65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4413 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4413  hypothetical protein  100 
 
 		 1001 aa  1974    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0596  WGR domain-containing protein  45.53 
 
 		 1130 aa  453  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0389  WGR domain-containing protein  43.49 
 
 		 1127 aa  431  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489109  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2883  WGR domain-containing protein  43.4 
 
 		 1216 aa  414  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.282061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1890  hypothetical protein  40.16 
 
 		 1104 aa  382  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1888  WGR domain-containing protein  41.71 
 
 		 1099 aa  361  5e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.735495  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0597  WGR domain-containing protein  41.67 
 
 		 1086 aa  360  9e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  41.07 
 
 		 1314 aa  353  7e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2909  hypothetical protein  43.03 
 
 		 1116 aa  351  4e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.011304  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0928  molybdate metabolism regulator MolR  37.65 
 
 		 1262 aa  341  4e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02045  molybdate metabolism regulator  37.5 
 
 		 1264 aa  336  1e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  39.09 
 
 		 1422 aa  333  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  37.32 
 
 		 1264 aa  332  2e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1889  WGR domain-containing protein  39.4 
 
 		 1086 aa  331  5.0000000000000004e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00599399  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1532  WGR domain-containing protein  37.7 
 
 		 1264 aa  328  3e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2250  molybdate metabolism regulator  37.52 
 
 		 1264 aa  325  3e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2966  hypothetical protein  41.14 
 
 		 1083 aa  325  3e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00498883  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4404  hypothetical protein  42.08 
 
 		 1012 aa  319  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0598  WGR domain-containing protein  37.24 
 
 		 1125 aa  311  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3099  hypothetical protein  34.28 
 
 		 963 aa  311  5e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4309  hypothetical protein  38.59 
 
 		 1055 aa  295  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4265  hypothetical protein  38.61 
 
 		 1178 aa  289  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  37.58 
 
 		 1329 aa  285  4.0000000000000003e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1395  WGR domain-containing protein  38.58 
 
 		 1291 aa  270  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73033 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1394  WGR domain-containing protein  37.09 
 
 		 1297 aa  262  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753889  normal  0.407272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1670  hypothetical protein  41.19 
 
 		 988 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.596851  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1541  putative regulator  35.23 
 
 		 1210 aa  253  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02046  hypothetical protein  33.61 
 
 		 1210 aa  251  5e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02004  hypothetical protein  33.61 
 
 		 1210 aa  251  5e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1531  putative regulator  35.01 
 
 		 1210 aa  248  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2251  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  35.01 
 
 		 1210 aa  248  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3102  molybdate metabolism regulator MolR homolog  34.79 
 
 		 1209 aa  241  5.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.772316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0927  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  34.57 
 
 		 1220 aa  239  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1981  molybdate metabolism regulator  32.24 
 
 		 1137 aa  158  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3309  molybdate metabolism regulator  28.73 
 
 		 1139 aa  156  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3301  molybdate metabolism regulator  28.13 
 
 		 1139 aa  153  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3293  hypothetical protein  29.28 
 
 		 1139 aa  153  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1490  molybdate metabolism regulator  27.6 
 
 		 1146 aa  151  6e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1013  hypothetical protein  26.37 
 
 		 1108 aa  145  4e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2998  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1139 aa  144  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.379625  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6231  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.63 
 
 		 1275 aa  117  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4266  hypothetical protein  44.27 
 
 		 971 aa  111  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.794814  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1496  hypothetical protein  21.64 
 
 		 465 aa  104  7e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00864727  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0131  hypothetical protein  29.33 
 
 		 1249 aa  96.3  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103261  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0234  molybdate metabolism regulator  23.71 
 
 		 1094 aa  96.3  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2623  hypothetical protein  18.02 
 
 		 903 aa  80.1  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.830052  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  20.66 
 
 		 898 aa  80.1  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  19.7 
 
 		 754 aa  77.8  0.0000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  18.66 
 
 		 762 aa  74.3  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7811  hypothetical protein  27.56 
 
 		 817 aa  73.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  20.55 
 
 		 857 aa  72.8  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228029  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  19.33 
 
 		 789 aa  68.6  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1930  hypothetical protein  26.05 
 
 		 852 aa  68.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7144  hypothetical protein  28.12 
 
 		 811 aa  65.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3467  regulatory protein, LuxR  20.88 
 
 		 739 aa  65.1  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0929812 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  18.13 
 
 		 800 aa  64.7  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4075  hypothetical protein  22.57 
 
 		 634 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  20.91 
 
 		 774 aa  56.6  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2787  lipoprotein  20.61 
 
 		 862 aa  55.1  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000522963  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2790  lipoprotein  23.93 
 
 		 862 aa  54.7  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1935  hypothetical protein  25.37 
 
 		 837 aa  53.5  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.273514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3551  hypothetical protein  24.15 
 
 		 670 aa  53.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0236032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1638  hypothetical protein  23.51 
 
 		 857 aa  53.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2518  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1635 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.189661  normal  0.373256 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3596  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1635 aa  45.8  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>