  transcriptional regulator, LacI family  30.5 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000297035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  29.97 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0309  transcriptional regulator, LacI family  37.98 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0282  LacI family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.727359 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  29.67 
 
 		 332 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  29.67 
 
 		 332 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  29.67 
 
 		 332 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  29.67 
 
 		 332 aa  143  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  29.67 
 
 		 332 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  29.67 
 
 		 332 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  32.11 
 
 		 336 aa  143  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0948  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.34 
 
 		 337 aa  143  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.849116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1856  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.27 
 
 		 342 aa  143  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.945809  hitchhiker  0.0011577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1329  transcriptional regulator, LacI family  32.93 
 
 		 341 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.315575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2456  LacI family transcription regulator  32.58 
 
 		 352 aa  142  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>