47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2426 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2426  zinc finger CDGSH-type domain protein  100 
 
 		 74 aa  155  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0623545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0856  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  70.27 
 
 		 75 aa  115  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2807  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  47.06 
 
 		 80 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.471751  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4132  hypothetical protein  47.06 
 
 		 68 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.623958 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1019  hypothetical protein  47.06 
 
 		 68 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4218  hypothetical protein  47.06 
 
 		 68 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4241  hypothetical protein  47.06 
 
 		 68 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4177  hypothetical protein  47.54 
 
 		 130 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3940  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  45.59 
 
 		 80 aa  72  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4016  hypothetical protein  47.54 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3849  hypothetical protein  47.54 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4330  hypothetical protein  45.59 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3863  hypothetical protein  47.54 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0355  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  45.9 
 
 		 72 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3258  Zinc finger, CDGSH-type  42.17 
 
 		 86 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.167004  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2269  zinc finger CDGSH-type domain protein  48.33 
 
 		 70 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2759  zinc finger CDGSH-type domain protein  39.39 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0782  protein of unknown function DUF1271  46.15 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4406  hypothetical protein  47.06 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00107323  normal  0.281597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3589  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  44.23 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.558971  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2314  hypothetical protein  46.94 
 
 		 232 aa  51.2  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1475  protein of unknown function DUF1271  45.65 
 
 		 233 aa  50.4  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1683  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  36.21 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.362742 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3395  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  42.31 
 
 		 104 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1270  hypothetical protein  38.89 
 
 		 215 aa  50.4  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7318  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1986  zinc finger CDGSH-type domain protein  37.5 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2912  hypothetical protein  51.92 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.213928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3158  zinc finger CDGSH-type domain protein  46.15 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868245 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2157  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  40 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2809  zinc finger CDGSH-type domain protein  46.15 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1178  protein of unknown function DUF1271  41.67 
 
 		 233 aa  47.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.25383  normal  0.606867 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2069  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  36.54 
 
 		 146 aa  47.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1281  protein of unknown function DUF1271  41.3 
 
 		 233 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.768741  normal  0.722249 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5202  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  35.09 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0865  protein of unknown function DUF1271  31.51 
 
 		 219 aa  46.2  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000589964  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3576  hypothetical protein  45.65 
 
 		 256 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.327098  normal  0.196355 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2058  zinc finger CDGSH-type domain protein  43.48 
 
 		 246 aa  45.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000110219  normal  0.493607 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2298  hypothetical protein  46.67 
 
 		 241 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.561327 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0145  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  42.22 
 
 		 236 aa  45.4  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0466  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  34.55 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.336392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2272  hypothetical protein  38.89 
 
 		 211 aa  43.9  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0783  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  36.54 
 
 		 76 aa  43.5  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.396298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0516  hypothetical protein  50 
 
 		 211 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1437  protein of unknown function DUF1271  39.13 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781813  normal  0.13067 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0622  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  51.35 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.507556 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13110  iron-binding zinc finger protein, CDGSH type  35.29 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1518  Glutamate synthase (NADPH)  77.78 
 
 		 518 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.532472  hitchhiker  0.00131604 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>