215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2278 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2278  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  343  7e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3991  transposase and inactivated derivatives-like  42.02 
 
 		 147 aa  95.1  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3471  hypothetical protein  43.8 
 
 		 268 aa  91.3  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2603  hypothetical protein  48.51 
 
 		 268 aa  89.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.144374  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3623  putative TIS1421-transposase orfA protein  40 
 
 		 141 aa  87.4  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.111162  normal  0.0945006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2523  putative TIS1421-transposase orfA protein  40 
 
 		 141 aa  87.4  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2048  putative TIS1421-transposase orfA protein  40 
 
 		 141 aa  87.4  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3723  putative TIS1421-transposase orfA protein  40 
 
 		 141 aa  87.4  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0053926  hitchhiker  0.000867735 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1727  putative TIS1421-transposase orfA protein  40 
 
 		 141 aa  87.4  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4478  putative TIS1421-transposase orfA protein  40 
 
 		 141 aa  87.4  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3630  putative TIS1421-transposase orfA protein  40 
 
 		 141 aa  87.4  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.033265  normal  0.188786 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3095  putative TIS1421-transposase orfA protein  40 
 
 		 141 aa  87.4  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0214138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0172  transposase and inactivated derivatives-like protein  47 
 
 		 147 aa  87.4  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0523  putative TIS1421-transposase orfA protein  42.86 
 
 		 136 aa  87  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0848  putative TIS1421-transposase orfA protein  42.86 
 
 		 136 aa  87  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120469 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3789  putative TIS1421-transposase orfA protein  42.86 
 
 		 136 aa  87  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6398  hypothetical protein  39.5 
 
 		 258 aa  85.9  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6465  hypothetical protein  42.34 
 
 		 268 aa  85.1  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1672  TIS1421-transposase protein A  40.87 
 
 		 134 aa  84.3  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0647386  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0041  TIS1421-transposase protein A  40.87 
 
 		 134 aa  84.3  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0094  TIS1421-transposase protein A  40.87 
 
 		 134 aa  84.3  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0302  TIS1421-transposase protein B  40.87 
 
 		 134 aa  84.3  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836514 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0581  IS1421-transposase protein A  40.87 
 
 		 134 aa  84.3  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.814053  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0990  TIS1421-transposase protein A  40.87 
 
 		 134 aa  84.3  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.118186  normal  0.0722449 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1205  putative TIS1421-transposase orfA protein  47.78 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.482894  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3527  hypothetical protein  41.32 
 
 		 268 aa  78.6  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2280  putative TIS1421-transposase orfA protein  37.5 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.676349  normal  0.0212696 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1905  hypothetical protein  47.95 
 
 		 101 aa  78.2  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.519601  normal  0.0126104 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1843  hypothetical protein  42.11 
 
 		 267 aa  77.8  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2753  hypothetical protein  35.14 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5581  hypothetical protein  42.68 
 
 		 268 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0704355 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5590  hypothetical protein  42.68 
 
 		 268 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0110915 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2601  hypothetical protein  35.14 
 
 		 274 aa  71.2  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1406  hypothetical protein  35.71 
 
 		 276 aa  68.6  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0760  hypothetical protein  35.71 
 
 		 276 aa  68.6  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00106619  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1733  putative TIS1421-transposase orfA protein  54.24 
 
 		 64 aa  67.8  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334785 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6624  TIS1421-transposase protein A  33.33 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.29117 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2176  transposase and inactivated derivatives-like protein  39.34 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5632  hypothetical protein  36.71 
 
 		 268 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1717  putative transposase protein  40 
 
 		 150 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1346  transposase  29.37 
 
 		 272 aa  53.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.888683 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1047  hypothetical protein  36.99 
 
 		 136 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128827  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1928  hypothetical protein  36.99 
 
 		 136 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.643232  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1755  hypothetical protein  36.99 
 
 		 136 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898069  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1777  hypothetical protein  36.99 
 
 		 136 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0162  hypothetical protein  36.99 
 
 		 136 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1494  hypothetical protein  36.99 
 
 		 136 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1004  hypothetical protein  36.99 
 
 		 136 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0627317  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2626  transposase  35.29 
 
 		 334 aa  51.2  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0271  hypothetical protein  35.29 
 
 		 334 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.852206  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1648  hypothetical protein  35.29 
 
 		 334 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0920  hypothetical protein  35.29 
 
 		 373 aa  51.2  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.254793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0303  hypothetical protein  35.29 
 
 		 334 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2488  hypothetical protein  35.29 
 
 		 334 aa  51.2  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1451  hypothetical protein  35.29 
 
 		 334 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0541  hypothetical protein  35.29 
 
 		 390 aa  51.2  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1644  putative transposase protein  37.33 
 
 		 149 aa  50.8  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal  0.304361 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2808  putative transposase protein  38.75 
 
 		 149 aa  50.8  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164192  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0527  ISBm1, transposase orfA  35 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0537  ISBm1, transposase orfA  35 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2552  hypothetical protein  36.99 
 
 		 136 aa  50.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.248295  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0523  ISBm1, transposase orfA  35 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0533  ISBm1, transposase orfA  35 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0168543  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  32.65 
 
 		 123 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  32.65 
 
 		 123 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  32.65 
 
 		 123 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  32.65 
 
 		 123 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  32.65 
 
 		 123 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  35.71 
 
 		 254 aa  49.3  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  35.71 
 
 		 254 aa  49.3  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  35.71 
 
 		 254 aa  49.3  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  35.71 
 
 		 254 aa  49.3  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  28.7 
 
 		 260 aa  48.9  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0249  ISBm1, transposase orfA  38.67 
 
 		 132 aa  49.3  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00124682  hitchhiker  0.00649227 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2678  ISBm1, transposase orfA  38.67 
 
 		 132 aa  49.3  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0958121 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  35.71 
 
 		 254 aa  49.3  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.42 
 
 		 281 aa  48.9  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6488  transposase  35 
 
 		 103 aa  48.5  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659219  normal  0.853863 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1032  hypothetical protein  34.83 
 
 		 136 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.703419  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1512  hypothetical protein  34.83 
 
 		 136 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  38.67 
 
 		 254 aa  48.5  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4653  hypothetical protein  33.71 
 
 		 136 aa  48.5  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.385837  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  38.67 
 
 		 254 aa  48.5  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  38.67 
 
 		 254 aa  48.5  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  38.67 
 
 		 254 aa  48.5  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  38.67 
 
 		 254 aa  48.5  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  38.67 
 
 		 254 aa  48.5  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  28.7 
 
 		 260 aa  48.1  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  28.7 
 
 		 260 aa  48.1  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  28.7 
 
 		 260 aa  48.1  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.38 
 
 		 281 aa  48.1  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2686  putative IS1648 transposase  31.58 
 
 		 143 aa  47.8  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4185  putative transposase  35.9 
 
 		 104 aa  47.8  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3450  putative transposase  35.9 
 
 		 104 aa  47.8  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0595  putative transposase  35.9 
 
 		 104 aa  47.8  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0771  hypothetical protein  33.73 
 
 		 111 aa  47.8  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1157  transposase  33.08 
 
 		 123 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7093  transposase  33.08 
 
 		 123 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.878817  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1488  hypothetical protein  33.71 
 
 		 136 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187879  hitchhiker  0.000281103 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1394  hypothetical protein  33.71 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.997905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>