50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2058 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2058  zinc finger CDGSH-type domain protein  100 
 
 
246 aa  505  9.999999999999999e-143  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000110219  normal  0.493607 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0591  zinc finger CDGSH-type domain protein  55 
 
 
229 aa  258  6e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2314  hypothetical protein  50.68 
 
 
232 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1178  protein of unknown function DUF1271  48.4 
 
 
233 aa  210  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.25383  normal  0.606867 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0145  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  45.33 
 
 
236 aa  206  3e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1281  protein of unknown function DUF1271  47.95 
 
 
233 aa  205  5e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.768741  normal  0.722249 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3576  hypothetical protein  46.15 
 
 
256 aa  204  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.327098  normal  0.196355 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2298  hypothetical protein  46.3 
 
 
241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.561327 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1475  protein of unknown function DUF1271  48.18 
 
 
233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122746  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0865  protein of unknown function DUF1271  39.73 
 
 
219 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000589964  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5171  hypothetical protein  34.22 
 
 
594 aa  148  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00324172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0871  protein of unknown function DUF1271  36.64 
 
 
599 aa  112  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207432  normal  0.190699 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0516  hypothetical protein  34.63 
 
 
211 aa  108  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2272  hypothetical protein  29.87 
 
 
211 aa  100  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0782  protein of unknown function DUF1271  28.57 
 
 
214 aa  73.9  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1270  hypothetical protein  30.47 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7318  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2496  hypothetical protein  49.12 
 
 
86 aa  62  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242618  normal  0.220386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1437  protein of unknown function DUF1271  27.92 
 
 
147 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781813  normal  0.13067 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3258  Zinc finger, CDGSH-type  45.45 
 
 
86 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.167004  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0466  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  42.35 
 
 
77 aa  54.3  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.336392  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13110  iron-binding zinc finger protein, CDGSH type  53.7 
 
 
104 aa  52  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1683  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  47.17 
 
 
76 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.362742 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4406  hypothetical protein  38.24 
 
 
74 aa  49.3  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00107323  normal  0.281597 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3395  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  51.02 
 
 
104 aa  49.3  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1986  zinc finger CDGSH-type domain protein  41.18 
 
 
90 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2807  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  38.64 
 
 
80 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.471751  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0355  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  43.18 
 
 
72 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2912  hypothetical protein  40 
 
 
75 aa  46.2  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.213928  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2069  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  34.83 
 
 
146 aa  46.2  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3940  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  40.91 
 
 
80 aa  45.8  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4330  hypothetical protein  40.91 
 
 
88 aa  45.4  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4177  hypothetical protein  40.91 
 
 
130 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2426  zinc finger CDGSH-type domain protein  43.48 
 
 
74 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0623545  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2759  zinc finger CDGSH-type domain protein  38.64 
 
 
65 aa  44.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4132  hypothetical protein  40.91 
 
 
68 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.623958 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4016  hypothetical protein  40.91 
 
 
130 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1019  hypothetical protein  40.91 
 
 
68 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4218  hypothetical protein  40.91 
 
 
68 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4241  hypothetical protein  40.91 
 
 
68 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3849  hypothetical protein  40.91 
 
 
130 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3863  hypothetical protein  40.91 
 
 
130 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2269  zinc finger CDGSH-type domain protein  36.36 
 
 
70 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0783  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  59.26 
 
 
76 aa  43.9  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.396298  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3589  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  39.06 
 
 
84 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.558971  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3158  zinc finger CDGSH-type domain protein  38.18 
 
 
74 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000868245 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2809  zinc finger CDGSH-type domain protein  38.18 
 
 
74 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0856  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  43.48 
 
 
75 aa  43.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0622  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  32.35 
 
 
68 aa  43.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.507556 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2157  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  59.26 
 
 
71 aa  42  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5202  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  35.71 
 
 
66 aa  42  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>