More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0546 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0546  aminotransferase class V  100 
 
 		 400 aa  790    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0396718  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21090  cysteine desulfurase family protein  61.56 
 
 		 392 aa  414  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.14044 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0188  aminotransferase class V  55.11 
 
 		 382 aa  366  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1225  cysteine desulfurase  53.57 
 
 		 414 aa  342  9e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.738138  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2865  cysteine desulfurase  53.57 
 
 		 373 aa  342  9e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1568  cysteine desulfurase  53.3 
 
 		 373 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0379  cysteine desulfurase  53.3 
 
 		 373 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1755  cysteine desulfurase  53.3 
 
 		 373 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.983783  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0422  cysteine desulfurase  53.3 
 
 		 373 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0624  aminotransferase, class V  50.27 
 
 		 385 aa  321  9.999999999999999e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292698 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2179  cysteine desulfurase  44.38 
 
 		 373 aa  317  2e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  50.27 
 
 		 1143 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  48.12 
 
 		 388 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  45.16 
 
 		 392 aa  311  2e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  46.17 
 
 		 414 aa  310  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  44.62 
 
 		 384 aa  309  5e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2808  aminotransferase, class V  47.31 
 
 		 379 aa  309  6.999999999999999e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  48.64 
 
 		 403 aa  308  8e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  47.89 
 
 		 436 aa  308  9e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  47.89 
 
 		 436 aa  308  9e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  44.62 
 
 		 384 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  51.77 
 
 		 1139 aa  305  6e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  48.64 
 
 		 403 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  44.8 
 
 		 383 aa  306  6e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  47.59 
 
 		 400 aa  305  7e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  46.28 
 
 		 382 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  45.19 
 
 		 400 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  43.39 
 
 		 405 aa  302  7.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  43.43 
 
 		 405 aa  300  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  44.3 
 
 		 403 aa  301  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  46.87 
 
 		 400 aa  299  6e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  48.66 
 
 		 404 aa  298  8e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  45.84 
 
 		 399 aa  298  1e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  43.78 
 
 		 407 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  46.24 
 
 		 389 aa  297  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  43.52 
 
 		 407 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  43.52 
 
 		 407 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  43.52 
 
 		 407 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  43.52 
 
 		 407 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  43.52 
 
 		 407 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  45.82 
 
 		 403 aa  296  3e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  45.14 
 
 		 380 aa  296  3e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  43.52 
 
 		 407 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  46.28 
 
 		 400 aa  296  4e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  43.67 
 
 		 407 aa  296  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  43.01 
 
 		 407 aa  296  6e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  43.26 
 
 		 406 aa  296  6e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  45.21 
 
 		 417 aa  296  6e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  42.75 
 
 		 407 aa  295  7e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  43.41 
 
 		 407 aa  295  9e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  43.41 
 
 		 407 aa  295  9e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  43.41 
 
 		 407 aa  295  9e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  43.26 
 
 		 407 aa  295  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  46.79 
 
 		 379 aa  295  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  46.89 
 
 		 396 aa  294  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  43.15 
 
 		 407 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0907  aminotransferase, class V  46.88 
 
 		 383 aa  293  3e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000245321  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  43.15 
 
 		 407 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  42.86 
 
 		 507 aa  293  4e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  45.89 
 
 		 405 aa  293  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  46.81 
 
 		 389 aa  293  4e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  43.15 
 
 		 407 aa  293  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  45.26 
 
 		 398 aa  293  4e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  42.82 
 
 		 395 aa  293  4e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  46.81 
 
 		 389 aa  292  8e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  42.23 
 
 		 405 aa  292  8e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  42.23 
 
 		 405 aa  292  8e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  47.12 
 
 		 384 aa  292  9e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  45.19 
 
 		 403 aa  291  1e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  47.98 
 
 		 393 aa  291  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  45.16 
 
 		 383 aa  291  2e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2558  cysteine desulfurase NifS  46.03 
 
 		 388 aa  290  2e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.947611  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1132  cysteine desulfurase  42.42 
 
 		 404 aa  290  3e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  45.16 
 
 		 383 aa  290  4e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  45.26 
 
 		 398 aa  290  4e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  49.19 
 
 		 394 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  46.26 
 
 		 391 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  42.49 
 
 		 407 aa  289  6e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  49.34 
 
 		 1135 aa  289  6e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  47.04 
 
 		 401 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  43.82 
 
 		 394 aa  288  1e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  47.79 
 
 		 409 aa  288  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_006686  CND05560  cysteine desulfhydrase, putative  43.8 
 
 		 502 aa  287  2e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1950  cysteine desulfurase IscS  44 
 
 		 405 aa  287  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000843977  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  43.97 
 
 		 398 aa  288  2e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  44.96 
 
 		 402 aa  287  2e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  43.36 
 
 		 398 aa  287  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  43.36 
 
 		 398 aa  287  2e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1063  aminotransferase class V  44.56 
 
 		 388 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0592  cysteine desulfurase  48.2 
 
 		 404 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  45.11 
 
 		 386 aa  286  4e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2424  cysteine desulfurase  43.04 
 
 		 404 aa  286  4e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  45.99 
 
 		 401 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  43.01 
 
 		 405 aa  286  5e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  45.99 
 
 		 401 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1458  cysteine desulfurase  42.52 
 
 		 404 aa  286  5e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0627  cysteine desulfurase  47.94 
 
 		 404 aa  286  5e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  46.51 
 
 		 391 aa  286  5.999999999999999e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2178  cysteine desulfurase IscS  44.12 
 
 		 405 aa  286  7e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000963732  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0629  cysteine desulfurase  40.57 
 
 		 410 aa  285  8e-76  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>