39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2798 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2798  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  100 
 
 		 70 aa  139  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.755848 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0622  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  76.12 
 
 		 68 aa  109  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.507556 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0783  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  50 
 
 		 76 aa  81.3  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.396298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2157  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  48.53 
 
 		 71 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1986  zinc finger CDGSH-type domain protein  46.15 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4406  hypothetical protein  46.43 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00107323  normal  0.281597 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3258  Zinc finger, CDGSH-type  35.94 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.167004  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5202  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  41.38 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2809  zinc finger CDGSH-type domain protein  49.15 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3158  zinc finger CDGSH-type domain protein  49.15 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868245 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2912  hypothetical protein  52.54 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.213928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1270  hypothetical protein  40 
 
 		 215 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7318  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2314  hypothetical protein  36.71 
 
 		 232 aa  51.2  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1683  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  40.62 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.362742 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2272  hypothetical protein  58.62 
 
 		 211 aa  47.8  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1411  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  40 
 
 		 53 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0321891 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2298  hypothetical protein  32.86 
 
 		 241 aa  47.4  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.561327 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2759  zinc finger CDGSH-type domain protein  40 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3395  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  68.97 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2069  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  53.85 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13110  iron-binding zinc finger protein, CDGSH type  45 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1437  protein of unknown function DUF1271  43.4 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781813  normal  0.13067 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1178  protein of unknown function DUF1271  35.71 
 
 		 233 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.25383  normal  0.606867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1281  protein of unknown function DUF1271  34.29 
 
 		 233 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.768741  normal  0.722249 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0591  zinc finger CDGSH-type domain protein  31.43 
 
 		 229 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0782  protein of unknown function DUF1271  55.88 
 
 		 214 aa  44.7  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0871  protein of unknown function DUF1271  40.68 
 
 		 599 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207432  normal  0.190699 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0355  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  40 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5171  hypothetical protein  64 
 
 		 594 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00324172 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0466  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  41.38 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.336392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3468  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  42.55 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0856  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  46.81 
 
 		 75 aa  41.2  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3576  hypothetical protein  55.56 
 
 		 256 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.327098  normal  0.196355 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0145  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  68.18 
 
 		 236 aa  41.2  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1475  protein of unknown function DUF1271  34.25 
 
 		 233 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2058  zinc finger CDGSH-type domain protein  30.99 
 
 		 246 aa  41.2  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000110219  normal  0.493607 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0865  protein of unknown function DUF1271  33.33 
 
 		 219 aa  40.8  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000589964  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4296  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  44.68 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0157597  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3589  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  52.94 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.558971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>