19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4296 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4296  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  100 
 
 		 68 aa  137  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0157597  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1040  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  70.97 
 
 		 81 aa  87  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4940  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  72.22 
 
 		 75 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5219  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  72.22 
 
 		 75 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00747207 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5790  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  76.09 
 
 		 69 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11410  iron-binding zinc finger protein, CDGSH type  58.06 
 
 		 71 aa  72.8  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2450  zinc finger CDGSH-type domain protein  64.29 
 
 		 72 aa  72.4  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000296222  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3468  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  64.29 
 
 		 71 aa  72  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6636  zinc finger CDGSH-type domain protein  67.35 
 
 		 59 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.101492 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3359  zinc finger CDGSH-type domain protein  57.89 
 
 		 74 aa  61.6  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2308  zinc finger CDGSH-type domain protein  68.97 
 
 		 55 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000604897  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4406  hypothetical protein  36.67 
 
 		 74 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00107323  normal  0.281597 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0466  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  40.68 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.336392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5202  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  30.51 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1683  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  39.66 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.362742 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13110  iron-binding zinc finger protein, CDGSH type  46.67 
 
 		 104 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2798  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  44.68 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.755848 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2069  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  42.55 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3589  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  46.67 
 
 		 84 aa  40  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.558971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>