18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5219 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_4940  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  98.67 
 
 
75 aa  151  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514942  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5219  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  100 
 
 
75 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00747207 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1040  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  73.53 
 
 
81 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4296  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  71.43 
 
 
68 aa  95.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0157597  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5790  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  82.69 
 
 
69 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11410  iron-binding zinc finger protein, CDGSH type  62.71 
 
 
71 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2450  zinc finger CDGSH-type domain protein  65 
 
 
72 aa  80.1  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000296222  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3468  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  57.63 
 
 
71 aa  70.9  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6636  zinc finger CDGSH-type domain protein  61.22 
 
 
59 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.101492 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3359  zinc finger CDGSH-type domain protein  55.36 
 
 
74 aa  62.8  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2308  zinc finger CDGSH-type domain protein  58.33 
 
 
55 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000604897  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1683  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  44.44 
 
 
76 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.362742 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5202  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  29.63 
 
 
66 aa  44.3  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3395  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  35.85 
 
 
104 aa  43.5  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4406  hypothetical protein  37.74 
 
 
74 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00107323  normal  0.281597 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13110  iron-binding zinc finger protein, CDGSH type  36.54 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0466  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  37.93 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.336392  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2298  hypothetical protein  45.45 
 
 
241 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.561327 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>