51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1475 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1475  protein of unknown function DUF1271  100 
 
 		 233 aa  483  1e-135  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1178  protein of unknown function DUF1271  66.95 
 
 		 233 aa  317  1e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.25383  normal  0.606867 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3576  hypothetical protein  63.8 
 
 		 256 aa  295  3e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.327098  normal  0.196355 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1281  protein of unknown function DUF1271  58.8 
 
 		 233 aa  278  7e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.768741  normal  0.722249 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2314  hypothetical protein  57.51 
 
 		 232 aa  276  2e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2298  hypothetical protein  50.92 
 
 		 241 aa  228  6e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.561327 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0145  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  49.3 
 
 		 236 aa  222  4e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2058  zinc finger CDGSH-type domain protein  48.18 
 
 		 246 aa  197  9e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000110219  normal  0.493607 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0591  zinc finger CDGSH-type domain protein  46.54 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0865  protein of unknown function DUF1271  46.4 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000589964  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5171  hypothetical protein  39.91 
 
 		 594 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00324172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0871  protein of unknown function DUF1271  36.96 
 
 		 599 aa  94.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207432  normal  0.190699 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2272  hypothetical protein  37.08 
 
 		 211 aa  92  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0516  hypothetical protein  33.91 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2496  hypothetical protein  69.49 
 
 		 86 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242618  normal  0.220386 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0782  protein of unknown function DUF1271  32.96 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1270  hypothetical protein  33.48 
 
 		 215 aa  78.2  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7318  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3258  Zinc finger, CDGSH-type  41.98 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.167004  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2912  hypothetical protein  36.99 
 
 		 75 aa  53.5  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.213928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1437  protein of unknown function DUF1271  38.46 
 
 		 147 aa  53.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781813  normal  0.13067 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2426  zinc finger CDGSH-type domain protein  45.65 
 
 		 74 aa  50.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0623545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2809  zinc finger CDGSH-type domain protein  35.62 
 
 		 74 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3158  zinc finger CDGSH-type domain protein  35.62 
 
 		 74 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868245 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2759  zinc finger CDGSH-type domain protein  44.68 
 
 		 65 aa  49.7  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0355  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  47.73 
 
 		 72 aa  49.3  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1683  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  38.16 
 
 		 76 aa  48.5  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.362742 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4406  hypothetical protein  33.78 
 
 		 74 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00107323  normal  0.281597 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0622  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  36.11 
 
 		 68 aa  47.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.507556 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5202  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  36.84 
 
 		 66 aa  46.6  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3940  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  33.33 
 
 		 80 aa  46.2  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1986  zinc finger CDGSH-type domain protein  32.14 
 
 		 90 aa  46.2  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4177  hypothetical protein  30.86 
 
 		 130 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4016  hypothetical protein  30.86 
 
 		 130 aa  45.8  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4330  hypothetical protein  36.21 
 
 		 88 aa  45.8  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3863  hypothetical protein  30.86 
 
 		 130 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3849  hypothetical protein  30.86 
 
 		 130 aa  45.4  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3395  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  47.83 
 
 		 104 aa  45.4  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0466  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  45.65 
 
 		 77 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.336392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2069  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  43.48 
 
 		 146 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0856  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  42.55 
 
 		 75 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13110  iron-binding zinc finger protein, CDGSH type  47.73 
 
 		 104 aa  44.3  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3589  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  42.37 
 
 		 84 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.558971  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0783  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  42.55 
 
 		 76 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.396298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2807  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  34.85 
 
 		 80 aa  43.5  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.471751  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1518  Glutamate synthase (NADPH)  50 
 
 		 518 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.532472  hitchhiker  0.00131604 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2269  zinc finger CDGSH-type domain protein  34.85 
 
 		 70 aa  42.7  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4241  hypothetical protein  38.64 
 
 		 68 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2157  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  80 
 
 		 71 aa  42.4  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4218  hypothetical protein  38.64 
 
 		 68 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1019  hypothetical protein  38.64 
 
 		 68 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4132  hypothetical protein  38.64 
 
 		 68 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.623958 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>