53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1178 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1178  protein of unknown function DUF1271  100 
 
 		 233 aa  482  1e-135  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.25383  normal  0.606867 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2314  hypothetical protein  69.4 
 
 		 232 aa  343  2e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1281  protein of unknown function DUF1271  69.4 
 
 		 233 aa  342  2e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.768741  normal  0.722249 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3576  hypothetical protein  69.4 
 
 		 256 aa  338  2.9999999999999998e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.327098  normal  0.196355 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1475  protein of unknown function DUF1271  66.95 
 
 		 233 aa  317  1e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2298  hypothetical protein  57.27 
 
 		 241 aa  264  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.561327 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0145  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  55.61 
 
 		 236 aa  257  1e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2058  zinc finger CDGSH-type domain protein  48.4 
 
 		 246 aa  210  1e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000110219  normal  0.493607 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0591  zinc finger CDGSH-type domain protein  49.54 
 
 		 229 aa  207  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5171  hypothetical protein  45.29 
 
 		 594 aa  191  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00324172 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0865  protein of unknown function DUF1271  45.62 
 
 		 219 aa  190  1e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000589964  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0871  protein of unknown function DUF1271  34.19 
 
 		 599 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207432  normal  0.190699 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2272  hypothetical protein  34.81 
 
 		 211 aa  94  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0782  protein of unknown function DUF1271  33.7 
 
 		 214 aa  91.3  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0516  hypothetical protein  30.49 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1270  hypothetical protein  30.21 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7318  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2496  hypothetical protein  73.33 
 
 		 86 aa  73.2  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242618  normal  0.220386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1437  protein of unknown function DUF1271  32.21 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781813  normal  0.13067 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3258  Zinc finger, CDGSH-type  46.15 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.167004  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5202  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  37.33 
 
 		 66 aa  53.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2912  hypothetical protein  35.14 
 
 		 75 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.213928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0355  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  42.86 
 
 		 72 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4406  hypothetical protein  37.04 
 
 		 74 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00107323  normal  0.281597 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2759  zinc finger CDGSH-type domain protein  41.67 
 
 		 65 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0466  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  50 
 
 		 77 aa  50.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.336392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3158  zinc finger CDGSH-type domain protein  36.49 
 
 		 74 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868245 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2809  zinc finger CDGSH-type domain protein  36.49 
 
 		 74 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3395  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  46.77 
 
 		 104 aa  49.3  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2426  zinc finger CDGSH-type domain protein  41.67 
 
 		 74 aa  47.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0623545  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1986  zinc finger CDGSH-type domain protein  38.89 
 
 		 90 aa  48.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3589  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  47.73 
 
 		 84 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.558971  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2798  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  35.71 
 
 		 70 aa  46.2  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.755848 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2269  zinc finger CDGSH-type domain protein  36.96 
 
 		 70 aa  45.8  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2069  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  48 
 
 		 146 aa  45.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13110  iron-binding zinc finger protein, CDGSH type  52.27 
 
 		 104 aa  46.2  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0622  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  38.57 
 
 		 68 aa  45.8  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.507556 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2157  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  68 
 
 		 71 aa  45.8  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4177  hypothetical protein  35.38 
 
 		 130 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0856  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  39.58 
 
 		 75 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4330  hypothetical protein  35.38 
 
 		 88 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3863  hypothetical protein  35.38 
 
 		 130 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3849  hypothetical protein  35.38 
 
 		 130 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4016  hypothetical protein  35.38 
 
 		 130 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3940  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  35.38 
 
 		 80 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2807  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  33.85 
 
 		 80 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.471751  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0783  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  44.68 
 
 		 76 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.396298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4132  hypothetical protein  34.78 
 
 		 68 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.623958 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1019  hypothetical protein  34.78 
 
 		 68 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4218  hypothetical protein  34.78 
 
 		 68 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4241  hypothetical protein  34.78 
 
 		 68 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1411  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  66.67 
 
 		 53 aa  42.7  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0321891 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1683  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  39.58 
 
 		 76 aa  42.4  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.362742 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18930  iron-binding zinc finger protein, CDGSH type  45.45 
 
 		 77 aa  41.6  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.606018  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>