57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0137 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0137  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 276 aa  550  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1719  hypothetical protein  63.53 
 
 		 293 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2423  xylose isomerase domain-containing protein  62.03 
 
 		 285 aa  335  5e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0964314  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2177  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  60.15 
 
 		 279 aa  309  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000702324 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06440  sugar phosphate isomerase/epimerase  58.89 
 
 		 300 aa  308  8e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2019  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  61.65 
 
 		 290 aa  304  8.000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.834913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4007  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  56.55 
 
 		 269 aa  298  7e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6726  putative endonuclease protein  54.35 
 
 		 285 aa  293  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3367  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  56.98 
 
 		 298 aa  291  6e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0558916 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1079  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  54.89 
 
 		 266 aa  273  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29070  sugar phosphate isomerase/epimerase  54.34 
 
 		 288 aa  267  1e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3334  xylose isomerase domain-containing protein  52.77 
 
 		 277 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4340  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  50.92 
 
 		 276 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2281  hitchhiker  0.0000101278 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0895  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  53.87 
 
 		 298 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0606369  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2459  xylose isomerase domain-containing protein  52.26 
 
 		 292 aa  256  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0140499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4011  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  49.45 
 
 		 276 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2853  xylose isomerase domain-containing protein  51.12 
 
 		 274 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3593  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  48.31 
 
 		 265 aa  221  7e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244317  normal  0.215314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4760  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  44.09 
 
 		 274 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.362033  normal  0.0199285 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2882  xylose isomerase domain-containing protein  45.42 
 
 		 276 aa  212  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1107  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.48 
 
 		 273 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0615  xylose isomerase domain-containing protein  44.25 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1856  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  43.57 
 
 		 292 aa  205  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4176  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  42.54 
 
 		 394 aa  202  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346853  hitchhiker  0.000695283 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6262  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.92 
 
 		 278 aa  198  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689378  normal  0.603305 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4583  xylose isomerase domain-containing protein  36.54 
 
 		 278 aa  195  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04037  hypothetical protein  41.22 
 
 		 280 aa  192  5e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0687839  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04075  conserved hypothetical protein  41.22 
 
 		 280 aa  192  5e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0808004  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4680  AP endonuclease  41.6 
 
 		 280 aa  192  6e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.110375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4771  AP endonuclease  41.22 
 
 		 280 aa  191  8e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000229139  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3803  xylose isomerase domain-containing protein  41.22 
 
 		 280 aa  191  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465718  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4453  AP endonuclease  41.22 
 
 		 280 aa  191  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000121679  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  41.02 
 
 		 296 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  42.47 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2394  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.24 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.515446  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  27.03 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4228  xylose isomerase domain-containing protein  30.83 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3371  Hydroxypyruvate isomerase  29.02 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.55933  normal  0.171039 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3671  putative D-tagatose 3-epimerase  29.56 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3406  xylose isomerase domain-containing protein  28.48 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784337 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0820  xylose isomerase domain-containing protein  25.75 
 
 		 278 aa  50.1  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4709  myo-inositol catabolism protein  27.04 
 
 		 277 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0492702  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2495  xylose isomerase domain-containing protein  28.57 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3597  xylose isomerase domain-containing protein  29.84 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.791675  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4652  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  29.5 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4079  xylose isomerase domain-containing protein  28.81 
 
 		 629 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.41 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.787534  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3855  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.51 
 
 		 624 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0782  xylose isomerase domain-containing protein  26.22 
 
 		 289 aa  47  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5952  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  26.16 
 
 		 631 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0955687  decreased coverage  0.00791612 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0418  xylose isomerase domain-containing protein  27.13 
 
 		 635 aa  44.3  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3269  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.1 
 
 		 303 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0504  xylose isomerase domain-containing protein  25.86 
 
 		 270 aa  43.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000275929  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1910  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.37 
 
 		 282 aa  43.5  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4472  Hydroxypyruvate isomerase  27.09 
 
 		 250 aa  43.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0435966  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7092  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  23.67 
 
 		 631 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2721  xylose isomerase domain-containing protein  26.16 
 
 		 280 aa  43.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543869  normal  0.780906 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>