31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3468 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3468  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  100 
 
 		 71 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4296  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  64.29 
 
 		 68 aa  72  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0157597  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3359  zinc finger CDGSH-type domain protein  62.5 
 
 		 74 aa  72  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1040  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  53.97 
 
 		 81 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2450  zinc finger CDGSH-type domain protein  58.93 
 
 		 72 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000296222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4940  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  57.63 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5219  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  57.63 
 
 		 75 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00747207 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5790  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  60.78 
 
 		 69 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6636  zinc finger CDGSH-type domain protein  61.7 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.101492 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11410  iron-binding zinc finger protein, CDGSH type  54.39 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4406  hypothetical protein  42.31 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00107323  normal  0.281597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3589  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  45.1 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.558971  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1437  protein of unknown function DUF1271  44.68 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781813  normal  0.13067 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2308  zinc finger CDGSH-type domain protein  65.79 
 
 		 55 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000604897  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1683  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  47.37 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.362742 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2069  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  42.11 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13110  iron-binding zinc finger protein, CDGSH type  41.18 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3395  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  44.68 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0622  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  39.29 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.507556 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0466  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  40.74 
 
 		 77 aa  44.7  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.336392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2298  hypothetical protein  44.44 
 
 		 241 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.561327 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0856  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  27.87 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2809  zinc finger CDGSH-type domain protein  39.34 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3158  zinc finger CDGSH-type domain protein  39.34 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868245 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2912  hypothetical protein  37.7 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.213928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0145  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  40.91 
 
 		 236 aa  42.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3576  hypothetical protein  43.48 
 
 		 256 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.327098  normal  0.196355 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2798  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  42.55 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.755848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5171  hypothetical protein  37.68 
 
 		 594 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00324172 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5202  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  32.08 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2272  hypothetical protein  36.21 
 
 		 211 aa  41.6  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>