18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3359 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3359  zinc finger CDGSH-type domain protein  100 
 
 		 74 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3468  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  63.93 
 
 		 71 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4296  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  59.38 
 
 		 68 aa  69.7  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0157597  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2450  zinc finger CDGSH-type domain protein  58.62 
 
 		 72 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000296222  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1040  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  47.3 
 
 		 81 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6636  zinc finger CDGSH-type domain protein  68.09 
 
 		 59 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.101492 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5790  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  61.7 
 
 		 69 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4940  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  55.36 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5219  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  55.36 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00747207 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11410  iron-binding zinc finger protein, CDGSH type  53.33 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3589  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  38.36 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.558971  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0466  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  44.44 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.336392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4406  hypothetical protein  35 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00107323  normal  0.281597 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2308  zinc finger CDGSH-type domain protein  58.82 
 
 		 55 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000604897  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13110  iron-binding zinc finger protein, CDGSH type  41.3 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1683  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  38.98 
 
 		 76 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.362742 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3395  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  37.29 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2069  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  41.3 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>