50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1281 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1281  protein of unknown function DUF1271  100 
 
 		 233 aa  483  1e-136  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.768741  normal  0.722249 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2314  hypothetical protein  79.22 
 
 		 232 aa  387  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1178  protein of unknown function DUF1271  69.4 
 
 		 233 aa  342  2e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.25383  normal  0.606867 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3576  hypothetical protein  62.93 
 
 		 256 aa  300  1e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.327098  normal  0.196355 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1475  protein of unknown function DUF1271  58.8 
 
 		 233 aa  278  7e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2298  hypothetical protein  54.59 
 
 		 241 aa  254  7e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.561327 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0145  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  53.27 
 
 		 236 aa  246  2e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2058  zinc finger CDGSH-type domain protein  47.95 
 
 		 246 aa  205  5e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000110219  normal  0.493607 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0591  zinc finger CDGSH-type domain protein  47.06 
 
 		 229 aa  194  7e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0865  protein of unknown function DUF1271  44.7 
 
 		 219 aa  179  4e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000589964  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5171  hypothetical protein  41.89 
 
 		 594 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00324172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0871  protein of unknown function DUF1271  30.97 
 
 		 599 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207432  normal  0.190699 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2272  hypothetical protein  31.39 
 
 		 211 aa  88.2  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0782  protein of unknown function DUF1271  30.17 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1270  hypothetical protein  30.21 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7318  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2496  hypothetical protein  57.78 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242618  normal  0.220386 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1986  zinc finger CDGSH-type domain protein  37 
 
 		 90 aa  60.8  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0516  hypothetical protein  28.19 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3258  Zinc finger, CDGSH-type  44.3 
 
 		 86 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.167004  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5202  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  38.36 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1437  protein of unknown function DUF1271  31.4 
 
 		 147 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781813  normal  0.13067 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0355  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  44.44 
 
 		 72 aa  49.7  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2912  hypothetical protein  35.14 
 
 		 75 aa  48.9  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.213928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4406  hypothetical protein  43.48 
 
 		 74 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00107323  normal  0.281597 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2809  zinc finger CDGSH-type domain protein  35.44 
 
 		 74 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3158  zinc finger CDGSH-type domain protein  35.44 
 
 		 74 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868245 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2269  zinc finger CDGSH-type domain protein  38.81 
 
 		 70 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0622  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  37.14 
 
 		 68 aa  46.2  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.507556 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2798  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  34.29 
 
 		 70 aa  45.8  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.755848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2426  zinc finger CDGSH-type domain protein  41.3 
 
 		 74 aa  45.8  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0623545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1683  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  38.03 
 
 		 76 aa  45.8  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.362742 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3589  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  35.62 
 
 		 84 aa  45.4  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.558971  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2759  zinc finger CDGSH-type domain protein  40 
 
 		 65 aa  44.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2157  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  69.57 
 
 		 71 aa  43.9  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3395  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  41.18 
 
 		 104 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2069  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  43.18 
 
 		 146 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2807  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  33.85 
 
 		 80 aa  43.5  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.471751  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0856  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  40 
 
 		 75 aa  43.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4330  hypothetical protein  35.38 
 
 		 88 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13110  iron-binding zinc finger protein, CDGSH type  46.81 
 
 		 104 aa  43.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4177  hypothetical protein  35.38 
 
 		 130 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4016  hypothetical protein  35.38 
 
 		 130 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3849  hypothetical protein  35.38 
 
 		 130 aa  43.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3863  hypothetical protein  35.38 
 
 		 130 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3940  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  35.38 
 
 		 80 aa  43.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4132  hypothetical protein  35.38 
 
 		 68 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.623958 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4241  hypothetical protein  35.38 
 
 		 68 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4218  hypothetical protein  35.38 
 
 		 68 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1019  hypothetical protein  35.38 
 
 		 68 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0466  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  42.86 
 
 		 77 aa  42  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.336392  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>