298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1572 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1572  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  100 
 
 
315 aa  641    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.510874 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1345  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  66.56 
 
 
308 aa  414  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  hitchhiker  0.000920684 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2788  Methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H)  63.88 
 
 
310 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.419297  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3307  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  67.01 
 
 
300 aa  391  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5027  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  64.83 
 
 
298 aa  393  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.641097  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0991  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.3 
 
 
331 aa  387  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.232217  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3026  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.72 
 
 
308 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0444121  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3250  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.21 
 
 
305 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.670776  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1050  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  64.08 
 
 
312 aa  380  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.466663  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3477  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.54 
 
 
305 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112199  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5126  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  66.43 
 
 
291 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170004  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3109  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60.65 
 
 
309 aa  376  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1389  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  64.31 
 
 
298 aa  364  1e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.695264  hitchhiker  0.000418344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1401  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.37 
 
 
296 aa  355  5e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2661  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  57.58 
 
 
313 aa  327  1.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3032  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.99 
 
 
297 aa  322  5e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.957314  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27000  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.88 
 
 
302 aa  320  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276058  normal  0.910216 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3198  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  55.75 
 
 
295 aa  317  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000417891  hitchhiker  0.000803821 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3083  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  54.83 
 
 
296 aa  311  6.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0275518  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05590  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.84 
 
 
290 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0530  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.41 
 
 
282 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0448  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.97 
 
 
281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4977  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.06 
 
 
295 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2667  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  45.49 
 
 
300 aa  238  8e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.167357  normal  0.059667 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4850  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.26 
 
 
281 aa  238  8e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0546784 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5069  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.97 
 
 
281 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0459  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.97 
 
 
281 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0035  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  46.24 
 
 
312 aa  236  4e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2862  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.42 
 
 
300 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662344  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5026  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.26 
 
 
281 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0488  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.62 
 
 
281 aa  235  6e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2769  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.42 
 
 
300 aa  235  7e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.921353  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1055  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.77 
 
 
311 aa  231  1e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5281  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.49 
 
 
281 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03550  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.97 
 
 
281 aa  231  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1170  Methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H)  47.87 
 
 
298 aa  229  4e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0239338  normal  0.331608 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2896  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.05 
 
 
286 aa  229  5e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1732  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.53 
 
 
301 aa  228  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000245457  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2401  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.09 
 
 
314 aa  227  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.424699 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2676  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.35 
 
 
300 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0219  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.84 
 
 
310 aa  223  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0477  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.81 
 
 
291 aa  222  6e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0179817  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1530  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.12 
 
 
319 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2438  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.48 
 
 
302 aa  221  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.24213  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1081  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.94 
 
 
308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0517774  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3437  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.5 
 
 
297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0514  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.5 
 
 
297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3612  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.5 
 
 
297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0522  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.79 
 
 
296 aa  220  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4054  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.5 
 
 
297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0562  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.79 
 
 
296 aa  219  5e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3169  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.75 
 
 
296 aa  219  5e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0618  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.5 
 
 
295 aa  219  5e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3547  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.75 
 
 
294 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0137  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.71 
 
 
289 aa  218  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.455806  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0562  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.5 
 
 
295 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3774  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.5 
 
 
295 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0538  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.5 
 
 
295 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0642  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.7 
 
 
298 aa  218  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2125  Methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H)  42.23 
 
 
320 aa  218  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000980876 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0566  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.5 
 
 
295 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3208  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.37 
 
 
313 aa  217  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0624  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.07 
 
 
296 aa  217  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4039  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.43 
 
 
296 aa  217  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2393  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.31 
 
 
284 aa  216  4e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.235833  normal  0.350806 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2401  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.84 
 
 
300 aa  216  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.301075  normal  0.0231956 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0215  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.79 
 
 
276 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.474341  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0674  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.42 
 
 
294 aa  215  7e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  0.312205 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2831  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.07 
 
 
317 aa  215  9e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.23193 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0284  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.49 
 
 
343 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.819527  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1674  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.32 
 
 
304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.302516  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0535  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.24 
 
 
272 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.64764  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0692  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.24 
 
 
272 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000194482  unclonable  0.000000000127629 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2517  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (FADH)  41.07 
 
 
276 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3996  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.46 
 
 
310 aa  212  4.9999999999999996e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04353  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.94 
 
 
275 aa  212  7e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2367  Deleted entry  43.25 
 
 
323 aa  211  9e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.38264  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1108  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.97 
 
 
289 aa  210  3e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0172  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.43 
 
 
276 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010717  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3734  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.79 
 
 
298 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.130481  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1765  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.16 
 
 
295 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294804  normal  0.0134903 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3540  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.52 
 
 
295 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701221  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0482  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.92 
 
 
291 aa  208  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3844  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.48 
 
 
277 aa  208  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4919  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.34 
 
 
306 aa  208  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3044  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.25 
 
 
289 aa  208  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.208666  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0614  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.86 
 
 
275 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.502015  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03524  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.58 
 
 
295 aa  207  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1498  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.37 
 
 
296 aa  207  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00302896  normal  0.843154 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1758  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.1 
 
 
295 aa  206  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0396  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.71 
 
 
282 aa  206  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0364  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.07 
 
 
304 aa  207  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3658  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.36 
 
 
276 aa  206  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3335  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.36 
 
 
276 aa  206  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1723  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.68 
 
 
289 aa  206  5e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1647  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.33 
 
 
289 aa  205  7e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.150812  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2618  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.85 
 
 
300 aa  205  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.444292  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1130  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.86 
 
 
294 aa  205  8e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0239828  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03827  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.72 
 
 
296 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4389  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.72 
 
 
296 aa  205  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.426322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>