51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0809 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0809  DoxD family protein  100 
 
 		 154 aa  302  1.0000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3395  DoxD family protein  63.38 
 
 		 156 aa  183  7e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2361  DoxX family protein  56.25 
 
 		 160 aa  157  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00355  NADH dehydrogenase  51.66 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002082  membrane protein  49.35 
 
 		 151 aa  140  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0941  DoxX family protein  52.67 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2957  hypothetical protein  65.77 
 
 		 155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2690  DoxX  51.26 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.360255  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0702  hypothetical protein  44.29 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0722  hypothetical protein  43.57 
 
 		 154 aa  100  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4399  DoxX family protein  43.36 
 
 		 156 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4289  DoxX family protein  43.36 
 
 		 156 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4788  DoxX  43.61 
 
 		 154 aa  93.6  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02374  hypothetical protein  40.91 
 
 		 162 aa  91.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.861023  normal  0.0466865 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0301  DoxX family protein  37.01 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3128  DoxX family protein  38.52 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4682  thiosulphate:quinone oxidoreductase (TQO) small subunit(DoxD domain)  44.35 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.864959 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0755  DoxX family protein  36.24 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1605  DoxX  36.92 
 
 		 175 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1240  DoxX  35 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1137  hypothetical protein  35.82 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6307  DoxX family protein  41.94 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188963  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3394  hypothetical protein  35.82 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2679  DoxX  34.09 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1002  hypothetical protein  35.19 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.527815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2030  DoxX family protein  37.76 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2032  hypothetical protein  33.58 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5936  DoxX family protein  29.45 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4649  DoxX  35.38 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0727  hypothetical protein  30.71 
 
 		 738 aa  57  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0707  hypothetical protein  29.13 
 
 		 738 aa  57  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0584  hypothetical protein  35.66 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399737  normal  0.684343 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0098  DoxD family protein/pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  39.13 
 
 		 752 aa  56.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0100  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.13 
 
 		 730 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1027  DoxX family protein  36.84 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0990  DoxX family protein  40.98 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2637  DoxX family protein  28.85 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.920826  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1432  DoxX family protein  34.81 
 
 		 175 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5146  DoxX family protein  31.85 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.535914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2188  DoxX family protein  38 
 
 		 155 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62019  normal  0.793728 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3068  DoxX family protein  37.74 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00512546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  30.2 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21600  hypothetical protein  37.27 
 
 		 196 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1839  hypothetical protein  37.27 
 
 		 196 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.780129  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1725  DoxX  27.62 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1303  DoxX family protein  31.82 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.279966 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3375  DoxX  29.17 
 
 		 171 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.239229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01645  DoxX  36.19 
 
 		 204 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0455186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  31.78 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  41.18 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  31.78 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>