90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0871 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0871  protein of unknown function DUF1271  100 
 
 		 599 aa  1219    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207432  normal  0.190699 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2272  hypothetical protein  46.92 
 
 		 211 aa  212  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0516  hypothetical protein  43.58 
 
 		 211 aa  189  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3850  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  57.05 
 
 		 263 aa  184  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000122426  normal  0.0184241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0248  globin  58.22 
 
 		 257 aa  181  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8342  Truncated hemoglobins-like protein  60.56 
 
 		 255 aa  178  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.414904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1450  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  56.94 
 
 		 252 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2478  globin  53.1 
 
 		 153 aa  152  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000576201  hitchhiker  0.00350075 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0782  protein of unknown function DUF1271  35.23 
 
 		 214 aa  139  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2903  globin  45.89 
 
 		 161 aa  133  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1270  hypothetical protein  34.1 
 
 		 215 aa  120  9e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7318  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0283  globin  41.55 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2058  zinc finger CDGSH-type domain protein  36.64 
 
 		 246 aa  112  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000110219  normal  0.493607 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3576  hypothetical protein  29.63 
 
 		 256 aa  107  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.327098  normal  0.196355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5171  hypothetical protein  31.36 
 
 		 594 aa  103  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00324172 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1178  protein of unknown function DUF1271  34.19 
 
 		 233 aa  101  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.25383  normal  0.606867 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2298  hypothetical protein  29.65 
 
 		 241 aa  99.4  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.561327 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1475  protein of unknown function DUF1271  36.96 
 
 		 233 aa  94.7  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0145  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  27.31 
 
 		 236 aa  92.4  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1281  protein of unknown function DUF1271  30.97 
 
 		 233 aa  90.9  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.768741  normal  0.722249 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2414  globin  36.17 
 
 		 146 aa  90.9  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.76431  normal  0.163683 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2314  hypothetical protein  29.82 
 
 		 232 aa  88.6  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0591  zinc finger CDGSH-type domain protein  31.47 
 
 		 229 aa  88.2  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0865  protein of unknown function DUF1271  30.47 
 
 		 219 aa  85.1  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000589964  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1437  protein of unknown function DUF1271  32.17 
 
 		 147 aa  77.8  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781813  normal  0.13067 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1114  globin  29.58 
 
 		 151 aa  63.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1095  globin  31.94 
 
 		 150 aa  60.1  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2069  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  51.67 
 
 		 146 aa  57.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1225  globin  35.24 
 
 		 125 aa  57.4  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0341074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1734  hypothetical protein  34.85 
 
 		 76 aa  55.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1243  globin  30 
 
 		 133 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09000  truncated hemoglobin  28.15 
 
 		 178 aa  54.7  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0562006  normal  0.0132331 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2660  protein of unknown function DUF1271  33.82 
 
 		 77 aa  54.7  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0741902  normal  0.253089 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0466  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  49.09 
 
 		 77 aa  53.9  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.336392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0783  globin  29.66 
 
 		 133 aa  53.9  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3589  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  50 
 
 		 84 aa  53.5  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.558971  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3258  Zinc finger, CDGSH-type  43.28 
 
 		 86 aa  53.5  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.167004  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4636  globin  29.41 
 
 		 150 aa  53.5  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0856308  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13110  iron-binding zinc finger protein, CDGSH type  47.37 
 
 		 104 aa  52.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1683  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  38.36 
 
 		 76 aa  52.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.362742 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4406  hypothetical protein  37.5 
 
 		 74 aa  52.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00107323  normal  0.281597 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3395  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  45.31 
 
 		 104 aa  52.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1376  globin  29.92 
 
 		 124 aa  51.6  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0355  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  44.44 
 
 		 72 aa  51.6  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2215  hypothetical protein  28.68 
 
 		 188 aa  51.6  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307711  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0714  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  50.8  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385842  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2269  zinc finger CDGSH-type domain protein  42.59 
 
 		 70 aa  50.8  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2569  hypothetical protein  40.62 
 
 		 77 aa  50.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.650422 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2912  hypothetical protein  40.68 
 
 		 75 aa  49.3  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.213928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1359  globin  31.03 
 
 		 127 aa  48.9  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267788  decreased coverage  0.00000213655 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  30.67 
 
 		 508 aa  48.5  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2809  zinc finger CDGSH-type domain protein  36.99 
 
 		 74 aa  48.9  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5202  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  40.68 
 
 		 66 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3158  zinc finger CDGSH-type domain protein  36.99 
 
 		 74 aa  48.9  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3538  globin  29.71 
 
 		 142 aa  47.8  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.637564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3305  hypothetical protein  31.15 
 
 		 76 aa  47.8  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3863  hypothetical protein  38.89 
 
 		 130 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1533  globin  31.93 
 
 		 129 aa  47.8  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331833  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2807  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  38.89 
 
 		 80 aa  47.8  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.471751  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3849  hypothetical protein  38.89 
 
 		 130 aa  47.8  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4016  hypothetical protein  38.89 
 
 		 130 aa  47.8  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4177  hypothetical protein  38.89 
 
 		 130 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3866  protein of unknown function DUF1271  32.79 
 
 		 76 aa  47  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03958  hypothetical protein  32.79 
 
 		 76 aa  47  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03997  hypothetical protein  32.79 
 
 		 76 aa  47  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5641  hypothetical protein  32.79 
 
 		 76 aa  47  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3901  hypothetical protein  32.79 
 
 		 76 aa  47  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1986  zinc finger CDGSH-type domain protein  42.86 
 
 		 90 aa  47  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4680  hypothetical protein  32.79 
 
 		 76 aa  47  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4367  hypothetical protein  32.79 
 
 		 76 aa  47  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.325608  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_7107  predicted protein  28.81 
 
 		 129 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4594  hypothetical protein  32.79 
 
 		 76 aa  46.6  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0622  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  39.29 
 
 		 68 aa  47  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.507556 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4330  hypothetical protein  38.89 
 
 		 88 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2157  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  50 
 
 		 71 aa  46.2  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1019  hypothetical protein  38.89 
 
 		 68 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4132  hypothetical protein  38.89 
 
 		 68 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.623958 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4218  hypothetical protein  38.89 
 
 		 68 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4241  hypothetical protein  38.89 
 
 		 68 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3940  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  38.89 
 
 		 80 aa  46.2  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3913  globin  30.23 
 
 		 142 aa  46.2  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.237071 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2370  globin  27.43 
 
 		 130 aa  45.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  28.28 
 
 		 137 aa  44.7  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1149  globin  29.13 
 
 		 140 aa  44.7  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.572775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0824  hypothetical protein  34.85 
 
 		 77 aa  44.3  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0783  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  35.82 
 
 		 76 aa  44.3  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.396298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2759  zinc finger CDGSH-type domain protein  34.69 
 
 		 65 aa  43.9  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2798  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  40.68 
 
 		 70 aa  43.9  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.755848 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5317  globin  27.78 
 
 		 139 aa  43.5  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702045  normal  0.216575 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>