58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0591 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0591  zinc finger CDGSH-type domain protein  100 
 
 
229 aa  473  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2058  zinc finger CDGSH-type domain protein  55 
 
 
246 aa  258  6e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000110219  normal  0.493607 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1178  protein of unknown function DUF1271  49.54 
 
 
233 aa  207  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.25383  normal  0.606867 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0145  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  47.91 
 
 
236 aa  206  3e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2298  hypothetical protein  47.98 
 
 
241 aa  204  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.561327 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2314  hypothetical protein  49.07 
 
 
232 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3576  hypothetical protein  46.33 
 
 
256 aa  195  6e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.327098  normal  0.196355 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1281  protein of unknown function DUF1271  47.06 
 
 
233 aa  194  7e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.768741  normal  0.722249 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1475  protein of unknown function DUF1271  46.54 
 
 
233 aa  182  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122746  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0865  protein of unknown function DUF1271  42.15 
 
 
219 aa  166  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000589964  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5171  hypothetical protein  35.59 
 
 
594 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00324172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0871  protein of unknown function DUF1271  31.47 
 
 
599 aa  88.2  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207432  normal  0.190699 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0516  hypothetical protein  30.8 
 
 
211 aa  85.5  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2272  hypothetical protein  29.84 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0782  protein of unknown function DUF1271  29.24 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2496  hypothetical protein  46.15 
 
 
86 aa  59.7  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242618  normal  0.220386 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1270  hypothetical protein  27.23 
 
 
215 aa  59.7  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7318  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4406  hypothetical protein  36.99 
 
 
74 aa  55.5  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00107323  normal  0.281597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1437  protein of unknown function DUF1271  44.9 
 
 
147 aa  53.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781813  normal  0.13067 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1683  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  34.21 
 
 
76 aa  52  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.362742 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3258  Zinc finger, CDGSH-type  48.98 
 
 
86 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.167004  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1518  Glutamate synthase (NADPH)  53.19 
 
 
518 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.532472  hitchhiker  0.00131604 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1986  zinc finger CDGSH-type domain protein  36.99 
 
 
90 aa  50.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2157  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  48.98 
 
 
71 aa  50.1  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0466  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  53.06 
 
 
77 aa  50.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.336392  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0783  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  74.07 
 
 
76 aa  50.1  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.396298  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3395  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  52 
 
 
104 aa  49.7  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4177  hypothetical protein  38.71 
 
 
130 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2912  hypothetical protein  40.98 
 
 
75 aa  48.9  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.213928  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4330  hypothetical protein  38.71 
 
 
88 aa  48.9  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1019  hypothetical protein  38.71 
 
 
68 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2809  zinc finger CDGSH-type domain protein  37.88 
 
 
74 aa  48.5  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4218  hypothetical protein  38.71 
 
 
68 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4132  hypothetical protein  38.71 
 
 
68 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.623958 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4241  hypothetical protein  38.71 
 
 
68 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3158  zinc finger CDGSH-type domain protein  37.88 
 
 
74 aa  48.5  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000868245 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4016  hypothetical protein  38.71 
 
 
130 aa  48.5  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3849  hypothetical protein  38.71 
 
 
130 aa  48.5  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3863  hypothetical protein  38.71 
 
 
130 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2069  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  48.98 
 
 
146 aa  48.5  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13110  iron-binding zinc finger protein, CDGSH type  55.1 
 
 
104 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3940  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  38.71 
 
 
80 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  69.23 
 
 
516 aa  47.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3552  ferredoxin-dependent glutamate synthase  69.23 
 
 
516 aa  47.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2807  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  35.48 
 
 
80 aa  46.6  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.471751  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2269  zinc finger CDGSH-type domain protein  38.57 
 
 
70 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1903  glutamate synthase domain-containing protein  65.38 
 
 
515 aa  46.2  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329367  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0622  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  66.67 
 
 
68 aa  45.8  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.507556 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0355  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  40.32 
 
 
72 aa  45.4  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3227  ferredoxin-dependent glutamate synthase  65.38 
 
 
514 aa  44.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2798  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  31.43 
 
 
70 aa  45.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.755848 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2957  ferredoxin-dependent glutamate synthase  68 
 
 
510 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3589  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  48.98 
 
 
84 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.558971  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  59.26 
 
 
516 aa  43.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5202  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  36.23 
 
 
66 aa  43.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2759  zinc finger CDGSH-type domain protein  33.87 
 
 
65 aa  42.7  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0489  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.65 
 
 
502 aa  42  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0856  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  41.3 
 
 
75 aa  41.6  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>