17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6636 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6636  zinc finger CDGSH-type domain protein  100 
 
 		 59 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.101492 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2450  zinc finger CDGSH-type domain protein  64.71 
 
 		 72 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000296222  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4296  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  67.35 
 
 		 68 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0157597  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1040  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  62.5 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11410  iron-binding zinc finger protein, CDGSH type  62.5 
 
 		 71 aa  66.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5219  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  58.7 
 
 		 75 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00747207 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4940  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  58.7 
 
 		 75 aa  65.1  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3359  zinc finger CDGSH-type domain protein  65.91 
 
 		 74 aa  61.6  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5790  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  60 
 
 		 69 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3468  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  61.7 
 
 		 71 aa  60.8  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0466  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  51.11 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.336392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2308  zinc finger CDGSH-type domain protein  67.65 
 
 		 55 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000604897  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2069  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  46.81 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3395  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  43.75 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13110  iron-binding zinc finger protein, CDGSH type  42.22 
 
 		 104 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1270  hypothetical protein  39.13 
 
 		 215 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7318  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1683  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  46.81 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.362742 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>