22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_18930 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_18930  iron-binding zinc finger protein, CDGSH type  100 
 
 
77 aa  153  9e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.606018  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13110  iron-binding zinc finger protein, CDGSH type  49.23 
 
 
104 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3589  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  47.62 
 
 
84 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.558971  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0466  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  50 
 
 
77 aa  55.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.336392  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2069  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  51.85 
 
 
146 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3395  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  39.71 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2269  zinc finger CDGSH-type domain protein  35.85 
 
 
70 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3258  Zinc finger, CDGSH-type  36.23 
 
 
86 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.167004  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0871  protein of unknown function DUF1271  40.35 
 
 
599 aa  41.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207432  normal  0.190699 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2450  zinc finger CDGSH-type domain protein  42.55 
 
 
72 aa  41.2  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000296222  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1178  protein of unknown function DUF1271  45.45 
 
 
233 aa  41.6  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.25383  normal  0.606867 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4177  hypothetical protein  29.31 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3863  hypothetical protein  29.31 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3849  hypothetical protein  29.31 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4016  hypothetical protein  29.31 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2912  hypothetical protein  35.71 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.213928  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4132  hypothetical protein  31.48 
 
 
68 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.623958 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1019  hypothetical protein  31.48 
 
 
68 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4218  hypothetical protein  31.48 
 
 
68 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4241  hypothetical protein  31.48 
 
 
68 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4330  hypothetical protein  32.08 
 
 
88 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3940  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  29.31 
 
 
80 aa  40  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>